| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,195,257 | 2 bp→CG | coding (24‑25/1548 nt) | U712_10995 ← | Anthranilate synthase component 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,195,257 | 0 | A | C | 98.5% | 417.4 / ‑2.7 | 130 | S9A (TCA→GCA) | U712_10995 | Anthranilate synthase component 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base C (63/65); total (64/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.58e-01 | |||||||||||
| * | CP006881 | 2,195,258 | 0 | A | G | 98.5% | 407.1 / ‑3.7 | 130 | S8S (TCT→TCC) | U712_10995 | Anthranilate synthase component 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (63/65); total (64/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
TCATCCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCGAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCATCGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTAGGACAAGCTGTCCTGTAAAAATGAAGAAATGTTGGATTGGTAATACATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAACATTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGGCTTCTTTTGGGTAGAATAAACATAC > CP006881/2195124‑2195390 || tcgtcCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGaaa > 3:415678/4‑139 (MQ=255)tcgtcCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGaaa > 2:181917/4‑139 (MQ=255) gtcCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATg > 4:218396/2‑139 (MQ=255) cTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGttt > 8:437486/1‑138 (MQ=255) aagaagATACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTggaa < 7:443989/138‑3 (MQ=255) gaTACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCAt < 3:361211/139‑1 (MQ=255) gaTACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCAt < 7:347662/139‑1 (MQ=255) gaTACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCAt < 1:6039/139‑1 (MQ=255) aTACGTAATCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCAtt > 4:256885/1‑139 (MQ=255) aTCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCa < 1:168511/139‑1 (MQ=255) aTCTCCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCATGTGGTGGGACAAGCTGTCATCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCa < 7:279349/139‑1 (MQ=255) aTCTCCCTGTCAAGCTTCTATATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCa < 2:44979/139‑1 (MQ=255) aTCTCCCTGGCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGGGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCa < 6:13637/139‑1 (MQ=255) tctcCCTGTCAAGCTTCTCTATGATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCtctct < 7:184815/138‑2 (MQ=255) tcCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCa > 1:314282/1‑136 (MQ=255) tcCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCa < 2:314282/136‑1 (MQ=255) tcCCTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTc > 7:261565/1‑139 (MQ=255) ccTGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCt > 8:153959/1‑139 (MQ=255) tGTCAAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTa > 2:235480/1‑139 (MQ=255) aGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCa < 7:13831/139‑1 (MQ=255) tATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGgag < 5:425710/136‑1 (MQ=255) tATCATTTGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAAt < 8:166040/139‑1 (MQ=255) tttGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATgag > 3:92375/1‑137 (MQ=255) tttGAATGGGTGGCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGagaa < 6:190702/139‑1 (MQ=255) tGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATgag > 3:350358/1‑135 (MQ=255) tGAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGagaag > 1:316396/1‑138 (MQ=255) gAATGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGagaaga < 1:181917/138‑1 (MQ=255) aTGGGTGTCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATTCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTAGGGCAAGGAGAATGAGAAGAggg > 6:309283/1‑139 (MQ=255) gtgtCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCAt > 4:140178/1‑138 (MQ=255) tgtCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTTATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATga < 1:407709/139‑1 (MQ=255) tgtCAGTGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCAt > 6:72024/1‑137 (MQ=255) gtcagtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCAt > 8:40130/7‑136 (MQ=255) tcagtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATgaga < 3:176218/134‑1 (MQ=255) tcagtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATgaga < 1:235480/134‑1 (MQ=255) tcagtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATgaga < 3:139934/134‑1 (MQ=255) tcagtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATgaga < 7:40130/134‑1 (MQ=255) tcagtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCAAAATCGGTATCTTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATgaga < 3:109136/134‑1 (MQ=255) tcagtctATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATGGTGTGGTGGTACAAGCTGTGCTATAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATgaga < 1:106792/133‑1 (MQ=255) agtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATgaga < 5:250414/134‑1 (MQ=255) agtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATgaga > 6:250414/4‑137 (MQ=255) agtgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGagag > 7:159832/4‑138 (MQ=255) tgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGa < 1:116946/137‑1 (MQ=255) tgTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGACCTCTAAAAATGCGGAAATGTTAGATTCGAATTTCATTGCAATCACACCTTATGGCATGGATAAGAACAAGATGGCATGAGAGGa > 4:364594/2‑138 (MQ=255) gTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 8:421987/139‑1 (MQ=255) tATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 3:443346/138‑1 (MQ=255) tATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 1:215626/138‑1 (MQ=255) tATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa > 3:305629/1‑138 (MQ=255) tATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 3:256885/138‑1 (MQ=255) tATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 7:437486/138‑1 (MQ=255) tCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGGAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaa < 3:140138/139‑1 (MQ=255) tCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGATATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaa < 2:135000/139‑1 (MQ=255) tCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATga < 3:16441/129‑1 (MQ=255) tCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaa < 1:171438/139‑1 (MQ=255) tCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaa > 1:132956/1‑139 (MQ=255) tCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 5:32530/136‑1 (MQ=255) cTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCATCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaatact < 6:97567/139‑5 (MQ=255) gtgAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCGTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCAGGAGAGGATaaaatacta > 7:235088/1‑133 (MQ=255) gtgAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaatacta > 4:283731/1‑133 (MQ=255) gtgAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaatacta > 3:152505/1‑133 (MQ=255) gtgAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaatacta > 5:78315/1‑133 (MQ=255) gtgAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaatacta > 2:10438/1‑133 (MQ=255) ctcCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACaaa > 2:283195/1‑139 (MQ=255) tcCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATgag < 4:337981/102‑1 (MQ=255) tcCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATgag > 3:337981/1‑102 (MQ=255) tcCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 7:173132/121‑1 (MQ=255) tcCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa > 8:173132/1‑121 (MQ=255) tcCACAATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACaaa > 5:374894/1‑138 (MQ=255) tcCACAATCGGTATCGTGTGGTAGGACAAGCTGTCCTGTAAAAATGAAGAAATGTTGGAt < 8:297602/60‑1 (MQ=255) tcCACAATCGGTATCGTGTGGTAGGACAAGCTGTCCTGTAAAAATGAAGAAATGTTGGAt > 7:297602/1‑60 (MQ=255) cacaATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 3:90663/119‑1 (MQ=255) cacaATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa > 4:90663/1‑119 (MQ=255) caATCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAAc < 6:370231/139‑1 (MQ=255) aTCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAccca < 1:10438/139‑2 (MQ=255) tCGGTATCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATTGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAAacc > 6:214624/1‑138 (MQ=255) aTCGTGTGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATGTAACAAATAAACCCAaaag > 7:233105/1‑138 (MQ=255) tCGTGGGGTGGGTCAAGCTGTCCTATAAAAATGCGGTAATGTTAGATTGGTAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATAAAAAAAATAAACCCAaaaga < 4:115691/138‑1 (MQ=255) gtgtGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAaaaga > 2:58852/1‑136 (MQ=255) gtgtGGTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAaaaga > 4:156378/1‑136 (MQ=255) tggtggGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAaaagaaagac > 6:393255/1‑136 (MQ=255) tggtggGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAaaagaaagac < 1:9508/138‑3 (MQ=255) tggtggGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAaaagaaagac < 5:393255/138‑3 (MQ=255) ggTGGGACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGActt > 7:338429/1‑139 (MQ=255) tgggACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaata < 1:24223/103‑3 (MQ=255) tgggACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGActtct > 4:123803/3‑139 (MQ=255) ggACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaatact < 3:253489/105‑5 (MQ=255) ggACAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATaaaatact > 4:253489/1‑101 (MQ=255) aCAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCAAAAATAAAGACTTATTTTg > 2:399019/1‑139 (MQ=255) cAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa < 5:375188/95‑1 (MQ=255) cAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATa > 6:375188/1‑95 (MQ=255) cAAGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGACTTCTTTTgg < 4:223552/139‑1 (MQ=255) aaGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGACTTCTTTTggg < 3:72021/139‑1 (MQ=255) aaGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGACTTCTTTTggg < 2:279820/139‑1 (MQ=255) atcTGTCCTCTAAATATGCGGAAATCTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCAATCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGACTTCTTTTGGGt < 8:235088/137‑1 (MQ=255) aGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCTATGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGCAAGACTTCTTTTgtgt > 6:333366/1‑139 (MQ=255) aGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGACTTCTTTTGGGt < 8:184134/139‑1 (MQ=255) aGCTGTCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGAATGAGAGGATAAAATACTATGTAACAAATAAACCCAAAAGAAAGACTTCTTTTGGGt < 8:233105/139‑1 (MQ=255) tCCTCTAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGACTTCTTTTGGGTAGaa > 2:309845/1‑138 (MQ=255) tAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCa > 3:161329/1‑53 (MQ=255) tAAAAATGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGCTCTCACTCCTTATGGCa < 4:161329/53‑1 (MQ=255) aaaTGCGGAAATGTTTGATTGGAAATTCATTGATCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAATACTATATAACAAATAAACCCAAAACAAAGACTTCTTTTGGGTAGAATAAacataa < 2:228610/139‑2 (MQ=255) || TCATCCTTGCTTTCAAGAAGATACGTAATCTCCCTGTCGAGCTTCTCTATCATTTGAATGGGTGTCATCGTATCGACTGTGAAGGTCTCCACAATCGGTATCGTGTGGTAGGACAAGCTGTCCTGTAAAAATGAAGAAATGTTGGATTGGTAATACATTGCTCTCACTCCTTATGGCAAGGAGAATGAGAAGATGGCATGAGAGGATAAAACATTATATAACAAATAAACCCAAAAGAAAGGCTTCTTTTGGGTAGAATAAACATAC > CP006881/2195124‑2195390 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |