| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 2,536,410 | T→A | 11.9% | D71E (GAT→GAA) | U712_13025 → | Spermine/spermidine acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 2,536,410 | 0 | T | A | 11.9% | 207.3 / 2.1 | 83 | D71E (GAT→GAA) | U712_13025 | Spermine/spermidine acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (53/19); new base A (2/9); total (55/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.81e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATATATTGAATCTACAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTGCTGAGTTATATAAATGCAAGAGAATTTATTTAAGT > CP006881/2536278‑2536548 | atatatTGAATCTACAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGAtaataa < 8:143806/138‑1 (MQ=255) tatTGAATCTACAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAAc > 1:56586/1‑139 (MQ=255) ttGAATCTACAAAAGTATGTTTTGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGATGATAATAAAAACgg > 6:148717/1‑139 (MQ=255) ttGAATCTACAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGATGATAATAAAAACg > 3:85425/1‑138 (MQ=255) ttGAATCTACAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATATAAACg > 8:227461/1‑138 (MQ=255) ttGAATCTACAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACg > 6:170208/1‑138 (MQ=255) atacTACAAAAGTATGTGTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACGATGATGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGAc > 1:65160/4‑138 (MQ=255) aaTCTACAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCTGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGAc > 3:119809/1‑138 (MQ=255) aaTCTACAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGAc > 3:154642/1‑138 (MQ=255) aaTCTACAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGAc > 7:60103/1‑138 (MQ=255) aaTCTACAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGAc > 1:283718/1‑138 (MQ=255) tCTACAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAACCCTGTCGTGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAg > 4:103488/1‑139 (MQ=255) tCTACAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGAc < 3:333946/136‑1 (MQ=255) tCTACAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGAc > 4:333946/1‑136 (MQ=255) tACAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTc > 4:354648/1‑139 (MQ=255) aCAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCt > 6:380605/1‑139 (MQ=255) aCAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCt > 5:358797/1‑139 (MQ=255) tATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTTGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAAATGACGAGTCTGGCtctg > 3:76817/1‑136 (MQ=255) tATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCGGGCTTGa > 4:24253/1‑139 (MQ=255) agaTGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGAtttttt > 1:321414/1‑139 (MQ=255) gCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGTATTGTTTCCCGAGTATGATGATGATAATAAAAACGTACGAGTCTGGATTGACCGATTTTTTATTg > 1:114686/1‑139 (MQ=255) gCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGCCCGATTTTTTAtt > 3:47967/1‑138 (MQ=255) gCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTAtt > 7:10197/1‑138 (MQ=255) tgtaTGTAAATATTATAAACATTTCTGTATTTACTATTACGTATATTTCGTCGTTTTTGAATTGTATTTTTTTTTTCCCGATTATTATGACCATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGaa < 4:342525/136‑1 (MQ=255) acaaggTCACATTTAAAACCGTGTCGGGCTTTAGTTTCTCTGACATATAGTCGTTTTTCAAATGTATGGATTGTTTCCCTAGTTTGATGAATATAATAAAACCCGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGaa < 6:180190/134‑1 (MQ=255) aGAAGGTCACTATAATAACCCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGTATTGTTCCCCGAGTATGATCAACAAAAAAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGaa < 2:283718/139‑1 (MQ=255) tGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGc > 1:80043/1‑138 (MQ=255) tGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGc > 1:5297/1‑138 (MQ=255) tGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGc > 3:164387/1‑138 (MQ=255) tGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCGGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGc > 3:388027/1‑138 (MQ=255) tGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGAATGTTTCCAGAGTATGATGAAGAAAATAAAAACGGACGAGACTCGCTTTACCGATTTTTTATTGACGAACGc > 5:130371/1‑138 (MQ=255) ataACCGTGTCGCGCTTTACTATAAAGGCTCTATAGTCGGTTTTGAATTGTAGTTATTTTTTCACTTGTTTGATTCACATAAAAAAAACGGACGAGGCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGaa < 8:296212/138‑1 (MQ=255) ataACCCTGGCGGGCTTTAGTATGACGGAGATCTTGTCGGTTTTGCATTGTAGGGATTGTTCCCGGAGTATGATCAAGAAAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGaa < 8:120505/138‑1 (MQ=255) aaaaCCTGTCGGGTTTAACTATGATGGATATCTAGTCGGTTTTGAAATTTATGTATTTTTTCCCGTTTATTTTGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGaaa < 5:170208/137‑1 (MQ=255) aaaCCTGCCGGGGTTTACTATCATGCTCATCTGGTCGGTTTGGCATTGTCGGGAGTTTTCCCCGCGAATGTTTAAGAAAAAAAACACGGACGAGGCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAg < 2:221644/139‑1 (MQ=255) cTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGAt > 1:47905/1‑138 (MQ=255) gTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTTCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTAAGATTAAAATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGCCCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGTAAAAGGATTAg > 3:285020/1‑139 (MQ=255) gTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGCCGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAg > 1:395445/1‑139 (MQ=255) gTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAg > 4:75332/1‑139 (MQ=255) gTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAg > 3:99994/1‑139 (MQ=255) gTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAg > 3:378167/1‑139 (MQ=255) gTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAg > 7:373048/1‑139 (MQ=255) gTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAg > 7:9854/1‑139 (MQ=255) gTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAg > 8:115559/1‑139 (MQ=255) gTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAg > 1:223632/1‑139 (MQ=255) gTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGAAAATAAAAACCGAAGAGTCTGGATTGACCGATTATTTATTGACGAACGCTATCAGGTAAAAGGATTAg > 1:303151/1‑139 (MQ=255) tCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAgg > 3:164324/1‑139 (MQ=255) tCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAgg > 1:246583/1‑139 (MQ=255) tCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAgg > 1:175879/1‑139 (MQ=255) tttAATATCAAGGAGATCTAGTGGGTTTTGCATTGTAGGGATTGTTTCCCTAGATTGATGACTAAAATAAAACCGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGgaagaa < 6:358797/139‑1 (MQ=255) ttACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGCCGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGgaagaa > 2:79687/1‑138 (MQ=255) aCTATGAAGGATATCTTGTCGGTTTTGCAATGTTTGGATTGTTTCCCTAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGaaaa < 2:246583/138‑1 (MQ=255) aaGGATATCTAGTGGGTTTTGCATTGTATGGATGGTTTCCCGAGTATGATGAATATAATAAAACCGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTaa < 4:164387/139‑1 (MQ=255) gagaTCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACTAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGc > 3:199079/1‑139 (MQ=255) gaTCTAGTGGGTTTGGCAATGTATGGTTTGTTTCCTGAGTATGAGGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGccc < 4:119809/139‑1 (MQ=255) gaTCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGccc < 2:5297/139‑1 (MQ=255) gaTCAAGTCGTTTTTGCATTGTTGGGTTTGTTCCCCGAGTATCATCAACAAAAAAAAACCGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGccc < 2:321414/139‑1 (MQ=255) ctgtAGGCGGTTTGGCAATGTTGTGATTTTTCCCCGATTCTTATTAAGAAAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTATTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCt < 3:114980/136‑1 (MQ=255) aTCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGCCCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCt > 3:98165/1‑139 (MQ=255) aTCTAGTCGGTTTTGCAATGTAGGGATTGTTTCCCGATTATGATGTAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATTCTTAAAGccc < 7:227461/138‑1 (MQ=255) aTCTAGTCGGGTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGTTTAGTGAAGAAAATGCTTAAAGCCCt > 4:18586/1‑139 (MQ=255) cgggTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGCCGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGCCGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGATTAACGCCCTCAtt > 8:226557/3‑137 (MQ=255) cGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAg > 4:403566/1‑139 (MQ=255) ggTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGc < 8:9854/139‑1 (MQ=255) gTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCa < 8:10197/139‑1 (MQ=255) ttttGCAATGTTTGGTTTGTTTCCCTAGTATTATCAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCTGCAc < 5:80453/139‑1 (MQ=255) ttttGCAATGTATTGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCAc > 6:50091/1‑139 (MQ=255) ttttGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCAc > 8:82945/1‑139 (MQ=255) cAATTTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTg < 7:115559/138‑1 (MQ=255) cAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATTAACATAAAAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTg < 4:276423/138‑1 (MQ=255) cAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGAAAAAAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTg < 7:220251/138‑1 (MQ=255) aaacgTATGGATTTTTTCCCGAGTATGTTGAAGATAATAAAACCGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTGc < 3:103488/135‑1 (MQ=255) aaTGTTTGGTTTGTTTCCCGATTTTGATCAATAAAAAAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTGCt < 2:47905/139‑1 (MQ=255) tATGGTTTTTTTCCCGATTATTATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTGCTGAg < 3:354648/138‑1 (MQ=255) gATTTTTTCCCGTTTATTATTAATAAAAAAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTGCTGAGTtat < 2:80043/138‑1 (MQ=255) gTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTGCTGAGTTATATaaa > 4:55510/1‑139 (MQ=255) 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cccGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTGCTGAGTTATATAAATGc > 8:92831/1‑138 (MQ=255) tgataaATATAAAAAAAACGCACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTGCTGAGTTATATAAATGCAAGAGAat < 4:47967/138‑1 (MQ=255) ataataAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTGc < 7:175173/106‑1 (MQ=255) ataataAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTGc > 8:175173/1‑106 (MQ=255) ataataAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTGCTGAGTTATATAAATGCAAGAGAATTTATTTAAg > 7:318392/1‑139 (MQ=255) ataataAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTGCTGAGTTATATAAATGCAAGAGAATTTATTTAAg > 3:53568/1‑139 (MQ=255) taataaAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTGCTGAGTTATATAAATGCAAGAGAATTTATTTAAg < 1:220610/138‑1 (MQ=255) taataaAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTGCTGAGTTATATAAATGCAAGAGAATTTATTTAAGt < 4:99994/139‑1 (MQ=255) | ATATATTGAATCTACAAAAGTATGTTTAGAAGATGCAAAAGAATGTCACTATTATAAACCTGTCGGGCTTTACTATGAAGGAGATCTAGTCGGTTTTGCAATGTATGGATTGTTTCCCGAGTATGATGAAGATAATAAAAACGGACGAGTCTGGCTTGACCGATTTTTTATTGACGAACGCTATCAGGGAAAAGGATTAGGGAAGAAAATGCTTAAAGCCCTCATTCAGCACCTTGCTGAGTTATATAAATGCAAGAGAATTTATTTAAGT > CP006881/2536278‑2536548 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |