Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 2,177,894 | G→T | V34V (GTC→GTA) | U712_10895 ← | Dihydrodipicolinate reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 2,177,894 | 0 | G | T | 97.5% | 240.4 / ‑3.1 | 80 | V34V (GTC→GTA) | U712_10895 | Dihydrodipicolinate reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (45/33); minor base C (1/1); total (46/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 |
CGTTGTTAAATCAATTAAGACATCCGGCTGTGTTTCCGAAAAGCATGCACGGATATCTGTGTAAATGAGAGCATCTGACTCAACAGACATCACATCAGATAATTTTTGCTGGTCGTATGTATGGTCTATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGG > CP006881/2177759‑2178029 | cGTTGTTAAATCAATCAAGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACa < 5:226011/139‑1 (MQ=255) atcaaGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTTAATGAAAGCATCTGCCTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATgtg > 8:193510/4‑137 (MQ=255) aaGACATCCGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATgtggtg < 6:130640/139‑1 (MQ=255) ccGGTTGTGTTTATGTAAAAAATGCAGTGATATCTGTGTAAATGAAAGCATATGACGCAAAAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGCTCGTATTTATTGTATATGGCACCTACACTGTCAAAAATTTGTgttcgtga > 4:233012/1‑137 (MQ=255) cGGTTGTGTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCt < 1:79947/139‑1 (MQ=255) tgtgTTTCTGTAAAACAGGCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTgcc > 6:144048/1‑136 (MQ=255) aacaggCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGcttc > 4:177516/6‑139 (MQ=255) aacaggCATGGATATCTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGcttc < 5:271182/134‑1 (MQ=255) tggATATCTGTGTAAATGAAAGCAGCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAAATTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCa < 7:276627/138‑1 (MQ=255) cTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCt > 5:96624/1‑107 (MQ=255) cTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCt < 6:96624/107‑1 (MQ=255) cTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCAttcttc > 1:418116/1‑138 (MQ=255) cTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTcc > 3:414870/1‑139 (MQ=255) cTGTGTAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAAGTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTcc > 1:404338/1‑139 (MQ=255) tgtgTAAATGAAAGCATCTGACTCCACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGGTCGTTCTGCCAATTTACCAGCTTCCTGCCCCAGTCTTCCa > 3:200293/1‑139 (MQ=255) tgtAAATGAAAGGATCTGACTCAAGAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCGATTCTTCCAcg < 3:379404/139‑1 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCAcgcg > 7:333016/1‑139 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCAcgcg > 8:342011/1‑139 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCAcgcg > 5:432754/1‑139 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCAcg < 1:289148/137‑1 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCAcg > 2:289148/1‑137 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGACCCATTCTTCCAcgcg > 1:82038/1‑139 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCCACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCt < 5:286862/102‑1 (MQ=255) tAAATGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCCACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCt > 6:286862/1‑102 (MQ=255) aTGAAAGCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTc > 4:373210/1‑139 (MQ=255) gaaagCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTccc > 3:187023/4‑138 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATTTGGTGTTCGTTCTgc > 5:162909/1‑95 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATTTGGTGTTCGTTCTgc < 6:162909/96‑2 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCt > 5:250289/1‑94 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCt < 6:250289/94‑1 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGc > 3:300553/1‑138 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGc > 7:237243/1‑138 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGc > 5:300217/1‑138 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCa < 1:44729/139‑1 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCa < 7:127798/139‑1 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCa < 2:33208/139‑1 (MQ=255) agCATCTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTACCACGCGGTCCCGc > 4:247494/1‑138 (MQ=255) cTGACTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTTCCCCATTATTCCACGCGGTCCCGCAATGa > 7:174684/1‑138 (MQ=255) aCTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGac < 2:418116/136‑1 (MQ=255) aCTCAACAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGac < 7:43953/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATg > 4:354782/1‑69 (MQ=255) aaCAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATg < 3:354782/69‑1 (MQ=255) aaCAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAAttt > 1:121590/1‑138 (MQ=255) aCAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTaa > 8:67899/1‑139 (MQ=255) aCAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTaa > 8:293168/1‑139 (MQ=255) aCAGGCATCACATCAGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTaa > 2:19048/1‑139 (MQ=255) catcacatcaGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATTGCCCCTACATGGTCAATATGTGGTGTTCGTTCTTCCAAATTAACAGATTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGGCTAATTTAATTGtt > 6:408696/1‑139 (MQ=255) tcacatcaGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGACCCATACTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTc > 6:406223/1‑139 (MQ=255) cacatcaGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCg > 7:401249/1‑139 (MQ=255) tcaGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTg < 1:19048/139‑1 (MQ=255) tcaGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTg < 2:121590/139‑1 (MQ=255) tcaGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTg < 4:414870/139‑1 (MQ=255) tcaGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGGCAAAATGTGGGGTTCGGTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTg < 8:284461/139‑1 (MQ=255) caGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGa > 3:98124/1‑139 (MQ=255) aGATAATTTTTGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGa < 6:432754/138‑1 (MQ=255) tttttGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTg < 3:373210/139‑1 (MQ=255) ttGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAt < 8:401249/138‑1 (MQ=255) ttGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAt < 8:174684/138‑1 (MQ=255) ttGCTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAt < 2:238482/138‑1 (MQ=255) cTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAtctc < 7:193510/138‑1 (MQ=255) cTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAtctc < 8:424879/138‑1 (MQ=255) cTGATCGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAtctc < 7:315128/138‑1 (MQ=255) cGTATGTATGGTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTAc > 5:26032/1‑139 (MQ=255) gTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTTACATCTTGATATCCTCAACTTTCcttttt > 6:337313/1‑139 (MQ=255) gTCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTAGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCcttct > 1:39436/1‑138 (MQ=255) tCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGCCTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCcttcttc > 8:165234/1‑139 (MQ=255) tCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGGTCTCCTCTACTTTCcttcttc < 8:381708/139‑1 (MQ=255) tCTATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACCCGGTCCCGCAATGACTAATTTAAATGTTTCGTTTGACATCTTGATATCCGCTACTTTCcttcttc > 4:25337/1‑139 (MQ=255) tATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGCTCTCCTCTACTTTCcttcttctt > 2:291478/1‑139 (MQ=255) tATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAt > 8:255438/1‑117 (MQ=255) tATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGAt < 7:255438/117‑1 (MQ=255) tATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATGTCCTCTACTTTCcttcttgtt > 1:335530/1‑139 (MQ=255) tATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCcttcttctt > 5:95763/1‑139 (MQ=255) tATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCcttcttctt > 3:43588/1‑139 (MQ=255) tATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCcttcttctt > 6:343450/1‑139 (MQ=255) tATGGCCCCTACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGACCCAATCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTAACTCTCCTCTACTTTCctgcttctt > 4:87839/1‑139 (MQ=255) ggCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTc > 5:431470/1‑139 (MQ=255) gCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTc < 7:67899/138‑1 (MQ=255) gCCCCTACAAGGTCAAAATGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTc < 7:293168/138‑1 (MQ=255) cccTACAAGGTCAAACTGTGGTGTTCGTTCTGCCAATTTAACAGCTTCCTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCCGCAATGACTAATTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTgg < 2:81698/139‑1 (MQ=255) | CGTTGTTAAATCAATTAAGACATCCGGCTGTGTTTCCGAAAAGCATGCACGGATATCTGTGTAAATGAGAGCATCTGACTCAACAGACATCACATCAGATAATTTTTGCTGGTCGTATGTATGGTCTATGGCCCCGACAAGGTCAAAATGAGGTGTTCGTTCTGTCAATTTAACAGCTTCTTGCCCCATTCTTCCACGCGGTCCTGCAATGACTACTTTAATTGTTTCGTTTGACATCTTGATCTCCTCTACTTTCCTTCTTCTTTTCTGG > CP006881/2177759‑2178029 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |