Missing coverage evidence...
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GTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCA  >  CP006881/166305‑166470                                                                                                                                           |                            gTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTTAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTCAAAACTAAACAAGACAAAACGTAc                             >  1:258861/1‑139 (MQ=21)  ttCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTAcc                            <  7:256292/139‑1 (MQ=34)    cGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAAGTTTTTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTg                          >  6:257018/1‑139 (MQ=17)       tCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAACGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGtt                        >  1:335904/1‑138 (MQ=21)                    caccaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTTACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa           >  2:69014/1‑138 (MQ=21)                    caccaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACACAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa           >  8:190935/1‑138 (MQ=21)                    caccaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa           >  1:258005/1‑138 (MQ=34)                    caccaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa           >  3:320673/1‑138 (MQ=34)                    caccaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa           >  6:326805/1‑138 (MQ=34)                     accaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTaaa         <  1:289015/139‑1 (MQ=34)                     accaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTaa          >  1:145144/1‑138 (MQ=34)                      ccaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTaaa         >  7:121713/1‑138 (MQ=34)                       caAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGAAATTTTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAAAAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTaaaaa       <  4:244071/139‑1 (MQ=255)                            gTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGca  <  1:287062/139‑1 (MQ=11)                            gTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGca  <  3:269940/139‑1 (MQ=11)                                                                                                                                           |                            GTTCGATCCCGCTAGGCTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAATCGCA  >  CP006881/166305‑166470

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑