| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,175,815 | T→C | A83A (GCA→GCG) | U712_10880 ← | putative glycosyltransferase ypjH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,175,815 | 0 | T | C | 97.9% | 457.0 / ‑2.2 | 145 | A83A (GCA→GCG) | U712_10880 | putative glycosyltransferase ypjH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/2); new base C (66/76); total (67/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.03e-01 | |||||||||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
AACACCGTGATATCCGTGCCATGCAAAGTTGTCACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATCTGCTTTGCAAGATAGGCACAAACCGCATGCGGAAGAGCGTAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCTGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCGTATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGGTGATATGTATTTAGTCTAAACGGAATGCTTGACG > CP006881/2175681‑2175948 | cagTGATATCCGTGCCATGCAAAGTCGTAACAATGCCGATATTGCGTTACACCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCt > 5:85406/3‑138 (MQ=255) cGTGATATCCGTGCCATGCAAAGTGGTAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCt > 3:47744/1‑137 (MQ=255) tGATATCCGTGCCATGCAAAGTGGTAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTc < 3:219993/136‑1 (MQ=255) tGATATCCGTGCCATGCAAAGTGGTAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGc > 6:191855/1‑139 (MQ=255) tGATATCCGTGCCATGCAAAGTGGTAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGc > 1:277887/1‑139 (MQ=255) tGATATCCGTGCCATGCAAAGTGGTAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGc > 5:358486/1‑139 (MQ=255) tGATATCCGTGCCATGCAAAGTGGTAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGc > 2:166437/1‑139 (MQ=255) tGATATCCGTGCCATGCAAAGTGGAAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGTCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGc > 3:74222/1‑139 (MQ=255) tGATATCCGTGCCAGTCAAAGTGGTCACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTCTTATGCAAGATAGGCGCACACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAg > 6:139803/1‑138 (MQ=255) gATATCCGTGCCATGCAAAGTGGTAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGc > 4:445578/1‑138 (MQ=255) gTGCCATGCAAAGTGGTAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTttgc > 2:63089/1‑139 (MQ=255) gTGCCATGCAAAGTGGTAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTttgc < 3:285620/139‑1 (MQ=255) gTGCCATGCAAAGTGGTAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTttgc > 7:83942/1‑139 (MQ=255) gTGCCATGCAAAGTCGTAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTttgc > 7:399249/1‑139 (MQ=255) tGCCATGCAAAGTGGTAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTttgct > 6:422221/1‑139 (MQ=255) gCCATGCAAAGTGGTAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTttgctt > 8:372588/1‑139 (MQ=255) tGCAAAGTGGTAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGcc > 4:64732/1‑138 (MQ=255) aGTGGTAACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTc < 4:41501/139‑1 (MQ=255) gtaacaATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAAt < 3:106976/136‑1 (MQ=255) taacaATGCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAAt > 2:172539/3‑138 (MQ=255) aTGCCGATATTGCTTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGGTTGCCAATGTCAAATCATACg < 8:17893/139‑1 (MQ=255) gCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAACTTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCACATCATACg > 5:259575/1‑137 (MQ=255) gCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACg > 8:273083/1‑137 (MQ=255) gCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACg > 3:350994/1‑137 (MQ=255) gCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACg > 5:68318/1‑137 (MQ=255) gCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACg > 7:269591/1‑137 (MQ=255) gCCGATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACg > 8:4841/1‑137 (MQ=255) gATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACggagga < 1:253654/139‑1 (MQ=255) gATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACggagga < 3:196307/139‑1 (MQ=255) gATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACggagga < 2:278067/139‑1 (MQ=255) gATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACggagga < 1:63089/139‑1 (MQ=255) gATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACggagga < 3:298207/139‑1 (MQ=255) gATATTGCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACggagga < 7:4841/139‑1 (MQ=255) gCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACtt > 5:394898/1‑138 (MQ=255) gCGTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACtt < 3:276421/138‑1 (MQ=255) gTTTCAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTaa > 1:428759/1‑138 (MQ=255) tCAGCATTTGTTTTGCAAGAGAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTaaaaa < 4:260355/138‑1 (MQ=255) cAGCATTTGTTTTGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTaaaaa > 7:10219/1‑137 (MQ=255) tttgttttGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACCGCATa > 8:318042/6‑139 (MQ=255) ttttGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGa < 7:273083/138‑1 (MQ=255) ttGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGAt > 2:194141/1‑138 (MQ=255) tGCAAGATAGGCGCAAACGGCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGAtt < 1:83868/138‑1 (MQ=255) gCATGCTGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAAt < 3:64732/139‑1 (MQ=255) gCATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAAt < 2:428759/139‑1 (MQ=255) cATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGcc > 6:397044/1‑74 (MQ=255) cATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGcc < 5:397044/74‑1 (MQ=255) cATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACggagga > 6:179628/1‑95 (MQ=255) cATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACggagga < 5:179628/95‑1 (MQ=255) cATGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAAt > 4:179762/1‑138 (MQ=255) cATGCGGAAGAGCGTAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCTGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCGTATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATg < 3:222864/139‑1 (MQ=255) aTGCGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGa < 6:394898/139‑1 (MQ=255) cGGGAGAGCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAata < 1:172539/139‑1 (MQ=255) gggagagCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAatat > 1:324867/4‑139 (MQ=255) ggagagCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATAtt < 4:350994/137‑1 (MQ=255) gagCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTggg < 6:358486/139‑1 (MQ=255) gagCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTggg < 2:318844/139‑1 (MQ=255) gagCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTggg < 2:324867/139‑1 (MQ=255) gagCATAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTggg < 3:432641/139‑1 (MQ=255) gcatAGTGATCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTgggat < 2:66340/136‑3 (MQ=255) gcatAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTgggat < 1:194141/136‑3 (MQ=255) gcatAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTgggat < 6:5632/136‑3 (MQ=255) gcatAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTgggat < 1:166437/136‑3 (MQ=255) gcatAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTgggat < 5:419424/136‑3 (MQ=255) gcatAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTgggat < 1:34770/136‑3 (MQ=255) catAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTgggat < 3:179762/136‑3 (MQ=255) aGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATa > 4:229927/1‑73 (MQ=255) aGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATa < 3:229927/73‑1 (MQ=255) tGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATg > 2:294207/1‑139 (MQ=255) aGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTa > 3:53769/1‑139 (MQ=255) cATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTgggat > 5:52143/1‑127 (MQ=255) cATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTgggat < 6:52143/129‑3 (MQ=255) cATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTAtt > 7:123714/1‑139 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7:372588/138‑1 (MQ=255) aTGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTa > 4:97098/1‑138 (MQ=255) aTGTCTAAATTCTCCCGTTCCGACACCTCAGCGATTTTGATTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACACCATATTGATTAAACTCAAATTCATTAAAAAGAATATTCGGAATATATGTATTCAGTCTa > 6:135467/1‑138 (MQ=255) tGTCTAAATTCTCCCGTTCTGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACggagga > 8:161884/1‑65 (MQ=255) tGTCTAAATTCTCCCGTTCTGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACggagga < 7:161884/65‑1 (MQ=255) tGTCTAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTaaa > 5:208075/1‑139 (MQ=255) tAAATTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTgggat > 1:98972/1‑114 (MQ=255) aaaTTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGaa > 4:298187/1‑139 (MQ=255) aaTTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACgg < 5:422221/136‑1 (MQ=255) aaTTCTCCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGa < 2:400879/137‑1 (MQ=255) tcCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTaaaaa > 1:440509/1‑64 (MQ=255) tcCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTaaaaa < 2:440509/64‑1 (MQ=255) tcCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGAtt < 4:422174/77‑1 (MQ=255) tcCCGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGAtt > 3:422174/1‑77 (MQ=255) ccGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGat < 7:335190/139‑2 (MQ=255) cGTTCCGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGatg < 6:68318/139‑3 (MQ=255) | AACACCGTGATATCCGTGCCATGCAAAGTTGTCACAATGCCGATATTGCGTTTCAGCATCTGCTTTGCAAGATAGGCACAAACCGCATGCGGAAGAGCGTAGTGAGCATGGATAATGTCTAAATTCTCCCGTTCTGCCACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCGTATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGGTGATATGTATTTAGTCTAAACGGAATGCTTGACG > CP006881/2175681‑2175948 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |