| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 1,245,557 | A→G | T466A (ACG→GCG) | U712_06265 → | Uncharacterized protein yjeA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 1,245,557 | 0 | A | G | 97.6% | 259.3 / NA | 85 | T466A (ACG→GCG) | U712_06265 | Uncharacterized protein yjeA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base G (37/45); minor base C (0/2); total (37/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAAGAACCATTTTGATTCACGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAACGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTAAGAAGTCCTTGGATCTAAATCA > CP006881/1245423‑1245689 | gaagaaCCATTTTGATTCACGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGaa < 7:395860/139‑1 (MQ=255)gaagaaCCATTTTGATTCACGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGATTCTCAGCTAGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGa > 8:59387/1‑138 (MQ=255) aaCCATTTTGATTCACGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGaaata > 6:432330/1‑138 (MQ=255) aaCCATTTTGATTCACGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGaaata > 1:48180/1‑138 (MQ=255) aCCATTTTTATTCACGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCGCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGCCAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGaaataaa < 2:49806/139‑1 (MQ=255) ccATTTTGATTCACGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGaaataaat > 4:329576/1‑139 (MQ=255) ttttGATTCACGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGaaataaat > 3:332310/1‑136 (MQ=255) ttGATTCACGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGa < 6:104285/138‑1 (MQ=255) ttGATTCACGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGa < 6:433625/138‑1 (MQ=255) tGATTCACGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGaa < 3:329576/138‑1 (MQ=255) tGATTCACGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGaa < 5:183080/138‑1 (MQ=255) gATTCACGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGaaa < 6:32855/138‑1 (MQ=255) cACGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCAGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGc < 8:55794/138‑1 (MQ=255) aCGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTg < 4:332310/139‑1 (MQ=255) tttACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGt < 6:160227/138‑1 (MQ=255) tttACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTa > 1:87828/1‑139 (MQ=255) ttACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCtttgcgg > 1:398136/1‑131 (MQ=255) cgaacatctGCTGATGCGGCCGATCAAATTATAAAAAACATCACCGATCACGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAAAAAAGAGAAGCGAAATAAATTCTAAAAGGCTGTCCGTACGGAc < 2:77081/133‑1 (MQ=255) cccACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACGGATCACGGCTATCAATTGTGCACAGTTTCTCAGCTTGAAGATGTTAAAAAACAAAGCGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGGCCGTACGGAc < 8:23778/137‑1 (MQ=255) cGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGAc < 3:73734/139‑1 (MQ=255) cGCACCTCTGCGGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGAACAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGACAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCGGTACGGAc < 7:357394/139‑1 (MQ=255) gCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGAc > 6:357878/1‑138 (MQ=255) gCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGAc < 5:357878/138‑1 (MQ=255) aCCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTAACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAATGCTGTCCGTACGGACAGc > 8:225867/1‑139 (MQ=255) ctgctgATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTTTCCGTACGGACAGCCgtt > 8:295069/1‑139 (MQ=255) gttttGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATGAAGGCTATCTATTGGTGTCAGTTTCTCAGCTTTAAGTGGTTAAAAAACAACTAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCtttttt < 4:55617/135‑1 (MQ=255) aagCGGCCGATTAAATTATAAAAAAGCTACCCGATCCAGGCTAACAATTGGGCACATTTTCTCAGCTTGACTTGTAAAAAAAACAAAGAGATGCGAAATAATTTCGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTa < 4:346450/137‑1 (MQ=255) aTGCGGCCGATTAAATAATAAAAAAGCTCACCGATCACGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTa < 2:109576/139‑1 (MQ=255) aTGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGACGCCAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTa < 5:376038/139‑1 (MQ=255) aTGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTc < 3:369742/137‑1 (MQ=255) aTGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTc < 5:204800/137‑1 (MQ=255) gCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTTTCCGTACGGACAGCCgtttttgattt > 7:428786/1‑134 (MQ=255) gCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTGCGTACGGACAGCCGTTTTTCTAtt > 1:312246/1‑139 (MQ=255) gCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTGCGGACGGGCAGCCGTTTTTGTAtt > 1:148880/1‑139 (MQ=255) gCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTAtt > 3:327629/1‑139 (MQ=255) gCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTAACCGATCAAGGCTTTCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGCAGCGAAATAAAATAGAAAAGGCGTTCCGGTAGGCCAGCCCTTTTTGTAtt > 2:217596/1‑139 (MQ=255) cGGCCGATGAAATAAAAAAAACGCTCACCGATCACGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCGCAGCTTGAATAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCTAAATAATTTAGAAACGGCGGTCCGTACGGACTGCCTTTTTTCTAtt < 6:379011/138‑1 (MQ=255) gCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTTAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCAGTACCGAAGGACAGCCATTTTTGGATTta > 3:24730/1‑138 (MQ=255) gCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTTCGGGCAGGCGTTTTTGTAtttta > 1:155383/1‑137 (MQ=255) gCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTtaa > 1:362056/1‑139 (MQ=255) gCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTtaa > 7:276972/1‑139 (MQ=255) gCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTtaa > 6:214957/1‑139 (MQ=255) gATGAAATTATAAAAAAGCTCCCCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGACGCCAAAAAAATTAGAAAAGGCTGCCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTtaataa < 1:383607/139‑1 (MQ=255) tGAAATTAAAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGGGTCAGTTTCTCAGCTTGATGAGCTAAAAAAACAACCCGACGCGAAATAAATTACAAAAGGCTGCCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAaga < 4:149947/139‑1 (MQ=255) gCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCGGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCa < 7:295069/139‑1 (MQ=255) gCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGGTACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAACGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCa < 3:9788/139‑1 (MQ=255) gATCAAGGGTATAAATTGGTGACAGTTTCAGAGATTGAAGAGTTAAAAAAACAAAGAGAAGCGAAAAAAATTACAAAAGGCTGTCCTTACGGAAAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACAttt < 4:24730/139‑1 (MQ=255) aGGCAATCAAATGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAATAGGTTAAAAAACAAACCGAAGCTAAAAAAATAAGAAAAGGCTGGCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGtt < 8:11662/139‑1 (MQ=255) gCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTg < 2:48180/139‑1 (MQ=255) gCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTg < 2:87828/139‑1 (MQ=255) tCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTTTTCCTACGGCCCGCCCTTTTTCTTTTTTATTAGAGCCAGTGGTTGGCCACACAAATAAttttttggg > 5:296037/1‑134 (MQ=255) tCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCGGTACGGCCAGCCGTTTTTGTTTTTTAATAGAGCCGGTGGTGGCCCCAACATTTAATTTTTGtgg > 7:380793/1‑137 (MQ=255) tCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGTCAGCCTTTTTTGTTTTTAATAAGAGCCTGTGGTGGGCCACACATTTAATTTTGGtgc > 2:359796/1‑137 (MQ=255) tCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTcc > 7:212382/1‑139 (MQ=255) tCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTcc > 5:150567/1‑139 (MQ=255) tCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTcc > 2:265767/1‑139 (MQ=255) tCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACCGCCACGCATTTTTATATTTAATAATAGCCTGTTGTTGACCAAAAAAATAAGATTAGTcc > 1:372380/1‑139 (MQ=255) tCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCCTACGGACAGCCATTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTcg > 7:417753/1‑138 (MQ=255) tGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCAGTCCGTACGGTCAGCAATTTTTATATTTTAAAAAAGCCTTTGGTTGCCAAAACATTTAAATTTGTTcagtta > 3:198599/1‑133 (MQ=255) gTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATa < 2:362056/138‑1 (MQ=255) gTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATAc > 8:3255/1‑139 (MQ=255) gTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATAc < 4:327629/139‑1 (MQ=255) gTGAAAGTTTCTCAGCTTGATTAGGTAAAAAAACAAAGAGAAGCCAAATAAATTATAAACGGCTGTCCGTACGTACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATa < 2:148880/138‑1 (MQ=255) tttCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTGCGTACGGACAGCCTTTTTTATATTTAATAATAGCCTGTGGTTGCCCAAAAATTTAAGTTTGGTGCGGAATAATTTCCg > 3:395450/1‑138 (MQ=255) tttCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGCCCGCCGTTTTTCTATTTAATAATAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAATTTTGGTACTGAATACTTGCCg > 3:448295/1‑138 (MQ=255) tttCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCg > 1:68659/1‑138 (MQ=255) tttCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCg > 3:361537/1‑138 (MQ=255) tctcAGCTTGAAGAGGTAAAAAAACAAAGAGAAACGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGaa < 5:95644/138‑1 (MQ=255) atttaaGAGGTTAAAAAACAACGACAAGCTAAATAAATTATAAACGGCTGTCCGTACGGACTGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTaa < 8:279635/135‑1 (MQ=255) tGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTaag > 8:137167/1‑138 (MQ=255) ggTAAAAAAACAAAGACAAGCCAAATAAATTAGAAATGGGTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTAAGAAGTCCt < 7:59387/139‑1 (MQ=255) ttaaaaaaaCAAGAACAACCTAAATAAATTCGAAAAGGCTGCCCGTACGTAAAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTAAGAAGTCCt < 1:221736/135‑1 (MQ=255) gTTAAAAAACAACGTGAACCTAAATAAATTACAAAAGGCTGTCCGTACGGAATGCCTTTTTTCTATTAAATAAGAGCCTTTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTAAGAAGTCCtt < 7:254146/139‑1 (MQ=255) gTTAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTAAGAAGTCCtt < 4:361537/139‑1 (MQ=255) tAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTg < 7:367209/102‑1 (MQ=255) tAAAAAACAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTg > 8:367209/1‑102 (MQ=255) aaaaaaAGACAAGCTAAAAAAATTATAAACGGCTTCCCGAACGTACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTAAGAAGTCCTTGGATCt < 6:296037/139‑1 (MQ=255) aaaCAAAGAGAAGCTAAATAAATTAGAAATGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTAAGAAGTCCTTGGATCt < 8:380793/139‑1 (MQ=255) aaaCAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTAGGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTAAGAAGTCCTTGGATCt < 1:47533/139‑1 (MQ=255) aaaCAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTAAGAAGTCCTTGGATCt < 1:265767/139‑1 (MQ=255) aaaCAAAGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTAAGAAGTCCTTGGATCt < 1:257276/139‑1 (MQ=255) cAAAGTGAAGCTAAATAAATTACAAAAGGCTGTCCGTAGGGACTGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTAAGAAGTCCTTGGATCTaaa < 1:305343/139‑1 (MQ=255) cAAACAGAAGCGAAATAAATAAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTAAGAAGTCCTTGGATCTaaa < 7:252411/139‑1 (MQ=255) aaaGAGAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTAAGAAGTCCTTGGATCTaaa > 3:105389/1‑138 (MQ=255) agagAAGCGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTAAGAAGTCCTTGGATCTAAATCa < 5:214957/139‑1 (MQ=255) | GAAGAACCATTTTGATTCACGATATTTACCGCACCTCTGCTGATGCGGCCGATGAAATTATAAAAAAGCTCACCGATCAAGGCTATCAATTGGTGACAGTTTCTCAGCTTGAAGAGGTTAAAAAACAAAGAGAAACGAAATAAATTAGAAAAGGCTGTCCGTACGGACAGCCTTTTTTCTATTTAATAAGAGCCTGTGGTGGCCCAAACATTTAAGTTTGGTCCTGAATACTTGCCGAAAGCGTAAGAAGTCCTTGGATCTAAATCA > CP006881/1245423‑1245689 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |