| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,177,870 | G→A | D42D (GAC→GAT) | U712_10895 ← | Dihydrodipicolinate reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,177,870 | 0 | G | A | 98.8% | 257.9 / NA | 83 | D42D (GAC→GAT) | U712_10895 | Dihydrodipicolinate reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (38/44); minor base C (1/0); total (39/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TACTTTTCCGATTTCAGGCGTTGTTAAATCAATTAAGACATCCGGCTGTGTTTCCGAAAAGCATGCACGGATATCTGTGTAAATGAGAGCATCTGACTCAACAGACATCACATCAGATAATTTTTGCTGGTCGTATGTATGGTCTATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTC > CP006881/2177741‑2178004 | tacagttCCGCTTTCCGGCGGGCGTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGTTTCTCTAAAACACGCAAGGATAGCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCACCAGGCAGCACATCAGATAATTTTTGCTGAGCctatgta < 4:245601/134‑1 (MQ=255)taCTTTTCCGATTTCGGGCGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCgtatgta < 1:240173/139‑1 (MQ=255)taCTTTTCCGATTTCGGGCGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCgtatgta < 7:429855/139‑1 (MQ=255)taCTTTTCCGATTTCGGGCGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCgtatgta < 2:216012/139‑1 (MQ=255)taCTTTTCCGATTTCGGGCGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGGTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCgtatgt < 4:364994/138‑1 (MQ=255)taCTTTTCCGATTTCGGGCGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGGTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCgtatgta < 2:36289/139‑1 (MQ=255) tttCCGATTTCGGGCGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGt > 1:8820/1‑139 (MQ=255) tCCGATTTCGGGCGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTc > 7:381708/1‑138 (MQ=255) cGATTTCGGGCGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTa < 5:236259/138‑1 (MQ=255) aTTTCGGGCGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATgg < 4:49594/139‑1 (MQ=255) aTTTCGGGCGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATgg < 7:375171/139‑1 (MQ=255) aTTTCGGGCGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATgg > 2:79947/1‑139 (MQ=255) tttCGGGCGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGc < 4:192663/139‑1 (MQ=255) tttCGGGCGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGc < 2:199171/139‑1 (MQ=255) tttCGGGCGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGGCTATGGc < 1:71260/139‑1 (MQ=255) cGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACa < 5:226011/139‑1 (MQ=255) atcaaGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTTAATGAAAGCATCTGCCTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATgtg > 8:193510/4‑137 (MQ=255) atcaaGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCgtatgtat < 7:353606/106‑1 (MQ=255) atcaaGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCgtatgtat > 8:353606/4‑109 (MQ=255) aaGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATgtggtg < 6:130640/139‑1 (MQ=255) ccGGTTGTGTTTATGTAAAAAATGCAGTGATATCTGTGTAAATGAAAGCATATGACGCAAAAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGCTCGTATTTATTGTATATGGCACCTACACTGTCAAAAATTTGTgttcgtga > 4:233012/1‑137 (MQ=255) cGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCt < 1:79947/139‑1 (MQ=255) 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cTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCt < 6:96624/107‑1 (MQ=255) cTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCt > 5:96624/1‑107 (MQ=255) cTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCAttcttc > 1:418116/1‑138 (MQ=255) cTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTcc > 3:414870/1‑139 (MQ=255) cTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAAGTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTcc > 1:404338/1‑139 (MQ=255) tgtgTAAATGAAAGCATCTGACTCCACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGGTCGTTCTGCCAATTTACCAGCTTCCTGCCCCAGTCTTCCa > 3:200293/1‑139 (MQ=255) tgtAAATGAAAGGATCTGACTCAAGAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCGATTCTTCCAcg < 3:379404/139‑1 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCAcgcg > 5:432754/1‑139 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCAcgcg > 7:333016/1‑139 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCAcgcg > 8:342011/1‑139 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCAcg < 1:289148/137‑1 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCAcg > 2:289148/1‑137 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGACCCATTCTTCCAcgcg > 1:82038/1‑139 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCCACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCt < 5:286862/102‑1 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCCACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCt > 6:286862/1‑102 (MQ=255) aTGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTc > 4:373210/1‑139 (MQ=255) gaaagCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTccc > 3:187023/4‑138 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCgtatgta < 4:130753/52‑1 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCgtatgta > 3:130753/1‑52 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATTTGGTGTTCGTTCTgc > 5:162909/1‑95 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATTTGGTGTTCGTTCTgc < 6:162909/96‑2 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCt > 5:250289/1‑94 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCt < 6:250289/94‑1 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGc > 3:300553/1‑138 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGc > 5:300217/1‑138 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGc > 7:237243/1‑138 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCa < 2:33208/139‑1 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCa < 1:44729/139‑1 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCa < 7:127798/139‑1 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTACCACGCGGTCCCGc > 4:247494/1‑138 (MQ=255) cTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTTCCCCATTATTCCACGCGGTCCCGCAATGa > 7:174684/1‑138 (MQ=255) aCTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGac < 2:418116/136‑1 (MQ=255) aCTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGac < 7:43953/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATg > 4:354782/1‑69 (MQ=255) aaCAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATg < 3:354782/69‑1 (MQ=255) aaCAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAAttt > 1:121590/1‑138 (MQ=255) aCAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTaa > 8:293168/1‑139 (MQ=255) aCAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTaa > 8:67899/1‑139 (MQ=255) aCAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTaa > 2:19048/1‑139 (MQ=255) catcacatcaGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATTGCCCCTACATGGTCAATATGTGGTGTTCGTTCTTCCAAATTAACAGATTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGGCTAATTTAATTGtt > 6:408696/1‑139 (MQ=255) tcacatcaGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGACCCATACTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTc > 6:406223/1‑139 (MQ=255) cacatcaGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCg > 7:401249/1‑139 (MQ=255) tcaGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTg < 1:19048/139‑1 (MQ=255) tcaGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTg < 2:121590/139‑1 (MQ=255) tcaGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTg < 4:414870/139‑1 (MQ=255) tcaGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGGCAAAATGTGGGGTTCGGTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTg < 8:284461/139‑1 (MQ=255) caGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGa > 3:98124/1‑139 (MQ=255) aGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGa < 6:432754/138‑1 (MQ=255) tttttGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTg < 3:373210/139‑1 (MQ=255) ttGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAt < 2:238482/138‑1 (MQ=255) ttGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAt < 8:174684/138‑1 (MQ=255) ttGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAt < 8:401249/138‑1 (MQ=255) cTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAtctc < 7:315128/138‑1 (MQ=255) cTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAtctc < 8:424879/138‑1 (MQ=255) cTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAtctc < 7:193510/138‑1 (MQ=255) | TACTTTTCCGATTTCAGGCGTTGTTAAATCAATTAAGACATCCGGCTGTGTTTCCGAAAAGCATGCACGGATATCTGTGTAAATGAGAGCATCTGACTCAACAGACATCACATCAGATAATTTTTGCTGGTCGTATGTATGGTCTATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTC > CP006881/2177741‑2178004 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |