Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 2,175,953 | A→G | F37F (TTT→TTC) | U712_10880 ← | putative glycosyltransferase ypjH |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 2,175,953 | 0 | A | G | 99.1% | 356.2 / NA | 108 | F37F (TTT→TTC) | U712_10880 | putative glycosyltransferase ypjH |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (61/46); minor base T (1/0); total (62/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCGTATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGGTGATATGTATTTAGTCTAAACGGAATGCTTGACGTAATAAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCGAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCGACGCTCGGATAGCATGTGATCCCTATTTTTAGTTTTTTCATTGTTCGCCCCCAAGCACA > CP006881/2175818‑2176081 | gCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGAttt > 5:424419/1‑139 (MQ=255) gATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAATCGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCa < 4:344190/139‑1 (MQ=255) aTCAGACGGAGGCTACTTAAAAACAGCATAGTGATTCACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAcctgc < 8:351972/139‑1 (MQ=255) cGGAGGATACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTccc < 4:53769/138‑1 (MQ=255) ggaTACTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGtt < 2:360047/139‑1 (MQ=255) aCTTAAAAACAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGt > 7:411443/1‑139 (MQ=255) aaaaaCAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGc < 5:166377/138‑1 (MQ=255) aaaCAGCATATTGATTAAACTCAACATCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTACACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAAt < 8:399249/139‑1 (MQ=255) aaCAGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAAt > 6:296010/1‑138 (MQ=255) aGCATATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATa > 2:131492/1‑139 (MQ=255) ttAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTc > 8:208347/1‑139 (MQ=255) aaCCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATAcc < 4:195381/129‑1 (MQ=255) aaCCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATAcc > 3:195381/1‑129 (MQ=255) aaCCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCGTCACCAGTTCTGTCGCAATGATACGTGAGCCTcc > 2:376535/1‑138 (MQ=255) aCCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTccaa > 5:111349/1‑137 (MQ=255) aCCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTccaa < 6:111349/139‑3 (MQ=255) aaCTTCATGTAAATGAATATGGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGATTTCTAGATGTGATGAAATGGAGTTCATGTCCCTTTTCAGGAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCt < 5:139803/138‑1 (MQ=255) aaCTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCt < 3:298187/138‑1 (MQ=255) aaCTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCt < 8:411443/138‑1 (MQ=255) aCTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCg < 3:170079/139‑1 (MQ=255) aCTTCATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTCCATGTCCCTTTTCTGCAAGATGCTGCCCCAGTTCTGTCGCATTGATACCTGAGACGCCCAGGCTCg > 7:412410/1‑139 (MQ=255) cctGAAAATGAATAATGGGCAGATAAGTAGTCAGGCAAAACGGAATGCTTGCTGGGATGACATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGa < 6:259575/135‑1 (MQ=255) cATGAAAATGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGa > 1:349498/1‑137 (MQ=255) aaaTGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCAt < 5:191855/138‑1 (MQ=255) aTGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGa > 2:210995/1‑114 (MQ=255) aTGAATATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGa < 1:210995/114‑1 (MQ=255) aaTATTGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGAtt < 6:424419/139‑2 (MQ=255) tGGGATGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTAt > 2:238093/1‑139 (MQ=255) ggatGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTccaa > 4:118860/4‑110 (MQ=255) ggatGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTccaa < 3:118860/109‑3 (MQ=255) ggatGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATCTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCACCGCTCGGATAGCATGTGATTCCTAttt > 2:397485/4‑139 (MQ=255) tGATATGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTAtttt > 6:228739/1‑137 (MQ=255) atatGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCaa < 2:317115/65‑1 (MQ=255) atatGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCaa > 1:317115/1‑65 (MQ=255) atatGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGa < 5:269930/99‑1 (MQ=255) atatGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGa > 6:269930/1‑99 (MQ=255) atatGTATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGa > 1:396290/1‑125 (MQ=255) tATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTccc < 8:286528/70‑1 (MQ=255) tATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTccc > 7:286528/1‑70 (MQ=255) tATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGc < 1:121542/82‑1 (MQ=255) tATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGc > 2:121542/1‑82 (MQ=255) tATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGttttct < 4:284683/139‑3 (MQ=255) tATTCAGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGttttct > 2:363775/1‑137 (MQ=255) ttcaGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCCTGTCCC‑TTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAAGGCTACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTATCAt > 8:47701/4‑139 (MQ=255) ttcaGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCa > 4:176184/4‑139 (MQ=255) ttcaGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCa > 4:39135/4‑139 (MQ=255) ttcaGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCa > 8:121382/4‑139 (MQ=255) ttcaGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGATCTGTCGCAATGATACCTCAGCCTCCACCGCGCGCATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCa > 6:244789/4‑139 (MQ=255) caGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGa > 3:96111/2‑106 (MQ=255) caGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGa < 4:96111/105‑1 (MQ=255) aGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTg > 7:82534/1‑139 (MQ=255) aGTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTAATTg > 3:112684/1‑139 (MQ=255) gTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGt > 3:218775/1‑139 (MQ=255) gTCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGt > 5:224960/1‑139 (MQ=255) tCTAATCGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGtt < 7:208347/139‑1 (MQ=255) tCTAAACGGATTGCTTGATGTGATGAAATGGATTACATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTGTGTCGCATTGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTGTCATTGtt > 5:286573/1‑139 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATTAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGt > 1:313793/1‑138 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAgctgc < 3:198353/58‑1 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAgctgc > 4:198353/1‑58 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCt < 5:228021/99‑1 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCt > 6:228021/1‑99 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCa > 2:191972/1‑134 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCa < 1:191972/134‑1 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGtt > 7:260149/1‑139 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGtt > 6:358968/1‑139 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGtt > 8:247095/1‑139 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGtt > 7:265035/1‑139 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGtt < 8:82534/139‑1 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGtt < 1:131492/139‑1 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGtt > 5:10289/1‑139 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGtt < 1:293838/139‑1 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGtt > 4:287601/1‑139 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGtt > 2:293838/1‑139 (MQ=255) tCTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGtt > 3:313223/1‑139 (MQ=255) gctattcGGATTGCTTGATGTGATGAAATGGAGTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGACGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGGGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGtt < 3:405671/133‑1 (MQ=255) gcTAAACGGAATGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGtt < 5:296010/138‑1 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGa > 5:360670/1‑70 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGa < 6:360670/70‑1 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCt > 4:202064/1‑89 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCt < 3:202064/89‑1 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGa < 3:259385/93‑1 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGa > 8:23960/1‑93 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGa > 6:173433/1‑93 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAg < 3:341919/116‑1 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAg > 4:341919/1‑116 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGTTCGCCCCCAAg > 2:168359/1‑139 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGTTCGCCCCCAAg > 5:45133/1‑139 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGTTCGCCCCCAAg > 8:74590/1‑139 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGTTCGCCCCCAAg < 1:168359/139‑1 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGTTCGCCCCCAAg > 8:423849/1‑139 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGTTCGCCCCCAAg < 1:363775/139‑1 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGTTCGCCCCCAAg > 7:311277/1‑139 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGTTCGCCCCCAAg < 7:209699/139‑1 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGTTCGCCCCCAAg > 3:242666/1‑139 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGTTCGCCCCCAAg > 3:256708/1‑139 (MQ=255) aTGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGTTCGCCCCCAAg > 7:305370/1‑139 (MQ=255) tGCTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGTTCGCCCCCAAg < 1:397485/138‑1 (MQ=255) cTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGTTCGCCCCCAAGca < 3:97098/138‑1 (MQ=255) cTTGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGTTCGCCCCCAAGca < 8:10219/138‑1 (MQ=255) ttGATGTGATGAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCCAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCAACGCTCGGATAGCATGTGATTCCTATTTTTAGTTTTCTCATTGTTCGCCCCCAAGcaca > 8:77969/1‑139 (MQ=255) | CACCTCAGCGATTTTGCTTGCCAATGTCAAATCATACGGAGGATACTTAAAAACAGCGTATTGATTAACCTCAACTTCATGAAAATGAATATTGGGGTGATATGTATTTAGTCTAAACGGAATGCTTGACGTAATAAAATGGATTTCATGTCCCTTTTCAGCAAGCTGCTTCCCGAGTTCTGTCGCAATGATACCTGAGCCTCCGACGCTCGGATAGCATGTGATCCCTATTTTTAGTTTTTTCATTGTTCGCCCCCAAGCACA > CP006881/2175818‑2176081 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |