| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,183,376 | C→A | L51L (CTG→CTT) | U712_10935 ← | Uncharacterized protein ypiF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,183,376 | 0 | C | A | 99.2% | 395.0 / NA | 125 | L51L (CTG→CTT) | U712_10935 | Uncharacterized protein ypiF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base A (72/52); minor base T (0/1); total (72/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.24e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
AGCAGCACAACATGCGGAAATTCTGATATAAGCTCTTCCCGCAAATCCCTAAGTCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATATGGGGGCAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCCAGTTCTTCTGACAGAAGCTGCGTGAATTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAGCTTGTAAATAGTCCTTGGCAT > CP006881/2183245‑2183509 | agcaggACAACATGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGttctt > 2:337727/1‑139 (MQ=255) ggacaacaTGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTATCTGCCTTTCAAGTtcttct > 7:161498/3‑137 (MQ=255) caTGCGGAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAg < 5:20836/139‑1 (MQ=255) ggAAATTCCGTTATCAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCg > 2:52079/1‑139 (MQ=255) ccgttatcAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTaaact < 3:183574/134‑3 (MQ=255) ccgttatcAGCTCTTCCCGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTaaact < 8:318327/134‑3 (MQ=255) cccGCAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCcgccgc > 1:41089/1‑139 (MQ=255) ccGCATATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCcgccgc < 3:361388/138‑1 (MQ=255) cGCAAATCCTTCAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCa < 4:165665/139‑1 (MQ=255) cAAATCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCAtt > 8:380737/1‑139 (MQ=255) aaaTCCTTAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCAttt > 5:14161/1‑139 (MQ=255) cttAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGACGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTaaaa > 4:96669/3‑139 (MQ=255) cttAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTaaaa > 4:102907/3‑139 (MQ=255) cttAAGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTaaa < 4:193593/136‑1 (MQ=255) aaGCCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAAt < 2:41089/137‑1 (MQ=255) agcccTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATgg < 3:408721/135‑1 (MQ=255) cTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt < 8:10656/139‑1 (MQ=255) cTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt < 5:122176/139‑1 (MQ=255) cTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt < 6:14161/139‑1 (MQ=255) cTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt < 3:198141/139‑1 (MQ=255) ttGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCATGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt > 4:33943/1‑138 (MQ=255) ttGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt > 7:115644/1‑138 (MQ=255) ttGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt > 5:137340/1‑138 (MQ=255) tGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACAAATGTATAACGAGGAAGTAAATATACACGTCCCTTTAACTGGCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTACCCTGTCTCCGCCGCCAATTTATAATGAttatta > 1:196440/1‑138 (MQ=255) gTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGTCGGAAGTAAATATAAACGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCATTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTa > 7:176584/1‑139 (MQ=255) ttATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTAt > 2:91640/1‑139 (MQ=255) ttATTTCATTTCTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTAt > 3:322663/1‑139 (MQ=255) ttATTTCATTTCAATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACACGTCCCTTTAACTGACTTTCAAGATATACTCAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATAGTTATTAACACTTaa > 7:369566/1‑138 (MQ=255) atttcatttcTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATg < 7:380737/138‑1 (MQ=255) atttcatttcTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGt > 3:228548/1‑139 (MQ=255) atttcatttcTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGt > 3:234846/1‑139 (MQ=255) atttcTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGttaatt < 8:273481/139‑1 (MQ=255) tcTATCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTtaattaat > 5:404885/1‑139 (MQ=255) aTCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTATCTGCCTTTCAAGTTCTTCTGCGAGCAGCTGCGTAAACTCGCCGTTCACCGCCGCCATGTTGAAAAGGTTATTATACCTTATGTtaatttatttt > 6:285631/1‑136 (MQ=255) tCAACATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTa > 8:50637/1‑139 (MQ=255) cATATGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGa > 3:443902/1‑138 (MQ=255) tatGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAg < 4:228548/139‑1 (MQ=255) tatGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAg < 1:354288/139‑1 (MQ=255) tatGTATAAGGCGGAAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAg < 4:234846/139‑1 (MQ=255) ggcggaaGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGTTATGACAGCGGTATCaa > 1:4872/7‑139 (MQ=255) ggcggaaGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTAt > 1:120054/7‑136 (MQ=255) ggcggaaGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCaa > 3:323116/7‑139 (MQ=255) ggcggaaGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCaa > 4:415843/7‑139 (MQ=255) gaaGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt < 8:185852/95‑1 (MQ=255) gaaGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt > 7:185852/3‑97 (MQ=255) gaaGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGt > 3:311269/3‑138 (MQ=255) aaGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGATAGAAGCTGCGGAAACTCGCCTTTCTCCTCCGCCATTTTAAAAAGGTTATTAACCCTTATGTTTATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTaa > 1:222794/2‑139 (MQ=255) aaGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAg < 6:184837/124‑1 (MQ=255) aaGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAg > 5:184837/2‑125 (MQ=255) aaGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTAt > 4:198624/2‑131 (MQ=255) aaGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTAt < 3:198624/130‑1 (MQ=255) aaTATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAATCTGAGTTAACTCGCCTTTCTACGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGAGGTATCAATGTAATCCtt < 7:171581/139‑1 (MQ=255) aaTATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCtt < 8:152047/139‑1 (MQ=255) tataCCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAg < 4:228603/139‑1 (MQ=255) taCCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAGCt < 1:52079/139‑1 (MQ=255) aCCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAGCtt > 3:265089/1‑139 (MQ=255) aCCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCAGTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAGCtt > 6:360451/1‑139 (MQ=255) cccGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAGCtt < 7:57449/138‑1 (MQ=255) cccGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAGCtt < 4:323116/138‑1 (MQ=255) cGTCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATg < 4:428824/77‑1 (MQ=255) cGTCCCTTTAACTGACTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATg > 3:428824/1‑77 (MQ=255) tcacTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATg < 8:335820/72‑1 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTaaaa > 1:143067/1‑73 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTaaaa < 2:143067/73‑1 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAAt < 5:311086/74‑1 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAAt > 6:226329/1‑74 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAAt > 6:311086/1‑74 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATg > 7:335820/1‑75 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt > 5:152223/1‑81 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt > 5:244157/1‑81 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt > 5:238190/1‑81 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt < 6:152223/81‑1 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt < 6:244157/81‑1 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGttaatt > 4:235824/1‑97 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAg < 4:335727/110‑1 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAg > 3:335727/1‑110 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTa > 4:43887/1‑115 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTa < 3:43887/115‑1 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGt < 1:72305/122‑1 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGt > 2:72305/1‑122 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAGCTTGTaaa > 6:367487/1‑139 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAGCTTGTaaa > 5:415155/1‑139 (MQ=255) tCCCTTTAACTGCCATTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGttaatt < 3:235824/97‑1 (MQ=255) ccTTTAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCATTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAGCTTGTAAATa > 8:414996/1‑139 (MQ=255) tttAACTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAGCTTGTAAATAGt > 4:359421/1‑139 (MQ=255) aaCTGCCTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAGCTTGTAAATAGTCCt > 2:171432/1‑139 (MQ=255) ccTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTaaaa > 6:20932/1‑61 (MQ=255) ccTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTaaaa < 5:20932/61‑1 (MQ=255) ccTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt > 1:123271/1‑69 (MQ=255) ccTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt < 2:123271/69‑1 (MQ=255) ccTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATg > 8:146544/1‑109 (MQ=255) ccTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATg < 7:146544/109‑1 (MQ=255) ccTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAGCtt > 1:400878/1‑122 (MQ=255) ccTTTCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAGCTTGTAAATAGTCCTTGGCa > 1:61147/1‑139 (MQ=255) cTTTCTAGTTCTTCTGAGAGTTTCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCAGCCGGCTTTTTAAAATTGTTATTTTGCCTTATGTTAATTATTGGTATTACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAGCTTGTAAATAGTGGTTGGCAt < 8:369566/139‑1 (MQ=255) tttCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAAt > 5:250623/1‑60 (MQ=255) tttCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAAt < 6:250623/60‑1 (MQ=255) tttCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt < 5:188327/67‑1 (MQ=255) tttCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGttatt > 6:188327/1‑67 (MQ=255) tttCAAGTTCTTCTGAGAGAAGCTGCGTAAACTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTa > 7:364932/1‑101 (MQ=255) | AGCAGCACAACATGCGGAAATTCTGATATAAGCTCTTCCCGCAAATCCCTAAGTCCTTGAACGGTTATTTCATTTCTATCAACATATGTATATGGGGGCAGTAAATATACCCGTCCCTTTAACTGCCTTTCCAGTTCTTCTGACAGAAGCTGCGTGAATTCGCCTTTCTCCGCCGCCATTTTAAAATGGTTATTAACCCTTATGTTAATTAATGGTATGACAGCGGTATCAATGTAATCCTTAGCTTGTAAATAGTCCTTGGCAT > CP006881/2183245‑2183509 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |