| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,187,232 | A→G | I332I (ATT→ATC) | U712_10960 ← | Prephenate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,187,232 | 0 | A | G | 100.0% | 222.1 / NA | 68 | I332I (ATT→ATC) | U712_10960 | Prephenate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (33/35); total (33/35) | |||||||||||
TTTCATTATTTTCCACCTCAATCAGCATAAAAAGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCGTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCTTCTCGTGTTTCAATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATAGCCGTTATCTCGGAAATCACACCGGGATGATCGGGAACATCCACATATAAATCGTAAAATGCAGGTATCGCGCCCTTCTGCCG > CP006881/2187095‑2187360 | tttCATT‑TTTTCCACCTCAATCAGCATAAAAAGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCgat < 7:177574/139‑1 (MQ=255) tcattttttCCACCTCAATCAGCATAAAAAGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCgata < 8:402514/133‑1 (MQ=255) ttttttCCACCTCAATCAGCATAAAAAGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGc < 2:86604/137‑1 (MQ=255) tttCCACCTCAATCAGCATAAAAAGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCgg < 7:360579/138‑1 (MQ=255) tCCACCTCAATCAGCATAAAAAGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGat < 1:18037/138‑1 (MQ=255) tCCACCTCAATCAGCATAAAAAGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGat < 6:33851/138‑1 (MQ=255) tCCACCTCAATCAGCATAAAAAGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGat < 5:300033/138‑1 (MQ=255) tCCACCTCAATCAGCATAAAAAGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGat < 2:197781/138‑1 (MQ=255) ccTCAATCAGCATAAAAAGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCg > 1:74299/1‑139 (MQ=255) ccTCAATCAGCATAAAAAGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCg < 2:300586/139‑1 (MQ=255) ccTCAATCAGCATAAAAAGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCg < 7:262490/139‑1 (MQ=255) aaTCAGCATATAAAGTTTCATATTCCGCCCGGTCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGa < 3:426494/138‑1 (MQ=255) aaTCAGCATAAAAAGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGa < 3:165070/138‑1 (MQ=255) cATAAAAAGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATTCGGATATTCGTGATACTGAt > 7:287350/1‑139 (MQ=255) aaaaGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATgcg < 3:283283/138‑1 (MQ=255) ttCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCg > 1:19436/1‑137 (MQ=255) ttCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCg > 7:430091/1‑137 (MQ=255) ttCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTAGTGATACTGATGCGCTCCg > 8:251826/1‑137 (MQ=255) cGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCt > 3:205878/1‑133 (MQ=255) cGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATAACCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGAt < 7:424069/138‑1 (MQ=255) cTTCAATGCATTGTTCTGCCCGTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCGCCGCAGCTAAGATCGCTGTTAt < 2:237180/139‑1 (MQ=255) aTGCATTGTTCTGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCgg < 4:205878/139‑1 (MQ=255) tGCCCTTTTGTGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACAccc > 7:103474/1‑138 (MQ=255) tGCCCTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATTCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGGTTTTATCTCGGATATTACAccc > 7:72598/1‑138 (MQ=255) cccTTTTGCGGTCGTCCTCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATACCGTTAATATACTCTCGTGTTTCGATAATGCGGCTATTCGTGATTCTGATGCGCGCCGCAGCTAAGATAGCTGTTATCTAGGATATTACACCcgg > 2:403945/1‑139 (MQ=255) cccTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCgataat > 5:95659/1‑73 (MQ=255) cccTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCgataat < 6:95659/73‑1 (MQ=255) cccTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATTATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCcgg > 7:183922/1‑139 (MQ=255) cccTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCg > 3:173922/1‑102 (MQ=255) cccTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCg < 4:173922/102‑1 (MQ=255) cccTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTAtc < 6:403118/122‑1 (MQ=255) cccTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTAtc > 5:403118/1‑122 (MQ=255) cccTTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACAcc < 8:119648/136‑1 (MQ=255) cccTTTTGCGGTCGTCATCAGAATGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACAcc < 8:209383/136‑1 (MQ=255) ccttttGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAACTCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGga < 2:122822/136‑1 (MQ=255) ttGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGAt < 3:349968/107‑1 (MQ=255) ttGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGAt > 4:349968/1‑107 (MQ=255) ttGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGgatgat > 5:327807/1‑139 (MQ=255) ttGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCATTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATTCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGgatgat > 1:201789/1‑139 (MQ=255) tGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTGTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGgatgat < 3:87160/138‑1 (MQ=255) cGGTCGTGATGAGACAGAAAAATGATCGTTTAAATCCCGTTAATATACTGTGGGTGTTAGATTATGCGGTTATTCGTGTTTCTGTTTCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGGTATCTAGGATTTTACCCCCGGCTGATCgg > 2:191320/1‑139 (MQ=255) ggTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCggg > 5:313491/1‑139 (MQ=255) gtcgtcATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCgggt > 6:425829/1‑138 (MQ=255) gtcgtcATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATACTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTAGTGATACTGATTCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCggg > 2:137171/1‑138 (MQ=255) gtcATCAGACTGAATACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGGTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCGGGTACa < 4:359708/139‑1 (MQ=255) atcaGACTGAAAACTGATCCTTAAACTCCCGATAATATCCTCTCGGGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGAGGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCGGGTACATcc < 8:408980/139‑1 (MQ=255) atcaGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCGGGTACATc < 2:19436/138‑1 (MQ=255) atcaGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCGGGTACATc < 5:53910/138‑1 (MQ=255) atcaGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCATTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCGGGTACATc < 2:201789/138‑1 (MQ=255) aCTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCGGGTACATCCACata > 5:45805/1‑139 (MQ=255) tGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTAtctc < 5:1081/101‑1 (MQ=255) tGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTAtctc > 6:1081/1‑101 (MQ=255) aaaaCTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCg > 5:99865/1‑59 (MQ=255) aaaaCTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCg < 6:99865/59‑1 (MQ=255) aaaaCTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGAt < 1:42215/87‑1 (MQ=255) aaaaCTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGAt > 2:42215/1‑87 (MQ=255) aaaaCTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCGGGTACATCCACATATaaa > 4:343723/1‑139 (MQ=255) aaaaCTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCGGGTACATCCACATATaa > 6:252028/1‑138 (MQ=255) aCTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCGGGTACATCCACATATAAATca < 1:403945/139‑2 (MQ=255) gATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCgggta < 1:257572/119‑3 (MQ=255) gATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCgggta > 2:257572/1‑117 (MQ=255) gATCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTAGATAATGCGGATAATCGTCATAATGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCAGTTATCTCGGAAATTACACCAGTATGAACGGGTAAATACACAAAAAAATCATa > 2:150206/1‑138 (MQ=255) aTCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGa < 5:225411/55‑1 (MQ=255) aTCCTTAAAATCCCGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGa > 6:225411/1‑55 (MQ=255) ccGTTAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCGGGTACATCCACATATAAATCATAAAATGCAGGTATc < 8:15953/138‑1 (MQ=255) ttAATATCCTCTCGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCGGGTACATCCACATATAAATCATAAAATGCAGGTATcgctc > 1:165845/1‑137 (MQ=255) tctcGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCGGGTACATCCACATATAAATCATAAAATGc > 2:396279/1‑119 (MQ=255) tctcGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCGGGTACATCCACATATAAATCATAAAATGc < 1:396279/119‑1 (MQ=255) ctcGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTcc < 8:129618/44‑1 (MQ=255) ctcGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTcc > 7:129618/1‑44 (MQ=255) ctcGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCGGGTACGTCCACATATAAATCATAAAATGCAGGTATCGCTCCCTTCTGcc > 3:62982/1‑138 (MQ=255) tcGTGTTTCGATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATCGCTGTTATCTCGGATATTACACCCGGATGATCGGGTACATCCACATATAAATCATAAAATGCAGGTATCGCTCCCTTCTGCCg > 7:266116/1‑138 (MQ=255) | TTTCATTATTTTCCACCTCAATCAGCATAAAAAGTTTCATATTCCGCCCGGGCTTCAATGCATTGTTCTGCCCGTTTGCGGTCGTCATCAGACTGAAAACTGATCCTTAAAATCCCGTTAATATCTTCTCGTGTTTCAATAATGCGGATATTCGTGATACTGATGCGCTCCGCAGCTAAGATAGCCGTTATCTCGGAAATCACACCGGGATGATCGGGAACATCCACATATAAATCGTAAAATGCAGGTATCGCGCCCTTCTGCCG > CP006881/2187095‑2187360 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |