Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 2,185,016 | A→G | A150A (GCT→GCC) | U712_10945 ← | TPR repeat‑containing protein ypiA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 2,185,016 | 0 | A | G | 96.2% | 242.5 / NA | 80 | A150A (GCT→GCC) | U712_10945 | TPR repeat‑containing protein ypiA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (32/45); minor base T (2/1); total (34/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TACCACGGAATGGCATCCTCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCGGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCTCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAAGCTCCCTGAGTAAAGTAAAGTTCCCCCAGTGCAAAATCAATAATGGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCTTGTAAAAGCTTTTGTTCACTGACTTCGAATAACCCCTGCATCTGGTAAAGATCCGCCATAAGC > CP006881/2184885‑2185151 | tACCATGGAATGGCATCCTCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCt < 5:381688/139‑1 (MQ=255) catggAATGGCATCCTCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGag < 7:360586/136‑1 (MQ=255) catggAATGGCATCCTCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTATTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGag < 2:383988/136‑1 (MQ=255) tggAATGGCATCCTCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGATGTTTTTAAATATTTAACCGCTTTTGCATGGGCGCACTGagg > 1:322315/2‑137 (MQ=255) tggAATGGCATCCTCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATCGACATTAACGCCCCCGATCTCACTATGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGagc > 8:35294/2‑137 (MQ=255) gAATGGCATCCTCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGagcaa > 4:89200/1‑138 (MQ=255) aTGGCATCCTCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGagcaaagt < 6:271266/139‑1 (MQ=255) cATCCTCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTTAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCGGagcaaagtaacg > 5:10987/1‑137 (MQ=255) cATCCTCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGcaaagtaaag > 5:109523/1‑139 (MQ=255) cATCCTCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGcaaagtaaag > 6:318129/1‑139 (MQ=255) tCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGag > 8:327510/1‑124 (MQ=255) tCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGag < 7:327510/124‑1 (MQ=255) tCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTctc > 4:63904/1‑137 (MQ=255) tCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTctc > 1:42406/1‑137 (MQ=255) tCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTctc > 2:53605/1‑137 (MQ=255) aaaTTCACCTGAGGAACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAATATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTctcc < 3:323868/138‑1 (MQ=255) aTTCACCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAg > 2:426321/1‑139 (MQ=255) aCCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCa < 3:89200/139‑1 (MQ=255) aCCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCa < 3:172027/139‑1 (MQ=255) aCCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCa < 6:7658/139‑1 (MQ=255) aCCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCa < 5:306522/139‑1 (MQ=255) aCCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCa < 7:129497/139‑1 (MQ=255) aCCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCa < 7:185208/139‑1 (MQ=255) aCCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCa < 7:283833/139‑1 (MQ=255) aCCTGAGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCa < 1:426321/139‑1 (MQ=255) aGGCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCACAGCCGTTGGTTTAAAATATTGAACAGCATTTGCATATGCTCCCTGAGCAAAGAAAAGTTCTCCCAGTGCAAAAt > 3:284971/1‑138 (MQ=255) ggCACTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCa < 4:32309/139‑1 (MQ=255) cTTAACGTTTCTGACAGTCTTTGATGTACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCACTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCaataa < 2:370843/139‑1 (MQ=255) cTTAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCaataa > 8:186965/1‑139 (MQ=255) tAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCaataaca > 8:435227/1‑137 (MQ=255) tAACGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCaataa > 3:448800/1‑137 (MQ=255) cGATTCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCaataacaggt > 6:413042/1‑134 (MQ=255) ttCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCa < 3:147962/139‑1 (MQ=255) ttCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCa < 3:400809/139‑1 (MQ=255) ttCTGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCa < 7:186965/139‑1 (MQ=255) ccAGTCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTc < 5:318129/139‑1 (MQ=255) tCTTTGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGa < 2:42406/139‑1 (MQ=255) tGATGGACATTAACGCCCCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGaa < 6:109523/136‑1 (MQ=255) cccccGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATATGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCACAGTGCAAAATCAATAAAAGGTTCATTTTCCAGAATGGACTTTGCCTGGaaaa > 7:86811/4‑139 (MQ=255) ccccGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCaat > 6:321587/3‑100 (MQ=255) ccccGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCaat < 5:321587/98‑1 (MQ=255) ccccGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAg > 3:211510/3‑139 (MQ=255) cccGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGc > 2:220820/2‑139 (MQ=255) agtctGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGACCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATATCAGGTTCATTGTCCAGATTGGACTTTTCCGGTATCAGCTTTAGTTCa > 4:270210/3‑139 (MQ=255) aCTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATCTTGAACCGCTTTTGCCTAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCttt < 2:347689/133‑1 (MQ=255) aCTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCtt < 4:448800/132‑1 (MQ=255) aCTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTg < 6:165222/135‑1 (MQ=255) aCTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGttga > 6:135783/1‑137 (MQ=255) aCTCTGCTCCTCAGCCGTTGGTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCAAGGGCTCCCAGTGCAAACTTAAGTTCACCCAGGGCACAATGAATTACAGGTGCATTGGCCAGCTTGGACTTTGCCTGGAATAGGGTTTGttga > 2:437522/1‑137 (MQ=255) ctctGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCAc < 7:35294/139‑1 (MQ=255) gctGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACt < 2:316495/138‑1 (MQ=255) tGCTCCTCAGCCGTTGGTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACt < 5:15500/137‑1 (MQ=255) gCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGaaa < 6:296349/122‑1 (MQ=255) gCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGaaa > 5:296349/1‑122 (MQ=255) ctcctcATCCGGTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACTGAc < 5:90855/138‑1 (MQ=255) ctcctcAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACt > 8:274125/1‑135 (MQ=255) ctcctcAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACt < 7:274125/135‑1 (MQ=255) ctcctcAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACTGAc < 7:435227/138‑1 (MQ=255) ctcctcAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACTGACt > 4:405193/1‑139 (MQ=255) ctcctcAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGGAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATAAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGCCTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGGTCCCTGACt > 3:267441/1‑139 (MQ=255) aggcGTTGTTTTATAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTTATCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCATAATTGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACTGACTTCGAAt < 1:54389/136‑1 (MQ=255) aGCCGTTTTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTCCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCACAGTCCAAAATCAATAACAGGTTCATTTTCCAAATTTGCCTTTGCCTTGAAAAGATTTTGTTAACTGACTTAGaa > 6:429250/1‑138 (MQ=255) aGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCa < 4:157074/88‑1 (MQ=255) aGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCa > 3:157074/1‑88 (MQ=255) gttgttTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCaataa > 5:67206/1‑76 (MQ=255) gttgttTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCaataa < 6:67206/76‑1 (MQ=255) ttAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACTGACTTCGAATAACCCCTGc < 1:53605/138‑1 (MQ=255) aaaTAGTGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCATGAGCAAAGTAAAGTTCACCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACTGACTTCGAATAACCCCTGCATc < 2:322315/138‑1 (MQ=255) ttGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACTGACTTCGAATAACCCCTGCATCTGATa > 3:150930/1‑138 (MQ=255) ttGAACCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACTGACTTCGAATAACCCCTGCATCTGATa > 5:422229/1‑138 (MQ=255) aCCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACTGAGTTCGAATAACCCCTGCATCTGATAAAGAt < 4:323238/139‑1 (MQ=255) aCCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACTGACTTCGAATAACCCCTGCATCTGATAAAGAt < 4:147891/139‑1 (MQ=255) aCCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACTGACTTCGAATAACCCCTGCATCTGATAAAGAt < 1:220820/139‑1 (MQ=255) aCCGCTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAAAAACAGGTTCATTGTCCAGTATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACTGACATCGAATAACCCCTGCATCTGATAAAGAt < 5:429250/139‑1 (MQ=255) ccGCTTTTGCATATGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACTGACTTCGAATAACCCCTGCATCTGATAAAGATc < 5:376796/139‑1 (MQ=255) cTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCaataa < 7:18/54‑1 (MQ=255) cTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCaataa > 8:18/1‑54 (MQ=255) cTTTTGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACTGACTTCGAATAACCCCTGCATCTGATAAAGATCCGc > 7:284282/1‑139 (MQ=255) tGCATAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCAGTGCAAAATCAATAACAGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTGGAAAAGCTTTTGTTCACTGACTTCGAATAACCCCTGCATCTGATAAAGATCCGCCAt < 2:90988/138‑1 (MQ=255) aTAGGCTCCCTGAGCAAAGTAAAGTTCTCCCATTGAAAAATCAATAAAATGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCCTTGAAAAGCTTTTGTTCACTGACTTCGAATAACCCCTGAATCTGATAAAGATCCGCCATAagc < 2:14782/139‑1 (MQ=255) | TACCACGGAATGGCATCCTCAAATTCACCTGAGGCACTTAACGATTCGGCCAGTCTTTGATGGACATTAACGCCTCCGATCTCACTCTGCTCCTCAGCCGTTGTTTTAAAATATTGAACCGCTTTTGCATAAGCTCCCTGAGTAAAGTAAAGTTCCCCCAGTGCAAAATCAATAATGGGTTCATTGTCCAGAATGGACTTTGCTTGTAAAAGCTTTTGTTCACTGACTTCGAATAACCCCTGCATCTGGTAAAGATCCGCCATAAGC > CP006881/2184885‑2185151 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |