Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 2,188,381 | A→G | I326I (ATT→ATC) | U712_10965 ← | Histidinol‑phosphate aminotransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 2,188,381 | 0 | A | G | 98.9% | 289.5 / NA | 89 | I326I (ATT→ATC) | U712_10965 | Histidinol‑phosphate aminotransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (45/43); minor base T (1/0); total (46/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TAGACTAAAGAGGTGATATTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATTGCAAGAATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCATTTCCTGACCGGACAATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCGGAAGGGCGGTTAAAATCAATTAACACAAAGTTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTCTTCGCAAAATCATAATATTGCTGAAGGC > CP006881/2188246‑2188514 | taGACTAAAGAGGTGATATTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGata > 7:92592/1‑139 (MQ=255) tAAAGAGGTGATATTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGcg > 1:178434/1‑138 (MQ=255) tAAAGAGGTGATATTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGcc > 2:70056/1‑139 (MQ=255) tAAAGAGGTGATATTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTACTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGcc > 3:218567/1‑139 (MQ=255) tAAAGAGGTGAGATTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGcc > 1:66890/1‑139 (MQ=255) aaaGAGGTGATATTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCt > 4:5378/1‑139 (MQ=255) acgagGTGATATTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAACTGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCt < 4:297339/136‑1 (MQ=255) aaGAGGTGATATTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCt < 3:347781/138‑1 (MQ=255) agGTGATATTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCttttt > 5:440087/1‑139 (MQ=255) gTGATATTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTc > 2:133698/1‑138 (MQ=255) tGATATTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTc > 8:75128/1‑137 (MQ=255) tGATATTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTc > 3:177280/1‑137 (MQ=255) atatTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCGGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCcagc > 8:173281/1‑139 (MQ=255) atatTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCcag > 5:165051/1‑138 (MQ=255) atatTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCaag > 7:328767/1‑138 (MQ=255) atatTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGAGATAGCCTTTTTCcag > 8:422397/1‑138 (MQ=255) tatTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCcagca < 1:56631/139‑1 (MQ=255) tatTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCcagca < 1:70056/139‑1 (MQ=255) tatTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCcagca < 2:115301/139‑1 (MQ=255) atTTGATCACCTCTTATAAAATTTCCGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGACCCATAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCcag > 1:271817/1‑136 (MQ=255) atTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCcagca < 3:2988/138‑1 (MQ=255) atTTGATAACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGATATTTTGTTCCGATCTTAATCCTGAGTGATGTCTGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACTATATAGACTTTATCcag > 4:1352/1‑136 (MQ=255) tGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGc > 5:205743/1‑139 (MQ=255) ctctTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGaaa > 7:61195/1‑138 (MQ=255) ctctTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGaaa > 5:210752/1‑138 (MQ=255) ctctTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAAc < 1:132547/139‑1 (MQ=255) ctctTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAAc < 3:32597/139‑1 (MQ=255) ctctTATAAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTATCCAGCAGAGCCTGAAAc < 8:120220/139‑1 (MQ=255) ataAAATTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGtt > 3:172778/1‑138 (MQ=255) aTTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGCGCCTGAAACAGTTCATcag > 3:325462/1‑137 (MQ=255) aTTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGa > 6:231137/1‑126 (MQ=255) aTTTCAGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGa < 5:231137/126‑1 (MQ=255) aGCTAAAATGGCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAgg < 4:188122/138‑1 (MQ=255) gCAAGTATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTaaag < 1:133698/138‑2 (MQ=255) tttCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTaa < 6:205743/139‑1 (MQ=255) ttttGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCcagca > 1:398427/1‑88 (MQ=255) ttttGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCcagca < 2:398427/88‑1 (MQ=255) ttttGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACaaaat > 1:169621/1‑137 (MQ=255) gtttGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAACCCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGCGCCTGAACCAGTTCATCAGCCGGACGTGTAATGTCAATTAAGACcaaat > 5:141053/2‑137 (MQ=255) ctctTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCcagca < 1:437506/83‑1 (MQ=255) ctctTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCcagca > 2:437506/1‑83 (MQ=255) ttttGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCt < 2:169621/137‑1 (MQ=255) tttGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCtgtg > 2:213245/1‑139 (MQ=255) ttGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCtgtg < 6:440087/138‑1 (MQ=255) cGATCGTAATCCTGAGTGATGTCTGGAAAACTAATGCGTTTCCTGACCGGAAGATATAGCCTTTTTACAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTa < 3:1352/139‑1 (MQ=255) cGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTa < 3:85072/139‑1 (MQ=255) gATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAg < 7:75128/139‑1 (MQ=255) aTCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAg > 5:418099/1‑138 (MQ=255) aTCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAg > 7:263162/1‑138 (MQ=255) aTCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAg > 3:393931/1‑138 (MQ=255) aTCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAg > 3:209886/1‑138 (MQ=255) aTCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAAATTGTCTGTGAAGGGTAg > 3:57921/1‑138 (MQ=255) aTCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCC‑TTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCa > 6:226447/1‑139 (MQ=255) aTCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACttt < 6:418099/138‑1 (MQ=255) ggAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAAc > 2:362490/1‑138 (MQ=255) aGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAaca > 8:389085/1‑103 (MQ=255) aGTGATGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAaca < 7:389085/103‑1 (MQ=255) aGTGATGTAGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCATGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCAt < 6:22511/139‑1 (MQ=255) aTGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGt > 1:289087/1‑139 (MQ=255) tGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCcagca < 1:133579/53‑1 (MQ=255) tGTCGGGAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCcagca > 2:133579/1‑53 (MQ=255) gggAAACCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCg < 8:61195/139‑1 (MQ=255) ggAAACCTAATGCGTTTCCAGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTGTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCg > 6:249848/1‑138 (MQ=255) aaaCCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCaa < 2:289087/139‑1 (MQ=255) aaaCCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCaa < 2:273414/139‑1 (MQ=255) aaaCCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCaa < 3:181489/139‑1 (MQ=255) aaaCCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCaa < 3:286264/139‑1 (MQ=255) aaaCCTAATGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCaa < 1:229910/139‑1 (MQ=255) aaaCCTAATGCGGTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCCGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCaa < 2:271817/139‑1 (MQ=255) aTGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCAAAATCat > 8:282983/1‑138 (MQ=255) aTGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCAAAATCa < 4:209886/137‑1 (MQ=255) aTGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCAAAATCa < 5:114538/137‑1 (MQ=255) aTGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCAAAATCa < 8:263162/137‑1 (MQ=255) tGCGTTTCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCAAAATCataa < 1:362490/139‑1 (MQ=255) tttCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCAAAATCataatact > 7:154664/1‑137 (MQ=255) ttCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTaaag < 3:78233/68‑2 (MQ=255) ttCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTaaag > 4:78233/1‑67 (MQ=255) ttCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCAAAATCATAATACTg > 1:317393/1‑139 (MQ=255) tCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCAAAATCATAATACTGc > 1:191401/1‑139 (MQ=255) tCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCAAAATCATAATACTGc > 3:359996/1‑139 (MQ=255) tCCTGACCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTGTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCAAAATCATAATACTGc > 1:184314/1‑139 (MQ=255) aCCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAaca > 1:185528/1‑72 (MQ=255) aCCGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAaca < 2:185528/72‑1 (MQ=255) cGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCAAAATCATAATACTGCTGAAGGc < 3:5378/139‑1 (MQ=255) cGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCAAAATCATAATACTGCTGAAGGc < 1:213245/139‑1 (MQ=255) cGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCAAAATCATAATACTGCTGAAGGc < 8:234654/139‑1 (MQ=255) cGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCAAAATCATAATACTGCTGAAGGc < 7:282983/139‑1 (MQ=255) cGGACGATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGCAGGACGTTTAAAGTCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTTTTCGCAAAATCATAATACTGCTGAAGGc < 5:267299/139‑1 (MQ=255) cGGACGATAGAGCCTATTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCAGGAGGACGTTTAAAGGCAATTAACACAAAATTTGTCTGTGCAGGGCAGCACTTTAAACCCTGAGTATTCGGAAAATCATAATACTGCTGAAGGc < 6:98980/139‑1 (MQ=255) | TAGACTAAAGAGGTGATATTTGATCACCTCTTATAAAATTTCAGCTAAAATTGCAAGAATTTCTTCATTTTGCTCTTTTGTTCCGATCGTAATCCGGAGTGATGTCGGGAAACCTAATGCATTTCCTGACCGGACAATATAGCCTTTTTCCAGCAGAGCCTGAAACAGTTCATCGGAAGGGCGGTTAAAATCAATTAACACAAAGTTTGTCTGTGAAGGGTAGCACTTTAAACCATGAGTCTTCGCAAAATCATAATATTGCTGAAGGC > CP006881/2188246‑2188514 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |