| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP006881 | 2,199,567 | A→G | G34G (GGT→GGC) | U712_11020 ← | Nucleoside diphosphate kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP006881 | 2,199,567 | 0 | A | G | 99.0% | 332.5 / NA | 103 | G34G (GGT→GGC) | U712_11020 | Nucleoside diphosphate kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (46/56); minor base T (0/1); total (46/57) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
TTTTCGCCTTCCCAAACCATTGCGAATACAGGCCCTGAAGTAATAAACTCAACGAGCTCTCCGAAGAAAGGCTTCCCTTGATGTTCGGCGTAGTGTTTCTCAGCCATTTGTTCAGTCACTCTCATTAACTTGGCACCAGCTAATTGTAAGCCCTTACGTTCAAATCTGGATAAAATATCCCCAATGAGCTGACGTTGGACACCGTCTGGTTTCACCATGATAAAAGTCTTTTCCATCACATTCTCCACCCCATCATTATGTATGTATA > CP006881/2199433‑2199700 | ttttCGCCTTCCCACACCATTGCGAATACAGGTCCTGAAGTAATAAACTCAACGAGCTCTCCGAAGAAAGGCTTACCTTGATGTTCGGCGTAGTGTTTCTCAGCCATTTGTTCAGTCACTCTCATTAACTTGGCGCCAg > 5:15326/1‑139 (MQ=255)ttttCGCCTTCCCACACCATTGCGAATACAGGTCCTGAAGTAATAAACTCAACGAGCTCTCCGAAGAAAGGCTTACCTTGATGTTCGGCGTAGTGTTTCTCAGCCATTTGTTCAGTCACTCTCATTAACTTGGCGCCAg > 5:211322/1‑139 (MQ=255) tCGCCTTCCCACACCATTGCGAATACAGGTCCTGAAGTAATACACTCAACGAGCTCTCCGATGAAATGCTTACCTTGATGTTCGGCGTAGTGTTTCTCAGCCATTTGTTCAGTCACTCTCATTAACTTGGCGCCAGCt < 5:69464/138‑1 (MQ=255) tCGCCTTCCCACACCAATGCGAATACAGGTCCTGAAGTAATAAACTCAACGAGCTCTCCGACGAAAGGCTTACCTTGATGTTCGGCGTAGTGTTTCTCAGCCATTTGTTCAGTCACTCTCATTAACTTGGCGCCAGCt < 8:415192/138‑1 (MQ=255) 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ttGCGAATACAGGTCCTGAAGTAATAAACTCAACGAGCTCTCCGAAGAAAGGCTTACCTTGATGTTCGGCGTAGTGTTTCTCAGCCATTTGTTCAGTCACTCTCATTAACTTGGCGCCAGCTAATTGTAAGCCCTTACg > 6:434139/1‑139 (MQ=255) ttGCGAATACAGGTCCTGAAGTAATAAACTCAACGAGCTCTCCGAAGAAAGGCTTACCTTGATGTTCGGCGTAGTGTTTCTCAGCCATTTGTTCAGTCACTCTCATTAACTTGGCGCCAGCTAATTGTAAGCCCTTACg > 6:353739/1‑139 (MQ=255) tGCGAATACAGGTCCTGAAGTAATAAACTCAACGAGCTCTCCGAAGAAAGGCTTACCTTGATGTTCGGCGTAGTGTTTCTCAGCCATTTGTTCAGTCACTCTCATTAACTTGGCGCCAGCTAATTGTAAGCCCt > 4:170711/1‑134 (MQ=255) tGCGAATACAGGTCCTGAAGTAATAAACTCAACGAGCTCTCCGAAGAAAGGCTTACCTTGATGTTCGGCGTAGTGTTTCTCAGCCATTTGTTCAGTCACTCTCATTAACTTGGCGCCAGCTAATTGTAAGCCCt < 3:170711/134‑1 (MQ=255) tGCGAATACAGGTCCTGAAGTAATAAACTCAACGAGCTCTCCGAAGAAAGGCTTACCTTGATGTTCGGCGTAGTGTTTCTCAGCCATTTGTTCAGTCACTCTCATTAACTTGGCGCCAGCTAATTGTAAGCCCTTACGt > 7:149490/1‑139 (MQ=255) tGCGAATACAGGTCCTGAAGTAATAAACTCAACGAGCTCTCCGAAGAAAGGCTTACCTTGATGTTCGGCGTAGTGTTTCTCAGCCATTCGTTCAGTCACTCTCATTAACTTGGCGCCAGCTAATTGTAAGCCCTTACGt > 1:138536/1‑139 (MQ=255) 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aTTAACTTGGCGCCAGCTAATTGTAAGCCCTTACGTTCGAATCTAGATAAAATGTCCCCAATGAGCTGACGTTGGACACCGTCTGGTTTCACCATGATAAAAGTCTTTTCCATCATATTCTCCACCCCATCATtatgta > 5:362498/1‑139 (MQ=255) aTTAACTTGGCGCCAGCTAATTGTAAGCCCTTACGTTCGAATCTAGATAAAATGTCCCCAATGAGCTGACGTTGGACACCGTCTGGTTTCACCATGATAAAAGTCTTTTCCATCATATTCTCCACCCCATCATtatgta > 3:28664/1‑139 (MQ=255) aTTAACTTGGCGCCAGCTAATTGTAAGCCCTTACGTTCGAATCTAGATAAAATGTCCCCAATGAGCTGACGTTGGACACCGTCTGGTTTCACCATGATAAAAGTCTTTTCCATCATATTCTCCACCCCATCATtatgt < 3:347899/138‑1 (MQ=255) aTTAACTTGGCGCCAGCTAATTGTAAGCCCTTACGTTCGAATCTAGATAAAATGTCCCCAATGAGCTGACGTTGGACACCGTCTGGTTTCACCATGATAAAAGTCTTTTCCATCATATTCTCCACCCCATCATtatg < 1:15720/137‑1 (MQ=255) aTTAACTTGGCGCCAGCTAATTGTAAGCCCTTACGTTCGAATCTAGATAAAATGTCCCCAATGAGCTGACGTTGGACACCGTCTGGTTTCACCATGATAAAAGTCTTTTCCATCATATTCTCCACCCCATCATtatg > 2:12864/1‑137 (MQ=255) aTTAACTTGGCGCCAGCTAATTGTAAGCCCTTACGTTCGAATCTAGATAAAATGTCCCCAATGAGCTGACGTTGGACACCGTCTGGTTTCACCATGATAAAAGTCTTTTCCATCATATTCTCCACCCCATCATtatg < 1:12864/137‑1 (MQ=255) 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TTTTCGCCTTCCCAAACCATTGCGAATACAGGCCCTGAAGTAATAAACTCAACGAGCTCTCCGAAGAAAGGCTTCCCTTGATGTTCGGCGTAGTGTTTCTCAGCCATTTGTTCAGTCACTCTCATTAACTTGGCACCAGCTAATTGTAAGCCCTTACGTTCAAATCTGGATAAAATATCCCCAATGAGCTGACGTTGGACACCGTCTGGTTTCACCATGATAAAAGTCTTTTCCATCACATTCTCCACCCCATCATTATGTATGTATA > CP006881/2199433‑2199700 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |