Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 2,800,291 | C→T | intergenic (‑168/‑62) | U712_14425 ← / → U712_14430 | Citrate synthase 2/Hypothetical Protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 2,800,291 | 0 | C | T | 98.8% | 253.7 / NA | 81 | intergenic (‑168/‑62) | U712_14425/U712_14430 | Citrate synthase 2/Hypothetical Protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (32/48); minor base A (1/0); total (33/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.07e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AAGAGTGTTGTAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTATGAAAGAACATAACAAATTCTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTCCATTCTGTGATTTCCCCGAAAAAACGCCTTTATTTGCGGGTTTTTGCA > CP006881/2800158‑2800425 | aaGAGTGTTGTAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTtat < 5:306806/138‑1 (MQ=255) aaGAGTGTTGTAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTtat < 5:185313/138‑1 (MQ=255) gagTGTTGTAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAg < 5:53505/139‑1 (MQ=255) tgttgtAAAAACATGAGGCTAACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCt > 2:231890/1‑138 (MQ=255) ttgtAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAACCCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAt > 3:239614/1‑139 (MQ=255) ttgtAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAg < 6:35829/134‑1 (MQ=255) ttgtAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAg > 5:35829/1‑134 (MQ=255) ttgtAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAt > 7:210519/1‑139 (MQ=255) ttgtAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAt > 8:171463/1‑139 (MQ=255) ttgtAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAt > 3:253375/1‑139 (MQ=255) ttgtAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAt > 3:296377/1‑139 (MQ=255) gtAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAtt < 2:279329/138‑1 (MQ=255) tAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAACAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAttt < 5:372293/138‑1 (MQ=255) tAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAttt < 8:391646/138‑1 (MQ=255) tAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAttt < 5:299077/138‑1 (MQ=255) tAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAttt < 6:66785/138‑1 (MQ=255) tAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGAAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAttt < 3:278756/138‑1 (MQ=255) aaCATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAtttaagtt < 4:363028/139‑1 (MQ=255) aaCATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAtttaagtt < 4:18153/139‑1 (MQ=255) aaCATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAtttaagtt < 6:307326/139‑1 (MQ=255) aaCATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAtttaagtt < 8:210519/139‑1 (MQ=255) aaCATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAtttaagtt < 2:276167/139‑1 (MQ=255) aaCATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAtttaagtt < 5:96416/139‑1 (MQ=255) aTGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAtttaagtttaa < 4:379408/139‑1 (MQ=255) aTGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAtttaagttt > 8:214758/1‑137 (MQ=255) aGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGcc > 7:53787/1‑139 (MQ=255) tacttaAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATtc > 3:441980/1‑139 (MQ=255) acttaAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTCCTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATtct > 8:167521/1‑139 (MQ=255) acttaAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGTCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGATTTTGAAATAACATAACAAATTTTTATTAGATTATTTAAGTTTAAGCCTATtct > 3:286287/1‑139 (MQ=255) acttaAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTAtt < 4:441980/137‑1 (MQ=255) acttaAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATtc < 2:421841/138‑1 (MQ=255) cttaAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATtct > 6:204358/1‑138 (MQ=255) aaaaGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCAtt < 8:53787/138‑1 (MQ=255) aaaGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATtat < 7:252747/139‑1 (MQ=255) aaaGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATta > 5:170478/1‑138 (MQ=255) gCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATaaa < 8:330629/139‑1 (MQ=255) cACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAtttaagttt > 4:318327/1‑118 (MQ=255) cACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTAtttaagttt < 3:318327/118‑1 (MQ=255) gATGCAAGTAATTCTCTCCCCCACAAAGAAAATTCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATCTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACaat < 6:125215/139‑1 (MQ=255) aaGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCa < 5:119805/139‑1 (MQ=255) gTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGa < 5:28243/139‑1 (MQ=255) tttCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACTATAATCAGACAt < 5:134164/139‑1 (MQ=255) tttCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACa < 5:140895/138‑1 (MQ=255) tttCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACa < 2:30999/138‑1 (MQ=255) tttCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACa < 2:255108/138‑1 (MQ=255) tttCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACAt < 4:92110/139‑1 (MQ=255) tttCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACAt < 8:344032/139‑1 (MQ=255) tttCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACAt > 8:7934/1‑139 (MQ=255) tctctcCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTtat > 6:251538/1‑87 (MQ=255) tctctcCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTtat < 5:251538/87‑1 (MQ=255) ccccAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGtt < 3:342764/136‑1 (MQ=255) ccccAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGtt < 6:70450/136‑1 (MQ=255) ccccAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGtt < 8:378151/136‑1 (MQ=255) ccccAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTaaa > 1:45225/1‑139 (MQ=255) ccccAAAAAGAAAATGCATACATTTTACTGGCTGCTGCAACATAATCCCTATGCTTTTGAAAGAACATAACATATTATTATTAGCTTATTTAAGATTAAGCCTAATCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTaaa > 7:19369/1‑139 (MQ=255) acccAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTaaa > 5:60520/2‑139 (MQ=255) aaTGCATACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTtat > 3:206425/1‑69 (MQ=255) aaTGCATACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTtat < 4:206425/69‑1 (MQ=255) cATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGtt > 6:48037/1‑116 (MQ=255) cATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGtt < 5:48037/116‑1 (MQ=255) ttACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAAGATAACAAATTTTTATAAGCTTAATTAAGTTTAAGACTATTCTAATTATTATCAATAATCTGAGATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑tttttttttt < 8:108591/138‑1 (MQ=255) tACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTACAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTc > 3:234123/1‑138 (MQ=255) aCTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTcc < 3:152389/138‑1 (MQ=255) cTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTCCa < 7:171463/138‑1 (MQ=255) gctgctGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGt > 2:234336/1‑112 (MQ=255) gctgctGGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGt < 1:234336/112‑1 (MQ=255) ctgGAACTAAAACCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTGCAttgggtgc > 8:391251/1‑133 (MQ=255) aaCCCTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTCCATTCTGTGATTTCCCCGa > 5:54044/1‑138 (MQ=255) ccTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTCCATTCTGTGATTTCCCCGaaaaa < 2:342288/139‑1 (MQ=255) cTTTGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTCCATTCTGTGATTTCCCCGaaaaaa > 5:46527/1‑139 (MQ=255) tGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTCCATTCTGTGATTTCCCCGAAAAACCGc > 5:143903/1‑139 (MQ=255) tGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTCCATTCTGTGATTTCCCCGAAAAAACGc > 8:43402/1‑139 (MQ=255) tGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTCCATTCTGTGATTTCCCCGAAAAAACGc > 8:441248/1‑139 (MQ=255) tGCTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTCCATTCTGTGATTTCCCCGAAAAAACGc > 1:396037/1‑139 (MQ=255) cTTTTGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTCCATTCTGTGATTTCCCCGAAAAAACGCCt < 7:214758/139‑1 (MQ=255) tGAAAGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTCCATTCTGTGATTTCCCCGAAAAAACGCCTTTAt > 4:71397/1‑139 (MQ=255) aGAACATAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTTCATTCTGTGATTTCCCCGAAAAAACGCCTTTATTTGc < 3:116155/139‑1 (MQ=255) tAACAAATTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTCCATTCTGTGATTTCCCCGAAAAAACGCCTTTATTTGCGGGttt < 1:231890/139‑1 (MQ=255) aaCAAATTTTTATAAGCTTAATTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAAAAATAATAAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAATTTTTTTTTTTCCATTCTGTGATTTCCCCGAAAAAACGCCTTTATTTGCGGGttt < 4:239614/139‑1 (MQ=255) aaTTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTCCATTCTGTGATTTCCCCGAAAAAACGCCTTTATTTGCGGGTTTTTGCa < 7:323251/139‑1 (MQ=255) aTTTTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTCCATTCTGTGATTTCCCCGAAAAAACGCCTTTATTTGCGGGTTTTTGCa > 4:385059/1‑138 (MQ=255) | AAGAGTGTTGTAAAAACATGAGGCTTACTTAAAAAGCACGATGCAAGTATTTCTCTCCCCCAAAAAGAAAATGCTTACATTTTACTGGCTGCTGGAACTAAAACCCTTTGCTTATGAAAGAACATAACAAATTCTTATAAGCTTATTTAAGTTTAAGCCTATTCTCATTATAAACAATAATCAGACATTTGTTAAATGTTTACCTATAA‑TTTTTTTTTTCCATTCTGTGATTTCCCCGAAAAAACGCCTTTATTTGCGGGTTTTTGCA > CP006881/2800158‑2800425 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |