| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP006881 | 520,987 | A→G | intergenic (+506/‑454) | U712_02495 → / → U712_02500 | Uncharacterized protein yddT/putative protease ydeA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP006881 | 520,987 | 0 | A | G | 99.1% | 371.2 / NA | 114 | intergenic (+506/‑454) | U712_02495/U712_02500 | Uncharacterized protein yddT/putative protease ydeA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (72/40); minor base T (0/1); total (72/42) | |||||||||||
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Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
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1:209377/1‑137 (MQ=255) tttACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAATTGTGTTGTGGAATATTGTTGGACTTTTTAGCAAAGAATCAGTAAAACAAGCACAGCAAGCAAATTAAAAGTCATAAAGTTGGGAaag > 7:102432/1‑137 (MQ=255) tttACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAATTGTGTTGTGGAATATTGTTGGACTTTTTAGCAAAGAATCAGTAAAACAAGCACAGCAAGCAAATTAAAAGTCATAAAGTTGGGAaag > 5:321708/1‑137 (MQ=255) tttACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAATTGTGTTGTGGAATATTGTTGGACTTTTTAGCAAAGAATCAGTAAAACAAGCACAGCAAGCAAATTAAAAGTCATAAAGTTGGGAaag > 4:71789/1‑137 (MQ=255) cTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAATTGTGTTGTGGAATATTGTTGGACTTTTTAGCAAAGAATCAGTAAAACAAGCACAGCAAGCAAATTAAAAGTCATAAAGTTGGGAAAGAAGGAt < 1:60000/139‑1 (MQ=255) cTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAATTGTGTTGTGGAATATTGTTGGACTTTTTAGCAAAGAATCAGTAAAACAAGCACAGCAAGCAAATTAAAAGTCATAAAGTTGGGAAAGAAGGAt < 2:442978/139‑1 (MQ=255) aaCCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAATTGTGTTGTGGAATATTGTTGGACTTTTTAGCAAAGAATCAGTAAAACAAGCACAGCAAGCAAATTAAAAGTCATAAAGTTGGGAAAGAAGGATGt < 2:171356/139‑1 (MQ=255) aCCAAGTAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAATTGTGTTGTGGAATATTGTTGGACTTTTTAGCAAAGAATCAGTAAAACAAGCACAGCAAGCAAATTAAAAGTCATAAAGTTGGGAAAGAAGGATGt < 5:214934/138‑1 (MQ=255) aCCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAATTGTGTTGTGGAATATTGTTGGACTTTTTAGCAAAGAATCAGTAAAACAAGCACAGCAAGCAAATTAAAAGTCATAAAGTTGGGAAAGAAGGATGt < 2:35739/138‑1 (MQ=255) aCCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAATTGTGTTGTGGAATATTGTTGGAATTTTTAGCAAAGAATCAGTAAAACAAGCACAGCAAGCAAATTAAAAGTCATAAAGTTGGGAAAGAAGGATGt < 1:36306/138‑1 (MQ=255) cAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTTATAATAGCTTCTGTAATTGTGTTGTGGAATATTGTTGGACTTTTTAGCAAAGAATCAGTAAAACAAGCACAGCAAGCAAATTAAAAGTCATAAAGTTGGGAAAGAAGGATGTTAc < 4:297202/139‑1 (MQ=255) cAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAATTGTGTTGTGGAATATTGTTGGACTTTTTAGCAAAGAATCAGTAAAACAAGCACAGCAAGCAAATTAAAAGTCATAAAGTTGGGAAAGAAGGATGTTAc < 1:441277/139‑1 (MQ=255) | TAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTTTTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAAAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAATTGTGTTGTGGAATATTGTTGGACTTTTTAGCAAAGAATCAGTAAAACAAGCACAGCAAGCAAATTAAAAGTCATAAAGTTGGGAAAGAAGGATGTTAC > CP006881/520853‑521122 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |