Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 2,191,200 | 2 bp→GT | coding (168‑169/1203 nt) | U712_10975 ← | Tryptophan synthase beta chain |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 2,191,200 | 0 | T | G | 100.0% | 190.8 / NA | 58 | R57R (AGG→CGC) | U712_10975 | Tryptophan synthase beta chain |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (23/35); total (23/35) | |||||||||||
* | CP006881 | 2,191,201 | 0 | A | T | 100.0% | 178.7 / NA | 58 | G56G (GGT→GGA) | U712_10975 | Tryptophan synthase beta chain |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (23/35); total (23/35) |
AGCAGCGCTTGACCTAACGCATTATTGATTTTATGAGACCCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAAATTTTCGCGCCGCCTAAGTACTCAGTAACTCGATCAGCAAACGTGAGTGCAGTCGGCCTACCGGAATAGTCATGTAACAGCTTGTAATATTCATTACGAAAAACAGGATCATCCTTGATCTCTTTAAATGCGGTTTCAATTTCTTCTAACGGCTGCATCAGTGTTTCCGGAACAAACTTTCCGCC > CP006881/2191070‑2191326 || agcagcGCTTGACCTAGCGCATTATTGATTTTATGAGAACCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAAt < 4:106147/139‑1 (MQ=255) agcagcGCTTGACCTAGCGCATTATTGATTTTATGAGAACCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAAt < 3:135143/139‑1 (MQ=255) agcagcGCTTGACCTAGCGCATTATTGATTTTATGAGAACCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAAt < 1:410118/139‑1 (MQ=255) agcagcGCTTGACCTAGCGAATTATTGATTTTATGAGAACCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAAt < 1:225474/139‑1 (MQ=255) cagcGCTTGACCTAGCGCATTATTGATTTTATGAGAACCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAg < 4:272270/139‑1 (MQ=255) cagcGCTTGACCTAGCGCATTATTGATTTTATGAGAACCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAg < 8:244820/139‑1 (MQ=255) acatagcGCATTATTGATTTTATGTGAAACTGTATGGTTTAAATCTTCTAGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTTATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTaa < 6:267925/132‑1 (MQ=255) aCCTAGCGCATTATTGATTTTATGAGAACCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTaa < 5:141260/138‑1 (MQ=255) aCCTAGCGCATTATTGATTTTATGAGAACCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTaa < 6:443852/138‑1 (MQ=255) aCCTAGCGCATTATTGATTTTATGAGAACCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTaa < 1:217717/138‑1 (MQ=255) 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cATTATTGATTTTATGAGAACCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAGCTtata < 5:82586/139‑1 (MQ=255) tattGATTTTATGAGAACCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAg < 7:61639/130‑1 (MQ=255) tattGATTTTATGAGAACCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAg > 8:61639/1‑130 (MQ=255) tattGATTTTATGAGAACCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAGCTTataata > 4:387364/1‑139 (MQ=255) tattGATTTTATGAGAACCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAGCTTataata > 7:29575/1‑139 (MQ=255) attGATTTTATGAGAACCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACa < 7:307694/128‑1 (MQ=255) 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> 3:287264/1‑138 (MQ=255) ttcttctCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTGAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAGCTTATAATACTCTTGTCGAAAATCTGGATCATCCTTGAtt < 4:208261/138‑2 (MQ=255) aTCTTCTCGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAGCTTATAATACTCTTCACGAAAAGCGGGATCATCCTTGAtt < 4:287264/139‑2 (MQ=255) ctcGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAGCTTATAATACTCTTCACGAAAAGCGGGATCATCCTTGAtttgtt > 7:35339/1‑133 (MQ=255) ctcGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAGCTTATAATACTCTTCACGAAAAGCGGGATCATCCTTGAtttgtt > 3:4694/1‑133 (MQ=255) ctcGTTTCAAATAGATTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAGCTTATAATACTCTTCACGAAAAGCGGGATCATCCTTGAtttg < 6:179664/136‑4 (MQ=255) aaatagatTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAGCTTATAATACTCTTCACGAAAAGCGGGATCATCCTTGATTTGTTTAAATGctg > 6:292711/1‑137 (MQ=255) aaatagatTTTCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAGCTTATAATACTCTTCACGAAAAGCGGGATCATCCTTGATTTGTTTAAATGct < 3:66923/138‑2 (MQ=255) tttCGCGCCGCCTAAGTATTCAGTGACTCGATCAGCGTATGTTAATGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAGCTTATAATACTCTTCACGAAAAGCGGGATCATCGTTGATTTGTTTAAATGCTGtt > 1:36860/1‑133 (MQ=255) gttaatGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAGCTTATAATACTCTTCACGAAAAGCGGGATCATCCTTGATTTGTTTAAATGCTGTTTGTATTTCATCTAACGGCTGCATGAGTGTTTCCGGAACAAACTTTc > 3:448431/6‑139 (MQ=255) tGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAGCTTATAATACTCTTCACGAAAAGCGGGATCATCCTTGATTTGTTTAAATGCTGTTTGTATTTCATCTAAGGGGTGCTTGAGTGTTACCGGAACAAACTTTCCGcc > 2:45147/1‑138 (MQ=255) tGCAGTCGGGCGTCCGGAATAGTCCTTTAACAGCTTATAATACTCTTCACGAAAAGCGGGATCATCCTTGATTTGTTTAAATGCTGTTTGTATTTCATATAACGGCTGCATGAGTGTTTCCGGAACAAACTTTCCGcc > 8:232538/1‑138 (MQ=255) || AGCAGCGCTTGACCTAACGCATTATTGATTTTATGAGACCCTGTATGGTTTAAATCTTCTCGTTTCAAATAAATTTTCGCGCCGCCTAAGTACTCAGTAACTCGATCAGCAAACGTGAGTGCAGTCGGCCTACCGGAATAGTCATGTAACAGCTTGTAATATTCATTACGAAAAACAGGATCATCCTTGATCTCTTTAAATGCGGTTTCAATTTCTTCTAACGGCTGCATCAGTGTTTCCGGAACAAACTTTCCGCC > CP006881/2191070‑2191326 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |