| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,863,169 | C→A | 12.5% | intergenic (‑146/+130) | U712_14770 ← / ← U712_14775 | Catabolite control protein A/Protein AroA(G) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,863,169 | 0 | C | A | 12.5% | 212.5 / 3.5 | 88 | intergenic (‑146/+130) | U712_14770/U712_14775 | Catabolite control protein A/Protein AroA(G) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/24); new base A (6/7); total (56/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CACTCCTTTTACTGGATACACTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGATTGTTCAATTAAGCGT > CP006881/2863032‑2863306 | cACTCCTTTTACTGGATACACTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATtcatca < 2:127319/139‑1 (MQ=255) cTCCTTTTACTGGATACACTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTTTGGGTAAGTCAGTAGTGTATCTTATTTTTCATTTTTAATaaaa > 2:121748/1‑139 (MQ=255) cTCCTTTTACTGGATACACTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAATCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTAATTATTCATCaaa > 4:34283/1‑139 (MQ=255) cTCCTTTTACTGGATACACTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATaaaa > 3:275741/1‑139 (MQ=255) cTCCTTTTACTGGATACACTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCaaa > 7:42156/1‑139 (MQ=255) cTCCTTTTACTGGATACACTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTAATCaaa > 2:69097/1‑139 (MQ=255) cTCCTTTTACTGGATACACTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTAAGTAGTGTAAATTATTTTTCATTATTGATCaaa > 3:306352/1‑139 (MQ=255) cTCCTTTTACTGGATACACTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTGTATTATTTTTAAGGGTAACACACTAGTGTACATATTTTTTAGTTATTGATaaa > 1:149881/1‑138 (MQ=255) cTCCTTCTACTGGATACACTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCaa > 7:70937/1‑138 (MQ=255) aTACACTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGTAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTtc > 2:194186/1‑138 (MQ=255) aTACACTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATTATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTTTACATTATTTTTAATTATTAATAAAATTTaattaatta > 3:35924/1‑137 (MQ=255) gcacTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCa < 1:242263/138‑1 (MQ=255) cacTTATCCTTATCTATAGCATATACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCa < 1:121748/138‑1 (MQ=255) cacTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGTAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCa < 1:194186/138‑1 (MQ=255) cacTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCa < 8:70937/138‑1 (MQ=255) ttatccttatcTATAGCATAAACACTATATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGa > 2:223547/1‑138 (MQ=255) tccttatcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTTATTTTCATTTTTCATAAAATTTAATTACTTCTAATGAAAtt > 1:100448/1‑139 (MQ=255) tccttatcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAAt > 5:245207/1‑138 (MQ=255) tccttatcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGGAGTGTACATTATTTTTCATTATTAATCAAATTTAATTACTTATCATGAAAtt > 6:3387/1‑139 (MQ=255) atcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAATTCATTAGTGTACATTATTTTTGATTTTTCATAAAATTTTATTACTTGAGATGAAATTATac > 2:265821/1‑138 (MQ=255) atcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTATTGTTCATTAATTTTAATTATTCATCAAATTTAATTAATTAAAATGAAATTATacc > 2:242263/1‑138 (MQ=255) atcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATtataaa > 3:274156/1‑137 (MQ=255) atcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATtata < 4:316280/137‑1 (MQ=255) atcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATtata < 3:339000/137‑1 (MQ=255) atcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATtata < 8:172949/137‑1 (MQ=255) atcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTTTaca > 2:103925/1‑139 (MQ=255) atcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATaca > 4:138639/1‑139 (MQ=255) atcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATaca > 1:313842/1‑139 (MQ=255) atcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATaca > 7:230188/1‑139 (MQ=255) atcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTAATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATaca > 5:222018/1‑139 (MQ=255) atcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTAAATTATTTTTAATTATTCATCAAATTTAATTACTTATAATGAAATTATaca > 3:348532/1‑139 (MQ=255) tcTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATaca < 6:245207/138‑1 (MQ=255) aGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTTAATTTTTTTTGATTATTAATCAAATTTAATTACTTCTGATTTAATTATTACCGtttt > 1:334539/1‑139 (MQ=255) aGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTAATTATTCATAAAATTTAATTAATTCTCATGAAATTATAAACGtttt > 4:285845/1‑139 (MQ=255) cATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTTTTTTTAATTATTCATCAAATTTAATTTCTTCTCATGAAATTATAAACGTTTTta > 4:203600/1‑139 (MQ=255) cATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTta < 2:284086/139‑1 (MQ=255) cATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTta < 4:304571/139‑1 (MQ=255) tAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATg > 1:257494/1‑119 (MQ=255) tAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATg < 2:257494/119‑1 (MQ=255) aaaCACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTTTTTTTCATTATTAATCAAATTTAATTACTTATAATGAAATTATAAACGTTTTTATAg > 1:312405/1‑139 (MQ=255) aaaCACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTAAATTATTTTTCATTATTAATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACAAGTTTTta > 7:253644/1‑136 (MQ=255) acacTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAATCGTAAGTCATTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTAATTCTCATGAAATTATACAAGTTTTTATAaat > 8:269375/1‑139 (MQ=255) acacTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAAATACTTCTAATGAAAATTTACACGTTTTTATAgat > 6:267914/1‑139 (MQ=255) ttATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGatgatg > 8:123087/1‑138 (MQ=255) ttATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTAATTATTAATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGatgatg > 7:350662/1‑138 (MQ=255) tATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGAtgatga < 8:230188/138‑1 (MQ=255) gagaAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTGATTATTGATCAAAATTAATTAATTGACATGAAATTATACACCTTTTTATATATGAATAAAACGta > 5:46026/1‑139 (MQ=255) gagaAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGta > 3:232448/1‑139 (MQ=255) tGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAATCCTAAGTCAGTAGTGTAAATTATTTTTAATTATTAATAAAAATTAAATAATTATAAATAAATTATAAACCTTTTTAAATATTATGAAAACCtaaaaaag > 6:231361/1‑133 (MQ=255) tGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTGATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACAAGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTg > 3:105379/1‑139 (MQ=255) tGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATAc < 8:21473/136‑1 (MQ=255) tGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATAc > 7:21473/1‑136 (MQ=255) tCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATaa < 2:313842/139‑1 (MQ=255) gTTTATGATTTGTAATCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACgaga < 5:231361/139‑1 (MQ=255) gTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACgaga < 3:79691/139‑1 (MQ=255) gTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACgaga < 3:285845/139‑1 (MQ=255) tttATGTATTGTAATCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTTTTCATCAAATTTAATTACTTATCTTGATATTATTAAAGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATTCTTGGTATTTATAACTAAATAAAAgaga > 5:175129/1‑138 (MQ=255) tttATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCTAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGaa < 1:69097/139‑1 (MQ=255) tttATGATTTGTAAGCGTAACTCAGTTGTGTACATTATTTATCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTGATTAAATTTTTCACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTAAACTTGGTTTTTATAACtaaataacagaca > 2:248215/1‑132 (MQ=255) gTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATaaaa > 1:280526/1‑138 (MQ=255) aGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCg > 1:43642/1‑137 (MQ=255) gctagtTTACATTTTTTTTAATAATTCATAAAATTTATTTACTACTAATTAAATTATACACGTTTTAATAGATTATGAAAACGTTTACTTGGTTTTAATAACTAAAAAAACGACAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGgcg < 3:292271/137‑1 (MQ=255) agtagtGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGgcg < 1:223547/139‑1 (MQ=255) ttagtACATTATTTTTCATTATTCATAAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGcgcg < 3:34283/135‑1 (MQ=255) agtGTACATTATTTTTCATTATTAATAAAATTTAATTACTTCTCATGAATTTATACACTTTTTTATAGATTATGAAAACGTATAGTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGcgcg < 2:280526/138‑1 (MQ=255) tgtACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGcc > 3:228012/1‑139 (MQ=255) tACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCtt > 8:347/1‑139 (MQ=255) tACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCtt > 1:116144/1‑139 (MQ=255) tACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCtt > 5:278556/1‑139 (MQ=255) tACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCtt > 3:261462/1‑139 (MQ=255) aCATTATTTTTAATTATTAATAAAATTTAATTACTTCTAATTAAATTATACACGTTTTTATATATTATTAAAACGTATACTTGTTTTTTATAACTAAATAAACTACAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCtt < 4:306352/138‑1 (MQ=255) attattTTTGAGTATTCATAAAATTTTATTACTTCTCATGCAATTATAAACGATTTTTTAGATGATGAAAACGTATAATTGGTTTTTATATCTAATTAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCCCAGGCGCGGCAGTTTg > 2:212417/1‑139 (MQ=255) tattTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAATCGTATACTTGGTTGTTATAACTAAATAAACGCGAAGGCTTAATAAAAGGCGGCAGGCGCGGCCTTTTGGa > 4:276606/1‑139 (MQ=255) tattTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGcgcg < 7:196180/129‑1 (MQ=255) tattTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGcgcg > 8:196180/1‑129 (MQ=255) tattTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTggc > 4:292271/1‑138 (MQ=255) tattTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGa > 7:124188/1‑139 (MQ=255) tttttttATTATTAATCAATTTTAATTAATTCTAATGAATTTATACACTTTTTTTTATTTTATTAAAACGTTTACTTGTTTTTTATAACTAATTAAAGGATAAAGCATAAAATATGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGa < 4:348532/137‑1 (MQ=255) ttttttCATTATTAATTAAATTTAATTATTTGTCTTTAAATTATACTCTTTTTTATAGATCTTGAAAACTTATACTTGTTTTTTTTATATAAAAAAACTATAAAGAATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGa < 8:253644/137‑1 (MQ=255) ttttttCATTATTAATAAAATTTAATAACTTCTCATCAAATTAACCCCGTTTTTATAGATGATTAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACAAAAAAAACCCTAACGCAAAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGa < 2:312405/137‑1 (MQ=255) tttttaCTTTATTAATAAAATTAAATTAATTCTAATAAATTTATACAGTTTTTTATATTTGTTTAAAACTTATACTGGTTTTTAATAATAAAATAAACTACAACGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGa < 8:124188/137‑1 (MQ=255) attTTTAATTATCAAACAAATTAAATAATTACAAAATAAATAAAACACGTTTTAATATATGATTAAAACTTAAACTTGTTTTATAAAAAAAAAAAAACCACAAACCAAAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGa < 2:334539/138‑1 (MQ=255) ttCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGATTGtt > 1:64626/1‑139 (MQ=255) ttCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGATTGtt > 3:191070/1‑139 (MQ=255) ttCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGATTGtt > 3:148024/1‑139 (MQ=255) ttCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGATTGtt > 4:320805/1‑139 (MQ=255) ttCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGATTGtt > 3:145628/1‑139 (MQ=255) taattattattAAAATTTAATTAATTTTCATTAAATTATAAACTTTTTTATATTTTATTAAAACTTATACTTGGTTTTTAAAAAAAAATAAACGACAAAGCAAAAAAAACGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGATTGtt < 2:116144/136‑1 (MQ=255) tCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGATTGtt < 7:347/138‑1 (MQ=255) cATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGCATTGTTc > 8:225123/1‑138 (MQ=255) ttCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGATTGTACAATTaa > 3:113989/1‑139 (MQ=255) ttCATCAAATTAAATTAATTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATTAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGATAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGATTGTTCAATTa < 8:350662/138‑1 (MQ=255) atcaAATTTAATTACTTATAATTAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAACAGTATACTTGTTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGATTGTTCAATTAAgag < 7:269375/139‑3 (MQ=255) tcaAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATAAACTTTTTTATATATGATTAAAACGTATACTTGGTTTTTATAAATAAATAAACGAGAACGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGATTGTTCAATTAAGCGt < 6:222018/139‑1 (MQ=255) | CACTCCTTTTACTGGATACACTTATCCTTATCTATAGCATAAACACTTTATGTAGAGAAATGTCATAATGTCCGAATTTATGTCGTTTATGATTTGTAAGCGTAAGTCAGTAGTGTACATTATTTTTCATTATTCATCAAATTTAATTACTTCTCATGAAATTATACACGTTTTTATAGATGATGAAAACGTATACTTGGTTTTTATAACTAAATAAACGAGAAAGCATAAAAAAAGGCCGCAGGCGCGGCCTTTTGGATTGTTCAATTAAGCGT > CP006881/2863032‑2863306 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |