| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,188,843 | C→T | G172G (GGG→GGA) | U712_10965 ← | Histidinol‑phosphate aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,188,843 | 0 | C | T | 98.7% | 240.0 / ‑5.9 | 80 | G172G (GGG→GGA) | U712_10965 | Histidinol‑phosphate aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (40/38); total (40/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATCAGATTGGAATACTTGTTTAATAACGGCACAGTTTCCGGGTAATCCTCAGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACAACGAGGACATGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCCCCTTCTGATGTATAAGTGCCAGTCGGGTTATTCGGACTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCAATCGCTTCAAGCATGGCATCTAAATCATGTGAGCCGTCAGGACGAAGTGCGATTTCACGAACTTC > CP006881/2188712‑2188977 | aTCAAATTGGAATACTTGCTTAAGAGCGGCACGGTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATATTATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTcag < 1:158731/139‑3 (MQ=255)aTCAAATTGGAATACTTGCTTAAGAGCGGCACGGTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTcag < 5:71750/139‑3 (MQ=255)aTCAAATTGGAATACTTGCTTAAGAGCGGCACGGTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTcag < 3:241202/139‑3 (MQ=255)aTCAAATTGGAATACTTGCTTAAGAGCGGCACGGTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTcag < 7:407913/139‑3 (MQ=255)aTCAAATTGGAATACTTGCTTAAGAGCGGCACGGTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTcag < 5:117037/139‑3 (MQ=255) tGGAATACTTGCTTAAGAGCGGCACGGTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTc < 4:44184/130‑1 (MQ=255) tGGAATACTTGCTTAAGAGCGGCACGGTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTc > 3:44184/1‑130 (MQ=255) gcttAAGAGCGGCACGGTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGt < 4:227736/136‑1 (MQ=255) ttAAGAGCGGCTCGGTTTCCGGGTTATCCTCTGCTGTTACAGAGTCATAATATGCTTCGTCTAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCATGCAGATGTATAAGTGCCAGTCgg > 4:58718/1‑139 (MQ=255) aagagcGGCACGGTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCgga < 5:130095/133‑2 (MQ=255) ggCACGGTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCg < 4:409804/139‑1 (MQ=255) gCACGGTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTcag > 2:318377/1‑109 (MQ=255) gCACGGTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTcag < 1:318377/111‑3 (MQ=255) gCACGGTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCgg < 1:442379/139‑1 (MQ=255) cacgGTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCggg > 5:381072/1‑138 (MQ=255) cacgGTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGAATAAGTGCCAGTCGGATTATTCggg > 4:117578/1‑138 (MQ=255) gTTTCCGGGTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGc < 6:381072/139‑1 (MQ=255) ggTAATCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCa < 3:12827/139‑1 (MQ=255) aTCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAAc > 1:403055/1‑138 (MQ=255) aTCCTCTGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAAc > 5:181330/1‑138 (MQ=255) tgCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTtgt > 7:413850/2‑139 (MQ=255) tgCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTtgt > 7:80855/2‑139 (MQ=255) gTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTcag < 1:111017/85‑3 (MQ=255) gTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTcag > 2:111017/1‑83 (MQ=255) ttACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTg > 6:431656/1‑139 (MQ=255) aCATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGtt > 7:243825/1‑139 (MQ=255) aCATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGtt > 2:152924/1‑139 (MQ=255) tatTCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGATCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCAAAACGACTTGTGTCTGTTCGt > 8:290499/1‑139 (MQ=255) ttCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTcag > 2:262751/1‑75 (MQ=255) ttCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTcag < 1:262751/77‑3 (MQ=255) ttCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTc > 4:49737/1‑138 (MQ=255) tCATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTcga > 8:242429/1‑137 (MQ=255) tCATAATATGCTTCGCCAAGAACGCCAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAACCGACTT‑TGTCTGTTCGTCGAt > 6:391956/1‑139 (MQ=255) cATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATACGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTcga < 1:135464/138‑3 (MQ=255) cATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTcga < 8:428205/138‑3 (MQ=255) cATAATATGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTcga < 1:96761/138‑3 (MQ=255) ataataTGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGAtg > 3:391647/1‑138 (MQ=255) ataataTGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGAtg > 8:331956/1‑138 (MQ=255) ataataTGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGAtg > 3:379745/1‑138 (MQ=255) ataataTGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGAt < 3:49737/138‑1 (MQ=255) ataataTGCTGCGTCAAGAACGACAAGCACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCTGATGTATAAGTGCCAGTCGTATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGAt < 8:33739/138‑1 (MQ=255) atatGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGc < 3:66739/138‑1 (MQ=255) atatGCTTCGACATGAACGACAAGGACACGAGAAGTAACGCGCTCCAGATATGCGCGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGGTGGATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGc < 4:305509/138‑1 (MQ=255) tGCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTc > 8:182176/1‑138 (MQ=255) gCTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTct > 5:367440/1‑137 (MQ=255) cTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTcga > 6:16343/1‑127 (MQ=255) cTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTctaa > 7:20380/1‑136 (MQ=255) cTTCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGAATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTcga < 5:16343/129‑3 (MQ=255) tCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTctaaca > 7:201582/1‑134 (MQ=255) tCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTctaaca > 4:304399/1‑134 (MQ=255) tCGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTctaaca > 5:222438/1‑134 (MQ=255) cGTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACAt > 6:32496/1‑139 (MQ=255) ttCAACAACTACAAGGACACTAGAAGGAACCCGCTCCTTAAATGCGATTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCACACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACAt < 4:239469/137‑1 (MQ=255) gTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACAt < 3:61087/138‑1 (MQ=255) gTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATg < 8:360745/139‑1 (MQ=255) gTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATg < 5:121740/139‑1 (MQ=255) gTCAAGAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTAGAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTACCATg > 8:82621/1‑139 (MQ=255) atcaacgacAAGGACACGAGAAGCAAGGCGTTCCACAAATGCGAGTAATTCCCCTTCTTTTGTATAAGTGCCTGTCGGATTATTCGGGGTGCATATCCACACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATgg < 1:286635/134‑1 (MQ=255) gAACGACAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTc > 8:367425/1‑139 (MQ=255) aacgacAAGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTc > 4:224598/1‑138 (MQ=255) gacaaGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTcaa < 5:431656/135‑1 (MQ=255) caaGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAAt > 5:145411/3‑138 (MQ=255) caaGGACACGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAAt > 3:239469/3‑138 (MQ=255) acacGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAATCAtgt > 2:38831/1‑138 (MQ=255) cacgagaAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAATCATGTGa < 8:413850/136‑1 (MQ=255) aaGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAATCATGTGAGCCGTc < 1:152924/139‑1 (MQ=255) cAGAAATGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAATCATGTGAGCCGTCGGGACGAAGTg < 4:436514/137‑1 (MQ=255) tGCGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAATCAGGTTAGCCGGCGGGACGAATGGCAATTTc > 1:432680/1‑138 (MQ=255) tGCGAGTAATTATCCTTCAGATGTATCAGTGCCTGGCGGATTATTCGGGCGGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAATCATGTGAGCCGTCGGGACGAAGTGCAATTTCa < 3:58718/139‑1 (MQ=255) cGAGTATTTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAATCATGTGAGCCGTCGGGACGAAGTGCAATTTCACg < 3:363669/139‑1 (MQ=255) cGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCgg < 4:316417/46‑1 (MQ=37) cGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCgg > 3:316417/1‑46 (MQ=255) cGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAATCATGTGAGCCGTCGGGACGAAGTGCAATTTCACg < 3:304399/139‑1 (MQ=255) cGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAATCATGTGAGCCGTCGGGACGAAGTGCAATTTCACg > 8:176394/1‑139 (MQ=255) cGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAATCATGTGAGCCGTCGGGACGAAGTGCAATTTCACg < 6:181330/139‑1 (MQ=255) cGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAATCATGTGAGCCGTCGGGACGAAGTGCAATTTCACg > 8:334439/1‑139 (MQ=255) cGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAATCATGTGAGCCGTCGGGACGAAGTGCAATTTCACg < 4:391647/139‑1 (MQ=255) cGAGTAATTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAATCATGTGAGCCGTCGGGACGAAGTGCAATTTCACg > 4:192326/1‑139 (MQ=255) cGAGTAATTCGCCTTCACAGGTATACGTGCCAGGCGGATAAGTCGGGCGGCATAGCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATCGCTGCTAACATGGCGTCTAAATCATGTGAGCCGTCGGGACGAAGTGCAATTTCACg < 6:141053/139‑1 (MQ=255) aTTCTCCTTCAGATGTATAAGTGCCAGTCGGATTATTCGGGCTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCGATGGCTTCTAACATGGCGTCTAAATCATGTGAGCCGTCGGGACGAAGTGCAATTTCACGTACTTc < 7:242429/139‑1 (MQ=255) | ATCAGATTGGAATACTTGTTTAATAACGGCACAGTTTCCGGGTAATCCTCAGCTGTTACATATTCATAATATGCTTCGTCAAGAACAACGAGGACATGAGAAGGAACGCGCTCCAGAAATGCGAGTAATTCCCCTTCTGATGTATAAGTGCCAGTCGGGTTATTCGGACTGCATATCCAAACGACTTGTGTCTGTTCGTCAATCGCTTCAAGCATGGCATCTAAATCATGTGAGCCGTCAGGACGAAGTGCGATTTCACGAACTTC > CP006881/2188712‑2188977 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |