Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 2,180,942 | T→G | intergenic (‑95/+16) | U712_10915 ← / ← U712_10920 | Uncharacterized protein ypjA/Menaquinol‑cytochrome c reductase cytochrome b/c subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 2,180,942 | 0 | T | G | 100.0% | 255.5 / NA | 79 | intergenic (‑95/+16) | U712_10915/U712_10920 | Uncharacterized protein ypjA/Menaquinol‑cytochrome c reductase cytochrome b/c subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (53/26); total (53/26) |
AGCATCGGCTGCCGTCCTAATACATATTGAAACCATTTCACATCAAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTTACAATTCACAACACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTCGCAAGTTCTTCGAGTTGCTTATCATTCCCTTTGAATACGCCCGCCGGCATTTTGCCTTTCCCTTCAACAGCAATTTTTTTGATTTCATC > CP006881/2180807‑2181077 | aGCATCGGCCGCTGCCCTAATACATATTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGAc > 3:160945/1‑138 (MQ=255) cGGCCGCTGCCCTAATACATATTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTca > 5:154380/1‑139 (MQ=255) tgcccTAATACATATTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACg > 6:413054/4‑139 (MQ=255) cccTAATACATATTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACg < 5:216266/136‑1 (MQ=255) aaTACATATTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTAttt > 8:166452/1‑139 (MQ=255) aTACATATTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATACTTCACTTTGACAATTCACAATACGTTAtttt > 1:353289/1‑139 (MQ=255) cATATTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCg > 1:19656/1‑139 (MQ=255) tatTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAATTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGgt > 1:329247/1‑139 (MQ=255) tatTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGgt < 2:16812/139‑1 (MQ=255) tatTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGgt > 1:7883/1‑139 (MQ=255) tatTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGgt > 1:429794/1‑139 (MQ=255) tatTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGgt > 1:106181/1‑139 (MQ=255) atTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGgtt > 3:307080/1‑139 (MQ=255) atTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGgtt > 6:209285/1‑139 (MQ=255) atTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGgtt > 4:7530/1‑139 (MQ=255) atTGAAACCATTTCACATCGAATCAACTCTCAGTCTCTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTAATTTTGCgg > 1:437835/1‑137 (MQ=255) 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tttCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGCCGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGaaa > 4:128019/1‑139 (MQ=255) tttCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGaaa > 4:300666/1‑139 (MQ=255) tttCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGaaa > 2:164104/1‑139 (MQ=255) ttCACATCGAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCATTTGATAATAAAAGTATATCCTACCAATTGACAATTCACAATACGGTATTTTGCGGTTGTTTCAGaaa > 6:216205/1‑138 (MQ=255) cgaatcaaCTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAAtttt > 3:146947/3‑138 (MQ=255) aatcaaCTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAAttttg > 4:23978/1‑136 (MQ=255) 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tAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAgctgct > 4:202458/1‑139 (MQ=255) aaaTAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTTGAGCTGCTTAt < 2:7883/139‑1 (MQ=255) taataTGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCAt < 5:413054/139‑1 (MQ=255) taaaaTGACCAAAAAAAAACGCGCACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCAt < 2:168618/139‑1 (MQ=255) atGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTtcc > 2:231592/1‑139 (MQ=255) atGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTACTTCGAGCTGCTTATCATTtcc > 2:311902/1‑139 (MQ=255) tCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCAt < 3:345656/132‑1 (MQ=255) tCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCAt > 4:345656/1‑132 (MQ=255) cATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACATTTCGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCAGTTCCTTTGa > 2:370465/1‑139 (MQ=255) atatAAAAAAGATGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGaa < 8:59110/139‑1 (MQ=255) ataAAAAAGCTGACGCTGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCaa > 8:130138/1‑106 (MQ=255) ataAAAAAGCTGACGCTGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCaa < 7:130138/106‑1 (MQ=255) 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tCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCt < 4:63525/139‑1 (MQ=255) tCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCt < 7:166452/139‑1 (MQ=255) cTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCTTTcc > 3:366824/1‑139 (MQ=255) cTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTAACAATACGTTATTTTTCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTGGAGATTGTTATAATTTGCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTTCCGTTcc > 6:40014/1‑139 (MQ=255) taaAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCt > 1:60463/1‑125 (MQ=255) taaAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCt < 2:60463/125‑1 (MQ=255) taaAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCTTTCCCTTCTACAGc > 8:224443/1‑139 (MQ=255) taaAAGTATATCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCTTTCCCTTCTACAGc > 1:48899/1‑139 (MQ=255) tatCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCTTTCCCTTCTACAGCGAttttt < 5:434300/138‑1 (MQ=255) tatCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCTTTCCCTTCTACAGCGAttttt > 8:123463/1‑138 (MQ=255) tatCCTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCTTTCCCTTCTACAGCGAttttt < 7:123463/138‑1 (MQ=255) ccTTCCATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCTTTCCCTTCTACAGCGATTTTTTTGa > 8:281314/1‑139 (MQ=255) 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1:426356/134‑1 (MQ=255) ccATTTGACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCTTTCCCTTCTACAGCGATTTTTTTg > 2:426356/1‑134 (MQ=255) tttgACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCTTTCCCTTCTACAGCGATTTTTTTGATTTCATc > 4:20233/1‑139 (MQ=255) tttgACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCTTTCCCTTCTACAGCGATTTTTTTGATTTCATc < 3:128019/139‑1 (MQ=255) tttgACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCTTTCCCTTCTACAGCGATTTTTTTGATTTCATc < 7:241293/139‑1 (MQ=255) tttgACAATTCACAATACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTTGCAAGTTCTTCGAGCTGCTTATCATTTCCTTTGAACACACCCGCCGGCATTTTGCCTTTCCCTTCTACAGCGATTTTTTTGATTTCATc < 4:366824/139‑1 (MQ=255) | AGCATCGGCTGCCGTCCTAATACATATTGAAACCATTTCACATCAAATCAACTCTCAGTCTGTAAAAATAATATGTCCATATAAAAAAGCTGACGCCGGGTCAGCTTTTGATAATAAAAGTATATCCTTCCATTTTACAATTCACAACACGTTATTTTGCGGTTGTTTCAGAAATAAATTTCGCAAGTTCTTCGAGTTGCTTATCATTCCCTTTGAATACGCCCGCCGGCATTTTGCCTTTCCCTTCAACAGCAATTTTTTTGATTTCATC > CP006881/2180807‑2181077 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |