| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 214,982 | C→T | A268V (GCC→GTC) | U712_00980 → | Uncharacterized protein skfB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 214,982 | 0 | C | T | 98.1% | 351.7 / NA | 107 | A268V (GCC→GTC) | U712_00980 | Uncharacterized protein skfB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (49/55); minor base A (2/0); total (51/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.29e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
AGGCAGAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGCCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGTCATAAATG > CP006881/214848‑215114 | agGCAGAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAAt > 7:288027/1‑139 (MQ=255) aGAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCgg < 6:120585/139‑1 (MQ=255) aGAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCgg < 6:126154/139‑1 (MQ=255) aGAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCgg < 6:156984/139‑1 (MQ=255) gAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCggg < 7:345976/139‑1 (MQ=255) aaaGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTg < 2:427823/139‑1 (MQ=255) aGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCt < 3:338014/139‑1 (MQ=255) gcggcTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCttt > 2:8228/1‑139 (MQ=255) agaaagTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGt < 8:440675/139‑1 (MQ=255) aaagTATGAATACGATTAAAATATAATCAGAAGCAAACATACCATTGATTGTCGCTATTACCATTAATGAGTCCAATTCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGTGTGCTTTTATCTTTCGTg < 6:436751/138‑1 (MQ=255) agTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAg > 3:29003/1‑139 (MQ=255) agTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAg > 6:22015/1‑139 (MQ=255) tGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGaa < 4:332377/138‑1 (MQ=255) ccATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGtt < 1:363886/139‑1 (MQ=255) ccATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGtt < 4:275851/139‑1 (MQ=255) cATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTa < 3:170572/139‑1 (MQ=255) aTTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTAt > 7:180386/1‑139 (MQ=255) aTTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTAt > 4:19663/1‑139 (MQ=255) aTTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTAt > 1:302977/1‑139 (MQ=255) aTTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTAt > 5:238201/1‑139 (MQ=255) aTTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGAGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTAt > 3:386114/1‑139 (MQ=255) ttATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGAc > 2:156372/1‑139 (MQ=255) ttATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGAc > 8:271299/1‑139 (MQ=255) tCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAACCGTTATCTGTTGGACGTg > 1:416590/1‑139 (MQ=255) tCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTg < 5:397652/139‑1 (MQ=255) aaaCATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 3:19357/139‑1 (MQ=255) aaaCATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 2:302977/139‑1 (MQ=255) aaaCATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 7:271299/139‑1 (MQ=255) aaCATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaag > 8:154006/1‑139 (MQ=255) ccAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaaggcttt < 1:8228/138‑1 (MQ=255) cAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaaggcttta < 1:173138/138‑1 (MQ=255) cAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaaggcttta < 8:288027/138‑1 (MQ=255) aTTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTg < 7:158071/91‑1 (MQ=255) aTTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaaggctttaaggctt < 7:274736/139‑1 (MQ=255) gTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCACTGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGATAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaaggcttt < 3:4751/129‑1 (MQ=255) gTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCtt > 3:301142/1‑76 (MQ=255) gTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCtt < 4:301142/76‑1 (MQ=255) gTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTg > 8:107300/1‑88 (MQ=255) gTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaaggcttt > 4:4751/1‑129 (MQ=255) aTTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTg < 5:10798/139‑1 (MQ=255) tGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTgaagaa < 8:293871/139‑1 (MQ=255) aGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt < 6:30477/139‑1 (MQ=255) aGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt < 8:180386/139‑1 (MQ=255) aGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt < 6:105038/139‑1 (MQ=255) aGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGGCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGGGCGACAGAAGGCTTTAAGGCGTTGGATATTGATTTTGAAGaaa < 2:378706/138‑1 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGa > 6:322316/1‑72 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGa < 5:322316/72‑1 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGtt > 1:406173/1‑80 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGtt < 2:406173/80‑1 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 7:191236/102‑1 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa > 8:191236/1‑102 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGa < 5:1043/101‑1 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGa > 6:1043/1‑101 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt > 5:130976/1‑137 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt < 6:130976/137‑1 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATgg > 8:264442/1‑139 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATgg > 7:67789/1‑139 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATgg > 5:336949/1‑139 (MQ=255) tCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATgg > 5:172366/1‑139 (MQ=255) cAATGCTGATGAAGTATCAGATGTTGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGt < 6:238201/138‑1 (MQ=255) tGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTGTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCa > 5:125597/1‑138 (MQ=255) cTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCaaa < 8:329586/138‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGATAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGCCAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGAGATTGATTTTGAAGAAATGGTTAAAATa > 1:226175/1‑137 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAAc > 1:430329/1‑67 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAAc < 2:430329/67‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 1:399323/92‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa > 2:399323/1‑92 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt < 6:222743/127‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAAt > 5:222743/1‑127 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAACTa > 8:342429/1‑137 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 1:241962/137‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 5:302202/1‑137 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 7:235892/1‑137 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 3:440003/1‑137 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 5:22015/137‑1 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 5:143644/1‑137 (MQ=255) atgaAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 7:158590/1‑137 (MQ=255) aaGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCt < 6:172366/139‑1 (MQ=255) gTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGACAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCt > 1:154744/1‑137 (MQ=255) tCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa < 4:21910/129‑1 (MQ=255) tCAGATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATa > 3:21910/1‑129 (MQ=255) gctgtgGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTGGTTCAGGAAAAAAGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTATAAGGCTTTGTATATTGATTTTGAAGAAATGGGTCAAATACAGCTTAGGGAAg < 5:127827/137‑1 (MQ=255) gATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAg < 1:307830/139‑1 (MQ=255) gATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAg < 4:29003/139‑1 (MQ=255) gATGTGGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAg < 1:173489/139‑1 (MQ=255) tgtgGTGGAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCa > 4:288278/1‑139 (MQ=255) tggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACg > 8:193587/1‑139 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTg < 4:292013/41‑1 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTg > 3:292013/1‑41 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGt > 8:370559/1‑139 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGt < 8:67789/139‑1 (MQ=255) ggtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGt > 7:123753/1‑139 (MQ=255) gtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa > 7:316467/1‑75 (MQ=255) gtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 8:316467/75‑1 (MQ=255) gtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGt > 3:132816/1‑138 (MQ=255) gtggAGCAATGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGt > 1:216845/1‑138 (MQ=255) gCAATGTGACAATGCGGGTGCTTTTAACTTTCGTGCAGGAAAAACGAAATCTGAAGGACGTGCGACACAAGGCTTTAAGCCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCATAGGGAAGAACGTCATaa > 8:249371/1‑138 (MQ=255) aaTGTGTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAAAGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGTATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGTGATAAATg < 4:386114/139‑1 (MQ=255) tgtgTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa > 6:194016/1‑66 (MQ=255) tgtgTCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGaa < 5:194016/66‑1 (MQ=255) | AGGCAGAAAAGGCGGCTTTAAAGAAAGTATGAATACCATTAAAAAATTATCAGAAGCAAACATTCCAGTGATTGTCGCTATGACCATTAATGAGTCCAATGCTGATGAAGTATCAGATGTGGTGGAGCAATGTGCCAATGCGGGTGCTTTTATCTTTCGTGCAGGAAAAACGTTATCTGTTGGACGTGCGACAGAAGGCTTTAAGGCTTTGGATATTGATTTTGAAGAAATGGTTCAAATACAGCTTAGGGAAGCACGTCATAAATG > CP006881/214848‑215114 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |