| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,183,199 | G→C | I110M (ATC→ATG) | U712_10935 ← | Uncharacterized protein ypiF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,183,199 | 0 | G | C | 98.9% | 304.5 / ‑4.0 | 94 | I110M (ATC→ATG) | U712_10935 | Uncharacterized protein ypiF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (35/58); total (35/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.79e-01 | |||||||||||
AGGAAATGTAAGTGTTTTTATTAGGTGCTCCACAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCTAATATTTTTCTTTTTAAGGAGTCATTTAAATGCTCTAACGGAACAGACGGTGTAACAATGATTTTGCCTAACGCATCCTCGCTTTTCCAATTTTCATCAGACGTGAGCAGCACAACATGCGGAAATTCTGATATAAGCTCTTCCCGCAAATCCCTAAGTCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTA > CP006881/2183065‑2183334 | aGGAACTGTAAGTGTTTTTATAAAGTGCTCCATAACAGTAACAAAACGTTCAAAATATCAGCATTGCGTTCATACAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCAta < 4:286419/138‑2 (MQ=255)aGGAAATGTAAGTGTTTTTATAAAGTGCTCCATAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCAtt < 3:446553/138‑1 (MQ=255)aGGAAATGTAAGTGTTTTTATAAAGTGCTCCATAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCAtt < 6:42157/138‑1 (MQ=255) aaTGTAAGTGTTTTTATAAAGTGCTCCATAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCAACCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGcc > 7:260783/1‑139 (MQ=255) aTGTAAGTGTTTTTATAAAGTGCTCCATAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCt < 7:409477/139‑1 (MQ=255) tAAGTGTTTTTATTAGGTGCTCCACAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCTAATATTTTTCTTTTTAAGGAGTCATTTAAATGCTCTAACGGAACAGACGGTGTAACAATGATTTTGCCTaa < 2:425726/138‑1 (MQ=255) aGTGTTTTTATAAAGTGCTCCATAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGc < 2:408681/139‑1 (MQ=255) aGTGTTTTTATAAAGTGCTCCATAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGc < 2:75293/139‑1 (MQ=255) tttttATAAAGTGCTCCATAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATc < 4:873/138‑1 (MQ=255) tttATAAAGTGCTCCATAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCt > 5:336794/1‑138 (MQ=255) tttATAAAGTGCTCCATAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCt > 3:397006/1‑138 (MQ=255) ttataaAGTGCTCCATAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTc < 4:277170/138‑1 (MQ=255) ttataaAGTGCTCCATAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTc < 2:300444/138‑1 (MQ=255) aCTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTtcgtc < 3:438127/139‑1 (MQ=255) aCTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTtcgt < 7:277437/138‑3 (MQ=255) gTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTtcgt > 1:304286/1‑133 (MQ=255) tAACAAAACGTTCAAAATTTCATCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTATCGTCAGat < 2:361792/139‑2 (MQ=255) tAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCAtt < 2:270700/100‑1 (MQ=255) tAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCAtt > 1:270700/1‑100 (MQ=255) tAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGat > 7:318327/1‑138 (MQ=255) tAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGat < 7:68669/139‑2 (MQ=255) tAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGat < 5:331648/139‑2 (MQ=255) tAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGat < 8:337489/139‑2 (MQ=255) tAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGat > 8:360552/1‑138 (MQ=255) tAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGat > 1:226690/1‑138 (MQ=255) aaCAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAAc > 7:295193/1‑108 (MQ=255) aaCAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAAc > 5:241492/1‑108 (MQ=255) aaCAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAAc < 8:295193/108‑1 (MQ=255) aaCAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAAc < 6:241492/108‑1 (MQ=255) aCAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGt > 1:133236/1‑139 (MQ=255) aCAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGt > 5:51353/1‑139 (MQ=255) aCAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTAATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGt > 5:58197/1‑139 (MQ=255) aCAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGGTCATCCAAGATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAATTGCTCTAATGGATCAGACGAGGTACGCATCATTTTGCCTATCGCATCCTCCGGTCTCCACGTTTCGTCAGATGt > 2:404460/1‑139 (MQ=255) aaaCGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGag < 7:189483/139‑1 (MQ=255) aaaCGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGag < 7:257877/139‑1 (MQ=255) aaaCGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGag < 6:161753/139‑1 (MQ=255) aaaCGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGag < 5:189907/139‑1 (MQ=255) aaCGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCACCAACTTTCGTCAGATGTGag > 6:434094/1‑138 (MQ=255) cGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCAtt > 7:238216/1‑92 (MQ=255) cGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCAtt < 8:238216/92‑1 (MQ=255) cGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGagcag > 7:430100/1‑139 (MQ=255) ttCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGagcagga > 3:382316/1‑137 (MQ=255) ttCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGagcagga > 4:76220/1‑137 (MQ=255) ttCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTAATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGagcagga < 6:58197/139‑3 (MQ=255) cagcagTGCGTTCATCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCg > 6:17379/1‑138 (MQ=255) aTCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGttat < 2:153970/138‑1 (MQ=255) caaTATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGc > 3:165665/2‑139 (MQ=255) atatTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCAGTTATCAGctc > 6:176230/1‑139 (MQ=255) tttCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTccc > 1:151090/1‑139 (MQ=255) tttCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTccc > 4:198141/1‑139 (MQ=255) ttttAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATGCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCaa < 5:416667/138‑1 (MQ=255) aagAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATcctt < 5:360729/137‑3 (MQ=255) aagAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATcctt < 3:411194/137‑3 (MQ=255) agAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTa < 2:133236/138‑1 (MQ=255) agAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTa < 7:360552/138‑1 (MQ=255) agAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTa < 6:336794/138‑1 (MQ=255) agAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTa < 5:176230/138‑1 (MQ=255) gAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTaa < 5:48506/139‑1 (MQ=255) aGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAg < 2:402990/139‑1 (MQ=255) gTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAg < 3:76220/138‑1 (MQ=255) tAAAAGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCAATTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTg < 2:337926/138‑1 (MQ=255) aaaTTCTCTACTGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGTACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGa < 8:430105/138‑1 (MQ=255) aaaTGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGa < 8:430100/138‑1 (MQ=255) gCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATc < 2:417655/46‑1 (MQ=255) 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tAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTa > 1:423440/1‑121 (MQ=255) tAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTatt > 3:193593/1‑139 (MQ=255) tggAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTatttca < 8:276332/138‑1 (MQ=255) aaCAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTatttcattt < 5:387505/139‑1 (MQ=255) aCAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATg < 8:12988/77‑1 (MQ=255) aCAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATg > 7:12988/1‑77 (MQ=255) cAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGTAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCt > 6:40057/1‑139 (MQ=255) cAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTatttcatttc > 7:25190/1‑138 (MQ=255) gACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTAt < 2:304286/139‑1 (MQ=255) gACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTAt < 8:307295/139‑1 (MQ=255) aCGATGTAACAATCCTTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGGTATTTCATTTCTATc < 4:230456/139‑1 (MQ=255) aCGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATc < 8:25190/139‑1 (MQ=255) aCGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATc < 4:382316/139‑1 (MQ=255) aCGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATc < 6:164124/139‑1 (MQ=255) gtAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACa > 7:272689/1‑138 (MQ=255) tAACAATCATTTTGCCTAACTCATCCTCAGCTCTACAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACTACATGCTGAAAATCAGTTATAAGCGCTTCCCGATAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAAGat < 6:42062/138‑1 (MQ=255) tAACAATCATTTTGCCTAACGGATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCACGAAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat < 8:88489/138‑1 (MQ=255) tAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat < 3:156393/138‑1 (MQ=255) tAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat < 7:121180/138‑1 (MQ=255) tAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat < 6:51353/138‑1 (MQ=255) tAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat < 4:397006/138‑1 (MQ=255) tAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat < 5:224643/138‑1 (MQ=255) aaTCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGCACGGTTATTTCATTTCTATAAACATATGta > 4:250285/1‑139 (MQ=255) aaTCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGta < 7:416924/139‑1 (MQ=255) | AGGAAATGTAAGTGTTTTTATTAGGTGCTCCACAACTGTAACAAAACGTTCAAAATTTCAGCAGTGCGTTCATCTAATATTTTTCTTTTTAAGGAGTCATTTAAATGCTCTAACGGAACAGACGGTGTAACAATGATTTTGCCTAACGCATCCTCGCTTTTCCAATTTTCATCAGACGTGAGCAGCACAACATGCGGAAATTCTGATATAAGCTCTTCCCGCAAATCCCTAAGTCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTA > CP006881/2183065‑2183334 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |