| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 278,049 | A→G | I235V (ATA→GTA) | U712_01300 → | putative transporter ycbK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 278,049 | 0 | A | G | 99.0% | 321.8 / NA | 99 | I235V (ATA→GTA) | U712_01300 | putative transporter ycbK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (56/42); minor base T (0/1); total (56/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.34e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGGGATCCGTCTCAATGCATACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAATAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATGGAGCTTTATTTCT > CP006881/277916‑278182 | aGGGATCCGTCTCAATGCATACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAAtt > 5:237410/1‑139 (MQ=255) gggATCCGTCTCAATGCATACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTg < 7:29967/139‑1 (MQ=255) gggATCCGTCTCAATGCATACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTg < 7:326053/139‑1 (MQ=255) gggATCCGTCTCAATGCATACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTg < 8:395584/139‑1 (MQ=255) gATCCGTCTCAATGCATACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCa < 6:237410/139‑1 (MQ=255) aTCCGTCTCAATGCATACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAg > 6:374417/1‑139 (MQ=255) tCCGTCTCAATGCATCCGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGt < 4:412769/139‑1 (MQ=255) tctcAATGCATACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGt > 3:100914/1‑138 (MQ=255) aaTGCATACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTAAACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACca < 5:232783/139‑1 (MQ=255) tGCATACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACcaca < 3:100158/139‑1 (MQ=255) tGCATACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTGTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTGccc > 5:295122/1‑136 (MQ=255) tACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTg < 3:440080/121‑1 (MQ=255) tACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTg > 4:440080/1‑121 (MQ=255) tACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTg < 2:248668/121‑1 (MQ=255) tACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTg > 1:248668/1‑121 (MQ=255) tACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGa > 2:268493/1‑139 (MQ=255) aTGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCGATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCAt < 3:238890/139‑1 (MQ=255) aTGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCAt > 7:61645/1‑139 (MQ=255) aTGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCAt > 1:260220/1‑139 (MQ=255) aTGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATAAGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCAt < 5:438520/139‑1 (MQ=255) ctgctgGAGCTGCCTGGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCTTGAATACGCCATTGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGGTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCTCAGTGATTCCATTtgtga > 7:189569/1‑137 (MQ=255) ctgctgGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTg < 5:211403/108‑1 (MQ=255) ctgctgGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTg > 6:211403/1‑108 (MQ=255) ctgctgGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGc > 4:36268/1‑138 (MQ=255) ctgctgGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGc > 2:39716/1‑138 (MQ=255) gctgGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTaa > 4:213543/1‑139 (MQ=255) tGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAg > 3:277934/1‑139 (MQ=255) gCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCt > 5:274601/1‑128 (MQ=255) gCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCt > 3:425351/1‑128 (MQ=255) gCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCt < 4:425351/128‑1 (MQ=255) gCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCt < 6:274601/128‑1 (MQ=255) atgatgCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCa < 1:268493/139‑1 (MQ=255) aGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCAt < 4:434511/104‑1 (MQ=255) aGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCAt > 3:434511/1‑104 (MQ=255) aGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCggg > 1:292700/1‑139 (MQ=255) ggATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACcaca < 3:345579/92‑1 (MQ=255) ggATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACcaca > 4:345579/1‑92 (MQ=255) ggATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCAt > 2:244244/1‑102 (MQ=255) ggATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCAt < 1:244244/102‑1 (MQ=255) ggATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCgggg > 4:185147/1‑138 (MQ=255) ggATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCgggg > 3:74659/1‑138 (MQ=255) ggATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGc > 5:325832/1‑139 (MQ=255) ggATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTACATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCgggg > 3:39045/1‑138 (MQ=255) ggATAAAAGCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCCCAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAACCGAATCgggg > 4:178439/1‑138 (MQ=255) aaTCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGGAGTAATTGCAGTCGTTACCACCGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTGGAGGGCATAAAACCAATCGGGGCCCAGCg > 4:207270/1‑139 (MQ=255) ggcggcTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCGATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAgcc > 3:18997/1‑139 (MQ=255) ggcggcTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAgcc > 7:396277/1‑139 (MQ=255) cggcTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATaaaa > 6:84163/1‑116 (MQ=255) cggcTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATaaaa < 5:84163/116‑1 (MQ=255) cTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAgccgccgc > 3:327677/1‑139 (MQ=255) gCATGAATACGCCAATGGCAGCATATGCGCTTTCTATTTATGGTTGGTTCGCATTTATTTCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGTGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAgccgccgcc < 5:135246/137‑1 (MQ=255) gCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAgccgccgcc < 4:277934/137‑1 (MQ=255) gCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCAt > 2:285783/1‑139 (MQ=255) gCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGGGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAgccgccgcc < 4:442216/137‑1 (MQ=255) cGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTCTGTAGGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCCCAGTGATTCCATTTGTGCTACTGCTTGAGGGCATACAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGc < 3:178439/139‑1 (MQ=255) cGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGc < 4:100914/139‑1 (MQ=255) cGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGc < 7:119444/139‑1 (MQ=255) cGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGc < 3:185147/139‑1 (MQ=255) cGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGc < 4:74659/139‑1 (MQ=255) cGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTAGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGTCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGc < 5:124131/139‑1 (MQ=255) aTGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGc < 2:292700/139‑1 (MQ=255) tGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACTGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGcc > 5:193254/1‑139 (MQ=255) tGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGcc > 8:112449/1‑139 (MQ=255) gcaTATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATcc > 6:76197/1‑139 (MQ=255) tCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACg < 1:39716/139‑1 (MQ=255) ccGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACCGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGa > 4:170656/1‑139 (MQ=255) ccGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGa > 6:176645/1‑139 (MQ=255) gCTTTATATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGAtt < 5:214421/139‑1 (MQ=255) ttCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTc > 3:364959/1‑139 (MQ=255) tCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCTTTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGACATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGAtttt < 3:218589/137‑1 (MQ=255) tCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGCGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTc > 2:296249/1‑138 (MQ=255) tCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTc > 4:425339/1‑138 (MQ=255) tCTATGTATGGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTc > 6:302990/1‑138 (MQ=255) atgtatgGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATg > 3:373050/1‑139 (MQ=255) tgtatgGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGCGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATg < 1:296249/138‑1 (MQ=255) tgtatgGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACg < 5:423911/128‑1 (MQ=255) tgtatgGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACg > 6:423911/1‑128 (MQ=255) tgtatgGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTa < 3:425339/136‑1 (MQ=255) tgtatgGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATg < 5:302990/138‑1 (MQ=255) tgGTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTGTGGAGCt > 7:144306/1‑139 (MQ=255) ggTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGaa < 2:308199/73‑1 (MQ=255) ggTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGaa > 1:308199/1‑73 (MQ=255) ggttGTGCGCAGTAATTGCAGGCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTACTGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATGGAGCt < 2:176011/135‑1 (MQ=255) gTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGc > 1:276246/1‑62 (MQ=255) gTTTGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGc < 2:276246/62‑1 (MQ=255) ttGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATg > 8:317560/1‑130 (MQ=255) ttGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATg < 7:317560/130‑1 (MQ=255) ttGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATGGAGCTTTAt > 8:435856/1‑139 (MQ=255) ttGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATGGAGCTTTAt > 7:6422/1‑139 (MQ=255) tGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGc > 7:338910/1‑103 (MQ=255) tGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGc < 8:338910/103‑1 (MQ=255) tGTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATGGAGCTTTAtt > 6:220989/1‑139 (MQ=255) gTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATGGAGCTTTAttt > 7:117854/1‑139 (MQ=255) gTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATGGAGCTTTAttt > 6:3731/1‑139 (MQ=255) gTTCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATGGAGCTTTAttt > 1:245487/1‑139 (MQ=255) tCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGTCGATTTTGTATGGAGGGTTAtttgt > 2:95257/1‑137 (MQ=255) tCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATGGAGCTTTAttt > 4:33309/1‑137 (MQ=255) tCGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATGGAGCTTTAttt < 3:33309/137‑1 (MQ=255) cGCAGTAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATGGAGCTTTATTtct < 3:237846/138‑1 (MQ=255) | AGGGATCCGTCTCAATGCATACGGGATGACAGCTGCTGGAGCTGCCATGATGCTTTACACAGGGATAAAATCGGCGGCTGGCATGAATACGCCAATGGCAGCATATCCGCTTTCTATGTATGGTTTGTTCGCAATAATTGCAGTCGTTACCACAGTGATTCCATTTGTGCTAATGCTTGAGGGCATAAAACGAATCGGGGCACAGCGAGCCGCCGCCATTTCAATGGCAGGGCCTATCCTGACGATTTTCTATGGAGCTTTATTTCT > CP006881/277916‑278182 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |