| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006881 | 2228866 = | 69 (1.110) | 22 (0.360) | 13/224 | NT | 39.6% | intergenic (‑118/‑88) | U712_11195/U712_11200 | Uncharacterized protein ypzE/D‑3‑phosphoglycerate dehydrogenase |
| ? | CP006881 | 3304616 = | 0 (0.000) | intergenic (+4/+45) | U712_16995/U712_17000 | Arabinose metabolism transcriptional repressor/Uncharacterized protein yvbT | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
CCTGCCCCGAAGATTGATCATATGAAATTTAATTACATTATAAACGATAACTGGTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCC > CP006881/2228728‑2229003 | gctgacgaaattatggttaactcagaaacctttgaacacgcagacagaatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttt < 2:73463‑M1/1‑1 (MQ=255) gacgaaattatggttaactcagaaacctttgaacacgcagacagaatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTa < 4:143369‑M1/4‑1 (MQ=255) acgaaattatggttaactccgaaacctttgaacacgcagacagaatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTAc > 7:218319‑M1/135‑139 (MQ=255) acgaaattatggttaactcagaaacctttgaacacgcagacagaatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTa > 1:85473‑M1/135‑138 (MQ=255) acgaaattatggttaactcagaaacctttgaacacgcagacagaatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTAc > 6:359802‑M1/135‑139 (MQ=255) cgaaattatggttaactcagaaacctttgaacacgcagacagaatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACt > 2:104‑M1/134‑139 (MQ=255) gaaattatggttaactcagaaacctttgaacacgcagacagaatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTg > 5:100065‑M1/133‑139 (MQ=255) ttatggttaactcagaaacctttgaacacgcagacagaatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGt < 2:182434‑M1/10‑1 (MQ=255) tGATCATATGAAATTTAATTACATTATAAACGATAACTGGTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAAt < 7:23306/138‑1 (MQ=255) tGATCATATGAAATTTAATTACATTATAAACGATAACTGGTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAAt > 8:23306/1‑138 (MQ=255) tGATCATATGAAATTTAATTACATTATAAACGATAACTGGTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATa > 3:255827/1‑139 (MQ=255) ggttaactcagaaccctttgaccacgcagacagcatgcgttcgttggaaatcctcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtcgcggggagacgcatacagtgctgTTTACTGCGTCAATa < 6:133127‑M1/15‑1 (MQ=255) gttaactcagaaacctttgaacacgcagacagaatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacggttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATa > 2:333199‑M1/124‑138 (MQ=255) gATCATATGAAATTTAATTACATTATAAACGATAACTGGTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATa < 1:130918/138‑1 (MQ=255) aactcagaaacctttgaacacgcagacagaatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACg < 8:312414‑M1/19‑1 (MQ=255) aactcagaaacctttgaacacgcagacagaatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACg < 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1:255793/139‑1 (MQ=255) aaTTTAATTACATTATAAACGATAACTGGTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGaca < 8:179269/138‑1 (MQ=255) aaTTTAATTACATTATAAACGATAACTGGTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGaca < 6:672/138‑1 (MQ=255) aTTTAATTACATTATAAACGATAACTGGTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACAct > 7:367121/1‑139 (MQ=255) aaTTACATTATAAACGATAACTGGTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACATGCAAGCTGACAGATCATTGATTTATTAGTCTTTACTGTTATCCTTTACTGCTTCAATACACGTTGACACTCttt > 4:327164/1‑139 (MQ=255) cATTATAAACGATAACTGGTTGTCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTATGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTgaga < 1:109671/139‑1 (MQ=255) cgcagacagaatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTcttttgaaagtg < 8:378555‑M1/39‑6 (MQ=255) gcagacagaatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATaca < 7:261190‑M1/17‑1 (MQ=255) gcagacagaatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATaca > 8:261190‑M1/100‑116 (MQ=255) gcagacagaatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACtcttttgaaagtgt < 4:139080‑M1/40‑7 (MQ=255) aatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTAc > 3:251239‑M1/92‑96 (MQ=255) aatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTAc < 4:251239‑M1/5‑1 (MQ=255) aatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTaaa > 3:127271‑M1/92‑137 (MQ=255) aatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTaaa < 4:127271‑M1/46‑1 (MQ=255) aatgcgttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAAt < 7:246236‑M1/47‑1 (MQ=255) aaCTGGTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGac < 7:276065/114‑1 (MQ=255) aaCTGGTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTa > 7:140712/1‑139 (MQ=255) ttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCagt < 7:192483‑M1/54‑2 (MQ=255) ttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCagt < 7:4555‑M1/54‑2 (MQ=255) gtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTatcagtgac > 4:49944‑M1/83‑135 (MQ=255) tttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATtatcagtgaca < 7:92985‑M1/58‑6 (MQ=255) aaTTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGt < 4:329381/136‑1 (MQ=255) aaTTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGt > 3:329381/1‑136 (MQ=255) aaTTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCaa > 5:365759/1‑139 (MQ=255) aaTTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCaa > 3:347937/1‑139 (MQ=255) 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(MQ=255) ctttttactGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttga < 6:248717‑M1/75‑23 (MQ=255) cTTTACTGCGTCAATACACTTTGAAACTCTTTTGAGATTATGTTAAATTATCATATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGc < 6:81327/138‑1 (MQ=255) cTTTACTGCCTCAAAAAACGTTGACAATCTTTTGAGAATATGTTATATTATCAGATATTTAGTTTGTCATTTTAGGATGAAATCTACCGATTTTTCGAGTATTGTTCTCAGACATAATGAGCAACGACGGTTTACa < 7:73081/136‑1 (MQ=255) tttACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgg > 5:76380‑M1/1‑53 (MQ=255) | CCTGCCCCGAAGATTGATCATATGAAATTTAATTACATTATAAACGATAACTGGTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCC > CP006881/2228728‑2229003 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |