| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,657,309 | C→A | 20.5% | E140* (GAA→TAA) | U712_13675 ← | putative oxidoreductase yrbE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,657,309 | 0 | C | A | 20.5% | 127.7 / 4.1 | 67 | E140* (GAA→TAA) | U712_13675 | putative oxidoreductase yrbE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (20/30); new base A (12/2); total (35/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.16e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTGGCCATATCAAAATCATGGATCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTCCAGAGAGAAACTAACGGGCTTCTCACA > CP006881/2657176‑2657444 | cTGGCCATATCAAAATCATGGATCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTTATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTaaaaa > 5:7897/1‑136 (MQ=255)cTGGCCATATCAAAATCATGGATCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAAATAGGTGTACCGCTGTCAACCTTTTaaaca > 6:182668/1‑138 (MQ=255) gcgatatCAAAATCATGGATCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTcaacaa < 7:134289/133‑1 (MQ=255) gCCATATCAAAATCATGGATCGACATATCCATAACCAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGGGTGCCGGTTTGCCCAATTTAAACAATC‑g > 1:192168/1‑139 (MQ=255) gCCATATCAAAATCATGGATCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCGCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGGGTACCGATTTCACCATTTTaaacacacg > 7:29223/1‑135 (MQ=255) gCCATATCAAAATCATGGATCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGGTTTTTTATTAATGAGGTGTACCGATTTCACAATTTTAAACAATC‑g > 4:135088/1‑139 (MQ=255) gCCATATCAAAATCATGGATCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑g > 4:63565/1‑139 (MQ=255) gCCATATCAAAATCATGGATCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑g < 1:75631/139‑1 (MQ=255) aaaaTCATGGATCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGAtt < 2:49799/139‑1 (MQ=255) aaTCATGGATCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGAtttt > 6:334376/1‑139 (MQ=255) tGGATCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGGTTTTTTATAAAAGATGGGTACCGATTTCACAATTTTAAAAAAGA‑GTGTTGGTTttatta > 5:213695/1‑138 (MQ=255) tGGATCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTa > 2:9493/1‑138 (MQ=255) tGGATCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGCGTTCTGGGTCCCGGGACGTGAAATTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCCCAATTTTAAACAATC‑GTTTTTATTTTCTTa > 4:86901/1‑138 (MQ=255) tGGATCGACATATCCATAAACAAACCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAAATAGGGGTACCGATTTCAACATTTTAAACAATC‑GTTTTGAATTTCTTa > 3:317151/1‑138 (MQ=255) gATCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGTTTTTTTTTTTATTTGGTGGTCCGAGTTGACCAGTTTTAACAATCGGTTTTGTTTTTTTTaaa > 3:210534/1‑139 (MQ=255) aTCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGAATTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAAt < 3:135088/139‑1 (MQ=255) aCATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATTAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAAGA‑GTTTTTATTTTTTTAAAATGAgg > 2:162460/1‑139 (MQ=255) atCAATAAACAATCCGCGTGACGTACGGAAATAATCTATATTGGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCTATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGTATCa < 6:7897/139‑1 (MQ=255) tAAAAAATCCGCCTTACGTCGGTACATATTCTATTTTCGGGGGGTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑TTTTTGATTTTCTTAAATTTAGGTTCAAAgcg < 6:239952/139‑1 (MQ=255) aaCAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATTAGGTGTACCGATTTTACCATTTTCAACAAAC‑GTTTTTATTTTGTTAAAATTAGGATCAAAgcggc > 6:318721/1‑139 (MQ=255) aaTCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGt > 8:5254/1‑139 (MQ=255) aaTCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGt < 3:178939/139‑1 (MQ=255) aaTCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGGTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGt < 4:277238/139‑1 (MQ=255) aTCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTTACGATTTGACACTTTTAAACAAGA‑GGTTTGTTTTTATTTAAATTAGGATCAAAGCGCCGGtt > 1:143577/1‑139 (MQ=255) tCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGTTTTTTAATAAACGAGGTGCACCGATTTCACCCTTTTCAACAATC‑GTTTTGGTTTTCTTAAAATGATGGTCAAAGCGGCGGtt > 3:104922/1‑138 (MQ=255) tCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGGTTTTTTATAAATTAGGTGTTCCGCTTTTACAATTTTATACAATC‑GTTTTGTTTTTATTTAAATTAGTATAAAAGaggcgggtt > 6:35169/1‑136 (MQ=255) tCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATATATGAGGTGTTCCGATTTCACCATTTTAAACAATC‑GTTTTGATTTTATTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGtt > 5:77492/1‑138 (MQ=255) tCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATTAGGTGTACCGATTTGACCATATTAAACAAAC‑GTTTTTTTTTTATTAAAATTATGATCAAAGCGGGGGtt > 2:193336/1‑138 (MQ=255) tCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGtt > 7:203573/1‑138 (MQ=255) tCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGGGTACCGCTTTCACCATATTCAACAAAC‑GTTTTTAGTTTCTTTAAATTAGGATCCAACaggcgggt > 6:150025/1‑136 (MQ=255) cTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATcc < 1:193336/139‑1 (MQ=255) aCGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGAc > 5:161450/1‑139 (MQ=255) tccgcaCAAAATATATCTTGGGGGGTGCTGGTCCCCGGTACGTTATTTTAAATAAATTAGGTGACCCTATTCCACAATTTTAAACAATC‑GTTTTTATTTTATTAAAATGAGGAACAACGCGGCGGTTAAATCCGACTTg < 2:315127/134‑1 (MQ=255) tACTGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGTTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTg < 3:60599/139‑1 (MQ=255) tACGGACATAATCTTTAGGCGGGGGTGCTGGTGCCCGGGACGTGAGTGTTAATAAATGCGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTg < 5:150025/139‑1 (MQ=255) tACGGACATAATCTATCTTCGGGGGTGCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTAAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTg < 1:162460/139‑1 (MQ=255) tACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTg < 1:9493/139‑1 (MQ=255) tACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTg < 7:236267/139‑1 (MQ=255) tACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTg < 7:5254/139‑1 (MQ=255) tACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGGCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTg < 5:182668/139‑1 (MQ=255) tACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGGCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGAATTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGTATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTg < 1:252073/139‑1 (MQ=255) tataTTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCg < 1:12290/139‑1 (MQ=255) tatTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGGTTTTTAATAAATTAGGTGTACCGCTTTGACCATTTTAAACAATA‑GGTTTTTTTTTGTTAAAATTTTGATAAAAGCGGCGGTTAAATTCACAGTGAAGTTTT‑AACCCggg > 7:323777/1‑137 (MQ=255) tatTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTTATAAATGAGGTGTTCCGATTTCACCAATTTAAACAATC‑GTTTTTTTTTTATTAAAATGAGGTTCAAAGCGGGGGGTTAATCCGCCTTGAAGTGTT‑Aaccccgg > 2:201965/1‑136 (MQ=255) tatTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGATGTGTAACGATTTAACCAATTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTGTTAAAATGATGATCAAAGCGGCGGTTAAAACCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCgtg > 6:320496/1‑139 (MQ=255) tatTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑Accc < 2:220944/135‑1 (MQ=255) tatTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCgtg > 1:21714/1‑139 (MQ=255) gggggTTCTGGGTCCCGGGACGTGGTTTTTTATAAATTAGTGGTAACGATTTTACCATTTTTAAAAAAC‑GGTTTGGTTTTATTTAAATTATGATCAAACCGGCGGTTAAATCAGACGTGAAGTGTT‑AACCCCTGgttgc > 4:129267/1‑137 (MQ=255) gggggTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTTATAAATTATGTGTACCGCTTTCACCATTTTAAACAATC‑GTTTTGATTTTATTTAAATTATGATCAAAGCGGCGGTTATATCCGCCTTGAATTGTT‑ACCCCGTGTTTcc > 1:222351/1‑139 (MQ=255) gggggTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTTATAAATGAGGTGTACCGATTTCCCCATTTTGAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGGTAAATACGACATGAAGTGTTAACCCCGGGttac > 8:89691/1‑137 (MQ=255) ggggTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATTAGGTGTACCGATTTCCCCATTTTCAAAAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGAGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑AACCAGTGGTTACg > 6:160139/1‑139 (MQ=255) ggTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGa < 3:63565/139‑1 (MQ=255) ttCTGGGTCCCGGGACGTGCTTTTTAATAAATGAGGTGTACCGCTTTCCCCATTTTCAACCATC‑GGTTTTATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGGGTAATACGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTACGGACa > 5:136799/1‑139 (MQ=255) ggTCCCGGGACGTTATTTTTAATAAATGAGGGGTCCCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGc < 5:318721/139‑1 (MQ=255) cccGGGACTTCATTTTTAATAAATGAGGGGTACCGTTTTCACCTTTAACATCAATG‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGTGTATAAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAg < 4:78356/139‑1 (MQ=255) cccGGGACGTTATTTTTAATAAATGAGGTGTACCTATTTCACCTTTTACAACAATC‑GTTTTTATTTACTTAAAATGAGCATCAACGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAg < 5:35169/139‑1 (MQ=255) ataaATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTc < 6:72141/139‑1 (MQ=255) tgtACCGTTTTAACCATTTTCAACAATG‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGTATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTCCAgagaga < 2:222351/137‑1 (MQ=255) ttCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTCCAGAGAGAAACTAACGGGc > 5:108520/1‑139 (MQ=255) ttCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTCCAGAGAGAAACTAACGGGc > 8:254002/1‑139 (MQ=255) tCACCATTTTCAACAATA‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGAGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTCCAGAGAGAAACTAACGTGCt > 7:97167/1‑139 (MQ=255) aCCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTCCAGAGAGAAACTAACGGGCTtc > 8:135834/1‑139 (MQ=255) aCCATTTTAAACAATC‑TTTTAGATTTTCTTAAAATGAGGAACAACGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTATCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTCCAGAGAGAAACTAACGGGCTtc < 6:213695/139‑1 (MQ=255) cATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTAAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTCCAGAGAGAAACTAACGGGCTtctc < 1:141762/139‑1 (MQ=255) ttttCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTCCAGAGAGAAACTAACGGGCTTCTcac < 8:203573/139‑1 (MQ=255) ttttCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTCCAGAGAGAAACTAACGGGCTTCTcac < 2:21714/139‑1 (MQ=255) ttttCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTCCAGAGAGAAACTAACGGGCTTCTcac < 8:323777/139‑1 (MQ=255) ttttCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTCCAGAGAGAAACTAACGGGCTTCTcac < 1:201965/139‑1 (MQ=255) tttCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGGTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTCCAGAGAGAAACTACCGGGCGtctccc > 3:183364/1‑136 (MQ=255) ttCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTCCAGAGAGAAACTAACGGGCTTCTcaca < 6:57933/138‑1 (MQ=255) ttCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGAGCTTCACTCGGTTCGTCCAGAGAGAACCTAACGGGCGTCTcaca > 5:91816/1‑138 (MQ=255) | CTGGCCATATCAAAATCATGGATCGACATATCCATAAACAATCCGCCTGACGTACGGACATAATCTATATTCGGGGGTTCTGGGTCCCGGGACGTGATTTTTAATAAATGAGGTGTACCGATTTCACCATTTTCAACAATC‑GTTTTGATTTTCTTAAAATGAGGATCAAAGCGGCGGTTAAATCCGACTTGAAGTGTT‑ACCCCGTGTTTCCGGACAGCCGCAAGCGCTTCACTCGTTTCGTCCAGAGAGAAACTAACGGGCTTCTCACA > CP006881/2657176‑2657444 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |