Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 3,722,734 | T→A | V51V (GTA→GTT) | U712_19190 ← | PTS system sucrose‑specific EIIBC component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 3,722,734 | 0 | T | A | 97.8% | 289.2 / ‑4.4 | 93 | V51V (GTA→GTT) | U712_19190 | PTS system sucrose‑specific EIIBC component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base A (46/44); total (47/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGCATCCTGGTGATTTACGTGTTCTTCACGCTCAGTATCAGCTTCCTTAGAAAAAGCATCGTACACCTTATTGACAAGGCCTGTTCCGAAAATAATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCGCCTTTTACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATGTTTTCTTTTCCCCCGAGAAGTTCAATGAGGCGTTTTGCA > CP006881/3722605‑3722869 | cgcATCCTGATGATTGACGTGTTCTTCACGCTCGATATCAGCTTCTTTAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCa < 4:62107/138‑1 (MQ=255) cATCCTGATGATTGACGTGTTCTTCACGCTCGATATCAGCTTCTTTAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAg < 6:225846/139‑1 (MQ=255) aTCCTGATGATTGACGTGTTCTTCACGCTCGATATCAGCTTCTTTAGTACAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGc < 6:147855/139‑1 (MQ=255) aTCCTGATGATTGACGTGTTCTTCACGCTCGATATCAGCTTCTTTAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGc < 7:247163/139‑1 (MQ=255) aTCCTGATGATTGACGTGTTCTTCACGCTCGATATCAGCTTCTTTAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGc < 3:93485/139‑1 (MQ=255) cTGATGATTGACGTGTTCTTCACGCTCGATATCAGCTTCTTTAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGctct < 3:98857/139‑1 (MQ=255) atGATTGACGTGTTCTTCACGCTCGATATCAGCTTCTTTAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCtctt < 2:62959/136‑1 (MQ=255) aCGGGTTCTTCACGCTCGATATCAGCTTCTTTAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCGGAAAGCCCCTTTACCGCCATCAAGCTCTTCTACTtgtg > 3:139431/1‑139 (MQ=255) cttcACGCTCGATATCAGCTTCTTTAGAAAAGGCATCGTATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGat < 3:338315/138‑1 (MQ=255) cttcACGCTCGATATCAGCTTCTTTAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGat < 3:393704/138‑1 (MQ=255) cttcACGCTCGATATCAGCTTCTTTAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGat > 4:393704/1‑138 (MQ=255) cACGCTCGATATCAGCTTCTTTAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCACTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGGTTGatc < 5:52606/136‑1 (MQ=255) atATCAGCTTCTTTAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGat < 5:139698/126‑1 (MQ=255) atATCAGCTTCTTTAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGat > 6:139698/2‑127 (MQ=255) atATCAGCTTCTTTAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGAtt < 4:35280/138‑1 (MQ=255) tCAGCTTCTTTAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCa < 4:121375/138‑1 (MQ=255) tctttAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACg > 6:162298/4‑90 (MQ=255) tctttAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACg < 5:162298/87‑1 (MQ=255) ctttAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTtca < 5:86108/136‑1 (MQ=255) tttAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTtcat > 6:150514/2‑138 (MQ=255) tAGAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTtcatc < 7:310166/137‑1 (MQ=255) gAAAAGGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACt < 7:21541/138‑1 (MQ=255) aaaagGCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTa > 8:263564/1‑138 (MQ=255) aggCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACg < 8:404237/137‑1 (MQ=255) gCATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACg > 2:386146/1‑137 (MQ=255) cATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAg < 6:161498/139‑1 (MQ=255) cATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAg < 1:13335/139‑1 (MQ=255) cATCGAATACTTTATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAg < 7:78677/139‑1 (MQ=255) tactttATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCttgtt < 7:51764/135‑1 (MQ=255) tttATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGca > 5:216603/2‑139 (MQ=255) tATTCACAAGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGcac > 2:122824/1‑138 (MQ=255) aaGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCa < 3:19348/64‑1 (MQ=255) aaGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCa > 4:19348/1‑64 (MQ=255) aaGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGcc > 3:194063/1‑139 (MQ=255) aaGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGcc > 8:374717/1‑139 (MQ=255) aaGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGcc > 1:409353/1‑139 (MQ=255) aaGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGcc > 8:243702/1‑139 (MQ=255) aGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCttgtt < 4:282646/126‑1 (MQ=255) aGGCCTGTTCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCttgtt > 3:282646/1‑126 (MQ=255) ggCCGGTTGCGAAAATGATCTGGGACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTCACGCCCTCAAGCGCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAACCGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCcgc < 8:335134/139‑1 (MQ=255) ttCCGAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGa > 3:193526/1‑138 (MQ=255) gAAAATGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAAta < 7:263564/139‑2 (MQ=255) aaaaTGATCTGGTACTGGCCAGATCTTCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATATTTGATTCATCTTTCATAACTAAACGAAGACTAGTTGCACAATGAGCAGCGCACATAAtat > 5:231691/1‑137 (MQ=255) aaaaTGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCa > 8:280318/1‑51 (MQ=255) aaaaTGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCa < 7:280318/51‑1 (MQ=255) aaaaTGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTaaa > 7:437943/1‑102 (MQ=255) aaaaTGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTaaa < 8:437943/102‑1 (MQ=255) aaaTGATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTAGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATAtt < 4:402719/139‑1 (MQ=255) gatCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATAttttct > 1:282098/2‑139 (MQ=255) gatCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGGGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTACACGCAGTCTTGTTGCAGAATGAGCGGCGGTTATAATAttttgt > 5:281257/2‑137 (MQ=255) gatCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGACATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATAttttct > 2:289299/2‑139 (MQ=255) tCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAACCGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATAttttctt > 2:177480/1‑138 (MQ=255) ggaCTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCACTTTAACGCCAGCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCAGCGCGGATAATATTTTCTTTccct < 4:139431/137‑2 (MQ=255) gTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATAttttctttcc < 7:127158/137‑3 (MQ=255) gTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATAttttctt < 2:409353/134‑1 (MQ=255) cTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCcctcc > 2:134349/1‑138 (MQ=255) gCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACg < 4:410142/87‑1 (MQ=255) gCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACg > 3:410142/1‑87 (MQ=255) gCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCtt < 8:74550/94‑1 (MQ=255) gCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCtt > 7:74550/1‑94 (MQ=255) gCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCgag > 7:302670/1‑138 (MQ=255) gCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCgag > 6:29979/1‑138 (MQ=255) gCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCgag > 1:41503/1‑138 (MQ=255) gCCAGAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGAGTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGCTAATATTTTCTTTCACTCCgag > 4:316245/1‑138 (MQ=255) gCCAAAGCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCgag > 2:25662/1‑138 (MQ=255) caaagCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCGAGAAg < 1:25662/136‑1 (MQ=255) agCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGc > 4:174614/1‑46 (MQ=255) agCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGc < 3:174614/46‑1 (MQ=255) agCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAAta < 2:413367/116‑2 (MQ=255) agCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAAta > 1:413367/1‑115 (MQ=255) agCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCGAGAAgct > 2:40049/1‑136 (MQ=255) agCTGCTGAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTAGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTATTGTTGAACAATGAGCCGCGCTGATAATATATTCTTTCCCTCCGAGAAgct > 8:277237/1‑136 (MQ=255) ctgAAAGCGCCTTTTACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAg < 2:222051/80‑1 (MQ=255) ctgAAAGCGCCTTTTACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAg > 1:222051/1‑80 (MQ=255) ctgAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGat < 3:319913/46‑1 (MQ=255) ctgAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGat > 4:319913/1‑46 (MQ=255) ctgAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCttgttg > 5:197185/1‑88 (MQ=255) ctgAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCttgttg < 6:197185/88‑1 (MQ=255) ctgAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATTAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCGAGAAGCTCAAt > 8:438659/1‑137 (MQ=255) ctgAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCcgc > 2:207544/1‑101 (MQ=255) ctgAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCcgc < 1:207544/101‑1 (MQ=255) ctgAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCGAGAAGCTCAAt > 1:17223/1‑137 (MQ=255) ctgAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCGAGAAGCTCAAt > 5:123704/1‑137 (MQ=255) ctgAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCGAGAAGCTCAAt > 5:436735/1‑137 (MQ=255) ctgAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCGAGAAGCTCAATg < 8:7201/138‑1 (MQ=255) ctgAAAGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCGAGAAGCTCAATg < 1:289299/138‑1 (MQ=255) taaGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCGAGAAGCTCAATGAg < 6:337539/136‑1 (MQ=255) aGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCGAGAAGCTCAATGAGGCGt > 1:62523/1‑139 (MQ=255) aGCCCCTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCGAGAAGCTCAATGAGGCGt > 2:62029/1‑139 (MQ=255) ccccTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTCAAAATATTTTCTTTCCCTCCGAGAAGCTCAATGAGTCGtat > 2:217621/3‑137 (MQ=255) gcTTTAACGCCATGAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATATATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACTGAGTCTTGTTGCACAATGAGGCGCGATGATAATATTTTCTTTCGCTCCGAGAAGCTCAATGAGGCGTTTTg < 6:231691/138‑1 (MQ=255) ccTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTTATAATATTTTCTTTCCCTCCGAGAAGCTCAATGAGGCGTTTTg < 7:438659/139‑1 (MQ=255) cTTTAACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCGTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCGAGAAGCTCAATGAGGCGTTTTg > 3:200155/1‑138 (MQ=255) tttaACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATATTTTCTTTCCCTCCGAGAACCTCAATGAGGCGTTTTGCa > 3:12222/1‑139 (MQ=255) | TGCATCCTGGTGATTTACGTGTTCTTCACGCTCAGTATCAGCTTCCTTAGAAAAAGCATCGTACACCTTATTGACAAGGCCTGTTCCGAAAATAATCTGGTACTGGCCAGAGCTGCTGAAAGCGCCTTTTACGCCATCAAGCTCTTCTACTTGTGCTTGATCTATCTTTGATTCATCTTTCATCACTAAACGCAGTCTTGTTGCACAATGAGCCGCGCTGATAATGTTTTCTTTTCCCCCGAGAAGTTCAATGAGGCGTTTTGCA > CP006881/3722605‑3722869 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |