| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,183,268 | T→C | S87T (TCA→ACG) | U712_10935 ← | Uncharacterized protein ypiF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,183,268 | 0 | T | C | 97.8% | 291.8 / NA | 92 | S87T (TCA→ACG) | U712_10935 | Uncharacterized protein ypiF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (32/58); minor base A (1/1); total (33/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATCTAATATTTTTCTTTTTAAGGAGTCATTTAAATGCTCTAACGGAACAGACGGTGTAACAATGATTTTGCCTAACGCATCCTCGCTTTTCCAATTTTCATCAGACGTGAGCAGCACAACATGCGGAAATTCTGATATAAGCTCTTCCCGCAAATCCCTAAGTCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATATGGGGGCAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCCAGTTCTTCTGACAGAAGCTGCG > CP006881/2183136‑2183398 | aTCCAATATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGttat < 2:153970/138‑1 (MQ=255) caaTATTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGc > 3:165665/2‑139 (MQ=255) atatTTTTCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCAGTTATCAGctc > 6:176230/1‑139 (MQ=255) tttCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTccc > 1:151090/1‑139 (MQ=255) tttCTTTTTAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTccc > 4:198141/1‑139 (MQ=255) ttttAAAGAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATGCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCaa < 5:416667/138‑1 (MQ=255) aagAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATcctt < 5:360729/137‑3 (MQ=255) aagAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATcctt < 3:411194/137‑3 (MQ=255) agAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTa < 6:336794/138‑1 (MQ=255) agAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTa < 2:133236/138‑1 (MQ=255) agAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTa < 7:360552/138‑1 (MQ=255) agAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTa < 5:176230/138‑1 (MQ=255) gAGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTaa < 5:48506/139‑1 (MQ=255) aGTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAg < 2:402990/139‑1 (MQ=255) gTCATTTAAATGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAg < 3:76220/138‑1 (MQ=255) tAAAAGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCAATTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTg < 2:337926/138‑1 (MQ=255) aaaTTCTCTACTGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGTACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGa < 8:430105/138‑1 (MQ=255) aaaTGCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGa < 8:430100/138‑1 (MQ=255) gCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCATATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCTTTATCAGCTCTACCCGCAAATCCTTAAGCCCTTTAACGGt > 6:290677/1‑139 (MQ=255) gCTCTAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGt > 2:192723/1‑139 (MQ=255) ctctAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAACTTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGt > 2:106618/1‑138 (MQ=255) tctAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCa < 1:418247/115‑1 (MQ=255) tctAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCa > 2:418247/1‑115 (MQ=255) tAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTa < 2:423440/121‑1 (MQ=255) tAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTa > 1:423440/1‑121 (MQ=255) tAATGGAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTatt > 3:193593/1‑139 (MQ=255) tggAACAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTatttca < 8:276332/138‑1 (MQ=255) aaCAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTatttcattt < 5:387505/139‑1 (MQ=255) cAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGTAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCt > 6:40057/1‑139 (MQ=255) cAGACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTatttcatttc > 7:25190/1‑138 (MQ=255) gACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTAt < 2:304286/139‑1 (MQ=255) gACGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTAt < 8:307295/139‑1 (MQ=255) aCGATGTAACAATCCTTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGGTATTTCATTTCTATc < 4:230456/139‑1 (MQ=255) aCGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATc < 6:164124/139‑1 (MQ=255) aCGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATc < 8:25190/139‑1 (MQ=255) aCGATGTAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATc < 4:382316/139‑1 (MQ=255) gtAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACa > 7:272689/1‑138 (MQ=255) tAACAATCATTTTGCCTAACTCATCCTCAGCTCTACAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACTACATGCTGAAAATCAGTTATAAGCGCTTCCCGATAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAAGat < 6:42062/138‑1 (MQ=255) tAACAATCATTTTGCCTAACGGATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCACGAAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat < 8:88489/138‑1 (MQ=255) tAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat < 6:51353/138‑1 (MQ=255) tAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat < 5:224643/138‑1 (MQ=255) tAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat < 7:121180/138‑1 (MQ=255) tAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat < 4:397006/138‑1 (MQ=255) tAACAATCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat < 3:156393/138‑1 (MQ=255) aaTCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGCACGGTTATTTCATTTCTATAAACATATGta > 4:250285/1‑139 (MQ=255) aaTCATTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGta < 7:416924/139‑1 (MQ=255) tcaTTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTatttca > 6:97013/3‑119 (MQ=255) tcaTTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTatttca < 5:97013/117‑1 (MQ=255) tcaTTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATc > 1:425987/3‑127 (MQ=255) tcaTTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATc < 2:425987/125‑1 (MQ=255) aTTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTatttcattt > 4:68068/1‑120 (MQ=255) aTTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTatttcattt < 3:68068/120‑1 (MQ=255) aTTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGtat > 1:331435/1‑136 (MQ=255) aTTTTGCCTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGtat < 2:331435/136‑1 (MQ=255) ttttGCCTAACGCATCCTCAGCTCTACAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAgg < 5:212798/139‑1 (MQ=255) ccTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAggcggaa < 5:58953/139‑3 (MQ=255) ccTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAggcggaa < 7:105845/139‑3 (MQ=255) ccTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAggcggaa < 2:37657/139‑3 (MQ=255) ccTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAggcggaa < 2:420980/139‑3 (MQ=255) ccTAACGCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAggcggaa < 5:17379/139‑3 (MQ=255) ccTAACGCATCCTCAGCTCACCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAggcggaa < 5:434094/139‑3 (MQ=255) gCATCCTCAGCTCTCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAat < 5:40057/139‑1 (MQ=255) agctctCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATAccc < 8:260783/132‑1 (MQ=255) agctctCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATAccc < 1:192723/132‑1 (MQ=255) agctctCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGt < 2:151090/134‑1 (MQ=255) agctctCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGt < 6:119896/134‑1 (MQ=255) agctctCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGt > 7:10656/6‑139 (MQ=255) agctctCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCAGt > 2:374840/6‑139 (MQ=255) gctctCCAACTTTCGTGAGATGTGAGCATGACAACATTCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTc < 2:275337/135‑1 (MQ=255) ctctCCAACTTTCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTcc > 7:273481/4‑139 (MQ=255) actttCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAAc < 5:28070/137‑1 (MQ=255) ctttCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCTGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACt < 6:78290/138‑1 (MQ=255) ttCGTCAGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCTTCCCTTTAACTGc > 1:275337/1‑139 (MQ=255) gtcaGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACa < 4:39384/93‑1 (MQ=255) gtcaGATGTGAGCAGGACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACa > 3:39384/2‑94 (MQ=255) gtcaGATGAGAGCAGGACTACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTACCGCAAATCCTTATGCCCTTGAACGGTTAATTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGAAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCta < 2:35025/138‑2 (MQ=255) agcaggACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTcaa < 4:20181/133‑3 (MQ=255) agcaggACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTcaa > 3:20181/1‑131 (MQ=255) agcaggACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGttctt > 2:337727/1‑139 (MQ=255) ggacaacaTGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTATCTGCCTTTCAAGTtcttct > 7:161498/3‑137 (MQ=255) gacaacaTGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat < 3:199102/79‑1 (MQ=255) gacaacaTGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat > 4:199102/2‑80 (MQ=255) gacaacaTGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTATATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACACGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGa > 1:423232/2‑138 (MQ=255) caacaTGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTatttcat > 6:246126/1‑66 (MQ=255) caacaTGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTatttcat < 5:246126/66‑1 (MQ=255) caTGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat < 7:240606/75‑1 (MQ=255) caTGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat > 8:240606/1‑75 (MQ=255) caTGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAg < 5:20836/139‑1 (MQ=255) ggAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat > 3:129213/1‑70 (MQ=255) ggAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACat < 4:129213/70‑1 (MQ=255) ggAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCg > 2:52079/1‑139 (MQ=255) ggAAATTCCGTTATCAGCTCTGCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCGTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCg > 3:228603/1‑139 (MQ=255) | ATCTAATATTTTTCTTTTTAAGGAGTCATTTAAATGCTCTAACGGAACAGACGGTGTAACAATGATTTTGCCTAACGCATCCTCGCTTTTCCAATTTTCATCAGACGTGAGCAGCACAACATGCGGAAATTCTGATATAAGCTCTTCCCGCAAATCCCTAAGTCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATATGGGGGCAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCCAGTTCTTCTGACAGAAGCTGCG > CP006881/2183136‑2183398 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |