Predicted mutation | ||||||
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RA | CP006881 | 2,183,086 | T→A | *148L (TAA→TTA) | U712_10935 ← | Uncharacterized protein ypiF |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP006881 | 2,183,086 | 0 | T | A | 98.4% | 366.2 / ‑4.6 | 122 | *148L (TAA→TTA) | U712_10935 | Uncharacterized protein ypiF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base A (77/43); total (78/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TCTAGGTCACCCCTGCAAACTGACTAAAATAGAAAATATTGCAATAACTCTAGACACCCTCATAATATATGAATCTCTCAGTAAGGTCAATATAGCCAAAATATTGTTTATAAGGAAATGTAAGTGTTTTTATTAGGTGCTCCACAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCTAATATTTTTCTTTTTAAGGAGTCATTTAAATGCTCTAACGGAACAGACGGTGTAACAATGATTTTGCCTAACGCATCCTC > CP006881/2182953‑2183219 | tctAAGTCACCCCTGCAAACTGACTAAAATAGAAAATATTGCAATAACTCTAGACACCCTCATAATATATGAATCTCTCAGCAAGGTCAATATAGCCAAAATATTGTTTATAAGGAAATGTAAGTGTTTTTATAAAGTg > 6:15456/1‑139 (MQ=255) tctAAGTCACCCCTGCAAACTGACTAAAATAGAAAATATTGCAATAACTCTAGACACACTCATAATATATGAATCTCTCAGCAAGGTCAATATAGCCAAAATATTGTTTATAAGGAAATGTAAGTGTTTTTATAAAGTg > 7:88489/1‑139 (MQ=255) gTCACCCCTGCAAACTGACTAAAATAGAAAATATTGCAATAACTCTAGACACCCTCATAATATATGAATCTCTCAGCAAGGTCAATATAGCCAAAATATTGTTTATAAGGAAATGTAAGTGTTTTTATAAAGTGCTCca < 7:98210/139‑1 (MQ=255) gTCACCCCTGCAAACTGACTAAAATAGAAAATATTGCAATAACTCTAGACACCCTCATAATATATGAATCTCTCAGCAAGGTCAATATAGCCAAAATATTGTTTATAAGGAAATGTAAGTGTTTTTATAAAGTGCTCca > 7:429565/1‑139 (MQ=255) 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TCTAGGTCACCCCTGCAAACTGACTAAAATAGAAAATATTGCAATAACTCTAGACACCCTCATAATATATGAATCTCTCAGTAAGGTCAATATAGCCAAAATATTGTTTATAAGGAAATGTAAGTGTTTTTATTAGGTGCTCCACAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCTAATATTTTTCTTTTTAAGGAGTCATTTAAATGCTCTAACGGAACAGACGGTGTAACAATGATTTTGCCTAACGCATCCTC > CP006881/2182953‑2183219 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |