| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,190,260 | 2 bp→CC | coding (1108‑1109/1203 nt) | U712_10975 ← | Tryptophan synthase beta chain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,190,260 | 0 | T | C | 98.9% | 282.3 / ‑6.2 | 88 | N370G (AAT→GGT) | U712_10975 | Tryptophan synthase beta chain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (37/50); total (37/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP006881 | 2,190,261 | 0 | T | C | 100.0% | 287.9 / NA | 88 | N370G (AAT→GGT) | U712_10975 | Tryptophan synthase beta chain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (37/51); total (37/51) | |||||||||||
GGGATAAACAATTTTTCTGATGCTTGAAGATCTAATTTAAACATGCGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTATCTCCCCGTCCTGATAAACAGACGAGAATGGATTGATTGCGATCCATCTCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTTGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAGAGTTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCATCTGTGATA > CP006881/2190130‑2190385 || gggATAAACAATTTTTCTGATGGTTGAAGATCCAATTTAAACATGGGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATc > 6:358636/1‑138 (MQ=255) ggATAAACAATTTTTCTGATGGTTGAAGATCCAATTTAAACATGGGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCa < 8:69345/139‑1 (MQ=255) ggATAAACAATTTTTCTGATGGTTGAAGATCCAATTTAAACATGGGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCa < 7:155270/139‑1 (MQ=255) ttttCTGGTGGATGAATATCAAATTTAATCATGGGCTTTCACGTCATCTTCCAATACTTTTATTAATGTGTTTACTTGCTTGGCTCCCCGGCTTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGc < 2:435790/138‑1 (MQ=255) ttttCTGATGGTTGAAGATCCAATTTAAACATGGGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGc > 4:11168/1‑138 (MQ=255) ttttCTGATGGTTGAAGATCCAATTTAAACATGGGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGc < 3:356902/138‑1 (MQ=255) cTGATGGTTGAAGATCCAATTTAAACATGGGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACTAGAATGAGTTGACCGCGATCCa > 4:310307/1‑124 (MQ=255) cTGATGGTTGAAGATCCAATTTAAACATGGGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCa < 3:310307/124‑1 (MQ=255) aTGGTTGAAGATCCAATTTAAACATGGGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTCGa < 7:344709/139‑1 (MQ=255) ggttGAAGATCCAATTTAAACATGGGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAAt > 5:91149/3‑139 (MQ=255) tccaaTTTAAACATGGGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCt < 4:196906/136‑1 (MQ=255) tccaaTTTAAACATGGGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCt < 3:94492/136‑1 (MQ=255) tccaaTTTAAACATGGGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCt < 7:216121/136‑1 (MQ=255) ccaaTTTAAACATGGGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCt > 7:50439/3‑138 (MQ=255) caaTTTAAACATGGGCTTTCCCCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGCATGCTTTCGCTaa > 5:152965/2‑139 (MQ=255) caaTTTAAACATGGGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTaa < 6:146989/138‑1 (MQ=255) tAAACATGGGCTTTCACCTCTTCTTCAAAAACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCAGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCa < 5:2237/138‑1 (MQ=255) gggcTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCATTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATgga > 4:288316/3‑134 (MQ=255) tCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGAt > 5:402598/1‑139 (MQ=255) cAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGGTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATc < 5:294540/139‑1 (MQ=255) aaTACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCt < 7:362539/105‑1 (MQ=255) aaTACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCt > 8:362539/1‑105 (MQ=255) aaTACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCt < 5:73024/105‑1 (MQ=255) aaTACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCt > 6:73024/1‑105 (MQ=255) aTACATTCATTTATGTGTTGACATCATTGTCTCCCCGGCCTGATTAACAGACGAGAATGAGTTGATCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTATATTTCCGGCAAAATccc < 8:250992/139‑1 (MQ=255) attAATGTGTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCTCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAAACCCCTCtttt > 7:250992/1‑138 (MQ=255) tgtgTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGa > 1:40423/1‑138 (MQ=255) tgtgTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGa > 3:249007/1‑138 (MQ=255) tgtgTTGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGa > 4:434367/1‑138 (MQ=255) tgtgGACATCCTTGGCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAAGGAGTTGACCGCGCTCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACaa < 2:267018/139‑1 (MQ=255) tgtTGACCTCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACaa < 6:142300/139‑1 (MQ=255) tgtTGACATCCTTGTCTCCCCGGACTTATAAACAGACGAGAATGAGGTGACCGAGATCCATTCCTTTGGAGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGAAGGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACaa < 5:154270/139‑1 (MQ=255) ttGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGCTTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACaa > 1:141362/1‑137 (MQ=255) tGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGATGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAaaag > 6:167694/1‑139 (MQ=255) tGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCa < 4:200142/57‑1 (MQ=255) tGACATCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCa > 3:200142/1‑57 (MQ=255) aTCCTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGctt > 2:250980/1‑138 (MQ=255) ccttgcctcCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTaa < 6:293531/133‑1 (MQ=255) ccTTGTATCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTaa < 4:10770/139‑1 (MQ=255) cTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACaa < 6:206611/129‑1 (MQ=255) cTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACaa > 5:206611/1‑129 (MQ=255) cTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAaaagct > 1:273189/1‑132 (MQ=255) cTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAaaagct < 2:273189/134‑3 (MQ=255) cTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGcttt > 2:398565/1‑136 (MQ=255) cTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGcttt < 1:398565/136‑1 (MQ=255) cTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAAt > 5:128637/1‑139 (MQ=255) cTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAAt > 1:261321/1‑139 (MQ=255) cTTGTCTCCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAAt < 4:249007/139‑1 (MQ=255) tgtctcCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATg > 7:234767/3‑138 (MQ=255) tgtctcCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATg > 6:439466/3‑138 (MQ=255) tgtctcCCCGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATg > 7:384481/3‑138 (MQ=255) ccccGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCa > 7:129771/1‑139 (MQ=255) cccGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTTGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGACAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCAc < 3:288316/139‑1 (MQ=255) cccGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCAc > 4:436588/1‑139 (MQ=255) ccGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCt < 7:168542/70‑1 (MQ=255) ccGGCCTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCt > 8:168542/1‑70 (MQ=255) ggccTGATAACCAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGc < 6:31334/137‑1 (MQ=255) ggccTGATAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGc < 2:13439/137‑1 (MQ=255) aTAAACAGACGATAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCttcttc < 3:191868/139‑1 (MQ=255) aTAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGcttctt > 5:106567/1‑138 (MQ=255) aTAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCttcttc < 1:250980/139‑1 (MQ=255) aTAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCttcttc < 8:129771/139‑1 (MQ=255) aTAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCttcttc < 7:37063/139‑1 (MQ=255) aTAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCttcttc < 2:12718/139‑1 (MQ=255) tAAACAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCttcttc < 8:234767/138‑1 (MQ=255) aaaCAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCAt < 8:50439/139‑1 (MQ=255) caCAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCGATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCAt < 4:433784/137‑1 (MQ=255) atcAGACGAGCATGTGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAATATCCCCTCTTTTTCTGACAATAGGTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCAt < 6:75282/136‑1 (MQ=255) aaCAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCAt < 5:308555/138‑1 (MQ=255) aaCAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCAt < 5:439466/138‑1 (MQ=255) cAGACGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCATcgg > 5:194427/1‑137 (MQ=255) agaatagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTAGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTATTCTGACAAAAGCATTAATGCATCCACCGCATCTTCATCggt > 5:75282/6‑139 (MQ=255) aCGAGAATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCATCggtta > 1:430335/1‑137 (MQ=255) gagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGc > 7:253865/1‑63 (MQ=255) gagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGc < 8:253865/63‑1 (MQ=255) gagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATTCATCCACCGCTTCTTCATCGGTtata < 3:436588/139‑1 (MQ=255) gagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCttcttc > 5:57995/1‑129 (MQ=255) gagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCttcttc > 7:59884/1‑129 (MQ=255) gagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCttcttc < 6:57995/129‑1 (MQ=255) gagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCttcttc < 8:59884/129‑1 (MQ=255) gagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCATCGGTtata < 3:11168/139‑1 (MQ=255) gagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCATCGGTtata < 2:256668/139‑1 (MQ=255) gagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCATCGGTtata < 5:358636/139‑1 (MQ=255) gagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCATCGGTtata < 3:847/139‑1 (MQ=255) gagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCATCGGTtata < 4:439402/139‑1 (MQ=255) gagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCATCGGTtata < 3:434367/139‑1 (MQ=255) gagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCATCGGTtata < 2:430335/139‑1 (MQ=255) gagaATGAGTTGACCGCGATCCATTCCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTCGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAAAGCTATACTGCATCCACCGCTTCTTCATcggatat > 4:847/1‑132 (MQ=255) || GGGATAAACAATTTTTCTGATGCTTGAAGATCTAATTTAAACATGCGCTTTCACCTCTTCTTCCAATACATTCATTAATGTGTTGACATCCTTATCTCCCCGTCCTGATAAACAGACGAGAATGGATTGATTGCGATCCATCTCTTTGGCGAGTTTGAATGCTTTTGCTAACGCATGGGCAGATTCGATTGCCGGCAAAATCCCCTCTTTTTCTGACAAGAGTTTTAATGCATCCACCGCTTCTTCATCTGTGATA > CP006881/2190130‑2190385 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |