Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 2,172,319 | A→G | A69A (GCT→GCC) | U712_10860 ← | 3‑methyl‑2‑oxobutanoate hydroxymethyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 2,172,319 | 0 | A | G | 95.7% | 208.5 / ‑0.7 | 71 | A69A (GCT→GCC) | U712_10860 | 3‑methyl‑2‑oxobutanoate hydroxymethyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/2); new base G (43/24); total (45/26) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.51e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.21e-01 |
CTCAAGCTTCAGTGCGTCAGCTCCGCTTTCCTGAACGATAACTGCTGCATTTTTCAGCGTATCCTCCTTGGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATGTCTGTCACAATAAAAGTATTCTGCGCGCCCCTTTTAACAGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCGAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGCAAGCTTAGCTGCCGGA > CP006881/2172184‑2172451 | cTCAAGCTTCAGTGCGTCAGCTCCGCTTTCCTGAACGATAGCCGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCt > 3:76920/1‑139 (MQ=255) aaGCTTCAGTGCGTCAGCTCCGCTTTCCTGAACGATAGCCGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCtttt < 6:171692/139‑1 (MQ=255) cAGTGCGTCAGCTCCGCTTTCCTGAACGATAGCCGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTatga > 3:204112/1‑139 (MQ=255) aGTGCGTCAGCTCCGCTTTCCTGAACGATAGCCGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTatga < 3:104008/138‑1 (MQ=255) gTGCGTCAGCTCCGCTTTCCTGAACGATAGCCGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCtttt > 1:38903/1‑131 (MQ=255) gTGCGTCAGCTCCGCTTTCCTGAACGATAGCCGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCtttt < 2:38903/131‑1 (MQ=255) ggcAGCTCCGCTTTCCTGAACGATAGCGGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATc < 3:66028/137‑1 (MQ=255) gTCAGCTCCGCTTTCCTGAATGATAGCCGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATc < 3:409621/139‑1 (MQ=255) tCAGCTCCGCTTTCCTGAACGATAGCCGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCa > 2:312644/1‑139 (MQ=255) ccGCTTTCCTGAACGATAGCCGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACATGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCg > 2:142799/1‑139 (MQ=255) cGCTTTCCTGAACGATAGCCGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGc < 7:368801/139‑1 (MQ=255) cGCTTTCCTGAACGATAGCCGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGc < 4:295495/139‑1 (MQ=255) cGCTTTCCTGAACGATAGCCGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGc < 8:319107/139‑1 (MQ=255) cTTTCCTGAACGATAGCCGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCaa > 8:376015/1‑139 (MQ=255) cTGAACGATAGCCGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGt > 6:23278/1‑138 (MQ=255) cTGAACGATAGCCGCTGCATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGt < 4:76920/138‑1 (MQ=255) atagccgctgcATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGa < 6:174789/133‑1 (MQ=255) tagccgctgcATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGa > 6:32817/6‑138 (MQ=255) tagccgctgcATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGa > 4:113887/6‑138 (MQ=255) tagccgctgcATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGa > 5:63110/6‑138 (MQ=255) gccgctgcATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACCCCGACAg > 7:58710/4‑139 (MQ=255) ccgctgcATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGTTGATAAGACAAAAACGTCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGt < 8:436503/137‑1 (MQ=255) ccgctgcATTTTTCAGCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGt < 3:113887/137‑1 (MQ=255) gCGTATCTTCCTTAGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAg < 5:32817/139‑1 (MQ=255) acatcctTAGACAGGTCATAAGACATACACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGgacga < 6:328960/136‑1 (MQ=255) ttagACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAGCGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGCCAGTTGCATCAAGGCCGAGGCCGACCATTc > 4:348644/4‑139 (MQ=255) agACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTACCGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTcc > 8:63980/2‑138 (MQ=255) agACAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTcc > 8:70844/2‑138 (MQ=255) aCAGGTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAg > 5:329422/1‑139 (MQ=255) gagATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACACCGTTTAACGGCTTTTGTATGAGGGAGCATGTCCGCAACTGTAACACCGACAGATGAATCAATGACGAGGACGACCCTTCCAAGTGaa > 8:339179/3‑139 (MQ=255) gTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATATAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGaa > 8:203182/1‑139 (MQ=255) gTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAATGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGaa > 7:7503/1‑139 (MQ=255) gTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTgca > 7:106499/1‑137 (MQ=255) gTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGaa > 3:154241/1‑139 (MQ=255) gTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGaa > 7:121210/1‑139 (MQ=255) gTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGaa > 7:393081/1‑139 (MQ=255) gTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGaa > 8:387543/1‑139 (MQ=255) gTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGACCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGaa > 1:391919/1‑139 (MQ=255) gTGATAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACCGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGACACACCGACAGTTGAATCAAGTCCGAGGACGACCATTCCAAGTGa > 4:404433/1‑138 (MQ=255) tAAGACATAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCa < 8:393081/138‑1 (MQ=255) aTAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCCCCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACt > 2:407310/1‑138 (MQ=255) aTAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGc < 4:91949/77‑1 (MQ=255) aTAAACGGCATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGc > 3:91949/1‑77 (MQ=255) cATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAGTCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATg > 7:94083/1‑139 (MQ=255) cATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATg > 8:80135/1‑139 (MQ=255) cATATCTGTCACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATg > 6:217183/1‑139 (MQ=255) tcACAATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTcc > 7:12747/1‑139 (MQ=255) acaATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAgg < 4:277019/87‑1 (MQ=255) acaATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAgg > 3:277019/1‑87 (MQ=255) acaATAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCg > 3:379848/1‑139 (MQ=255) tAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGt > 1:132657/1‑61 (MQ=255) tAAAGGTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGt < 2:132657/61‑1 (MQ=255) ggTATTCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCa < 4:154241/138‑1 (MQ=255) ttCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGCCCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGc > 5:201438/1‑137 (MQ=255) ttCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGc > 5:89906/1‑137 (MQ=255) ttCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGc > 8:436878/1‑137 (MQ=255) ttCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGc > 4:442632/1‑137 (MQ=255) ttCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGc > 2:259269/1‑137 (MQ=255) ttCGGCGCACCCCTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGGGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGc > 3:55270/1‑137 (MQ=255) ttCGGCGCACCCCTTTAAACGGCTTTTGTATTATGGATCATTTAAGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCAAAGTGAATCCCCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAgaa > 4:179200/1‑136 (MQ=255) ttCGGCGCACCCCTTATAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGCCCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGc > 2:135781/1‑137 (MQ=255) accccTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGCAAGTTTAGCt > 5:98821/2‑139 (MQ=255) ccccTTTTAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGCAAGTTTAGCTg < 7:80135/139‑1 (MQ=255) cccTTTTAACAGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCGAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGCAAGCTTAg > 6:86674/1‑135 (MQ=255) cccTTTTAACAGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCGAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGCAAGCTTAg < 5:86674/135‑1 (MQ=255) cccTCTTAACGGCTTATGTATGATGCATCATGGCCGCAACTGTCCCACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGCAAGTTTAGCTGc < 4:401696/139‑1 (MQ=255) ccTTTTAACAGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCGAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGCAAGCTTAGCTGcc < 2:270325/139‑1 (MQ=255) ttAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGCAAGTTTAGCTGCCgg < 1:259269/137‑1 (MQ=255) ttAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGCAAGTTTAGCTGCCGGa > 2:275005/1‑138 (MQ=255) ttAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGCAAGTTTAGCTGCCGGa < 4:204112/138‑1 (MQ=255) ttAACGGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCAAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGCAAGTTTAGCTGCCGGa < 6:89906/138‑1 (MQ=255) | CTCAAGCTTCAGTGCGTCAGCTCCGCTTTCCTGAACGATAACTGCTGCATTTTTCAGCGTATCCTCCTTGGACAGGTGATAAGACATAAACGGCATGTCTGTCACAATAAAAGTATTCTGCGCGCCCCTTTTAACAGCTTTTGTATGATGGATCATGTCCGCAACTGTCACACCGACAGTTGAATCAAGGCCGAGGACGACCATTCCGAGTGAATCACCGACTAAAATCATGTCAACTCCCGCTTGTTCAGCAAGCTTAGCTGCCGGA > CP006881/2172184‑2172451 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |