| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 3,603,350 | T→A | 15.6% | I152F (ATT→TTT) | U712_18545 ← | ATP synthase subunit delta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 3,603,350 | 0 | T | A | 15.6% | 187.1 / 6.9 | 83 | I152F (ATT→TTT) | U712_18545 | ATP synthase subunit delta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/33); new base A (3/11); total (39/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.32e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTGCTAATCTCTTCAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACTGAATATACGAT > CP006881/3603213‑3603476 | gTGCTAATCTCTTCAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATa > 8:270452/1‑139 (MQ=255) cTAATCTCTTCAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCg < 7:138021/139‑1 (MQ=255) cTAATCTCTTCAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCg < 1:218181/139‑1 (MQ=255) cTAATCTCTTCAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCg < 6:229139/139‑1 (MQ=255) cTAATCTCTTCAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCg < 4:188195/139‑1 (MQ=255) cTAATCTCTTCAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCg < 2:256681/139‑1 (MQ=255) cTAATCTCTTCAGCTTTGATGCGCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGGCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCg < 4:11847/139‑1 (MQ=255) aTCTCTTCAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGcc < 4:214729/138‑1 (MQ=255) ttCAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCACTGCGGACTTTAATACCGCCTATTa > 2:176797/1‑138 (MQ=255) ttCAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTa > 1:138432/1‑138 (MQ=255) ttCAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTa > 7:324664/1‑138 (MQ=255) ttCAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTa > 4:115839/1‑138 (MQ=255) ttCAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACAGCCTATTa > 3:349094/1‑138 (MQ=255) cAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTaaa < 3:83035/138‑1 (MQ=255) cAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTaaa < 6:233656/138‑1 (MQ=255) tGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCt > 7:336862/1‑139 (MQ=255) tGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCAAATGCCGACTTTAATACCTCCTATTAAATCCGTCt > 4:360803/1‑139 (MQ=255) tGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCACCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCt > 2:24514/1‑139 (MQ=255) aTGCTCTCTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCGTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTg < 3:369826/138‑1 (MQ=255) gCTCACTTAGGTTTCACGCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACAGCCTATTAAATCCGTCTGCa < 4:71287/138‑1 (MQ=255) cACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCg < 4:207652/116‑1 (MQ=255) cACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCg > 3:207652/1‑116 (MQ=255) cACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCAGGCTAATTGACGTTCAATGCGCT‑AAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCg > 1:343530/1‑115 (MQ=255) cACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCAGGCTAATTGACGTTCAATGCGCT‑AAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCg < 2:343530/115‑1 (MQ=255) aGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTc > 4:104961/1‑139 (MQ=255) cACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCACTGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATtc > 4:168626/1‑139 (MQ=255) cACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGAtt < 7:270452/138‑1 (MQ=255) cACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATtc > 8:263395/1‑139 (MQ=255) cACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATtc > 5:140198/1‑139 (MQ=255) cACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATtc > 8:265007/1‑139 (MQ=255) cACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATtc > 6:341412/1‑139 (MQ=255) cACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATtc > 5:786/1‑139 (MQ=255) cACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATtc > 3:159499/1‑139 (MQ=255) cACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATtc > 3:154526/1‑139 (MQ=255) cACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGGCTGCACTTCATTTCTGATtc > 1:265129/1‑139 (MQ=255) cACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAAAAACGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATtc > 3:406098/1‑139 (MQ=255) ttCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCatt > 3:137780/1‑136 (MQ=255) ttCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGt > 2:323375/1‑138 (MQ=255) ttCTATCGATATTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGACATAAATCCGGTTTCCAATCCGGACTTTAATAACGCCTATTATATCCGTCTCCACTTCATTTCTGATTCTCAGt > 2:317827/1‑138 (MQ=255) ttttCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTc > 7:63088/1‑139 (MQ=255) ttCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCg > 7:308750/1‑139 (MQ=255) ccccGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTACAATGCCGACATTAAAAACGCCTATTAAATCCGTCTGAACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCgac > 4:405191/1‑137 (MQ=255) aTTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATCCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTg > 7:94897/1‑138 (MQ=255) ttGACGTTCAATGCGCTGACGCTCCCCGCTTACGCTGCCGTCATAACTCCGGTTACCAATGCGTACTTTAAACCCGCCTATAAAATCCGTCTCCACTTCATTTCTGATTCTCAGTCAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCa < 2:315613/139‑1 (MQ=255) ttGACGTTCAAGGCGCTGAAGCTGCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGCACTTAAAAACCGCAAATAAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCCGTCACGCGACTCCGGCTTTTTTTGCa < 6:1134/139‑1 (MQ=255) acgtgaaaTGCGCTGATGAGTCCCGCTTACGGTGCCGTCATAAAGCGGGTTTCCACTGGGGAATTTAATACCGCATATAAAATCCGTGTGCACTTAATTTCTCTTTCTCTGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCaaa < 6:357545/132‑1 (MQ=255) gTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAacac > 5:192534/1‑139 (MQ=255) ttCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACt > 8:377876/1‑139 (MQ=255) ttCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAAACCGGTTACCAATGCGGACTGTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCCCTTCATTTATGATTCTCAGTGAAGCCAGTCCGGCTTTTTTTTCAAACACt > 6:35666/1‑139 (MQ=255) ttGCGATCAACCTTCCCGCTTACGCTCCCTTCATAAATCGGTTTTCCAATGGGTACTTAAAAAGCGCCTATTAAATCGGTGTGCAATTCATTTCTGATTATCTGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTtgtg < 5:101088/138‑1 (MQ=255) tGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGa > 5:159084/1‑139 (MQ=255) gcgcTGACGGTTCCCGCTTACGCGCCCGGCAAAAATCCGGTTCCCAATGCGCACTTAAAACCCGCCTATAAACTCCGGCTCCACTAATTTTGTGTTCATCAGTCACGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGAt < 8:178125/139‑1 (MQ=255) cgcgGACGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAAGCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAAACCCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGAt < 5:118452/138‑1 (MQ=255) tCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATAACGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACAt > 1:375012/1‑139 (MQ=255) cccGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGTACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACAt < 8:324664/138‑1 (MQ=255) cTTACGCTGCCGTCAAAAATCCGGTTTCCAATTCGGACTTTAAAACCGCCTATTAAAACAGACAGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTCAAGCGACTCCGGGTATTTTTGCAAAAAATTGTGATAATGGTAACATTTATg > 2:379333/1‑139 (MQ=255) ccGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGt > 3:373695/1‑137 (MQ=255) ccGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGt > 2:171495/1‑137 (MQ=255) cGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAg < 7:263395/139‑1 (MQ=255) aaacctCCGGTAGCCACGGCGGACTTAAAACCCGCCTATTAAACCCGCAGGCACTTCATTTCAGCTTCTCCGTGACGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCCGCATCCGTCAGCGGt < 6:309891/134‑1 (MQ=255) aTCCGGTTTCCAATGTGGATTTTAATACCGCATATTATATCGGTCTGCAATTCATTTCTGATTCTCTGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCa < 2:265129/139‑1 (MQ=255) aTCCGGTTTCCAATGCTGACTTAAATCCCGCATATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGTTTCTCATTGACGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCa < 3:115839/139‑1 (MQ=255) aTCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCa < 8:336862/139‑1 (MQ=255) aTCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCa < 8:63088/139‑1 (MQ=255) aTCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCa < 7:377876/139‑1 (MQ=255) aTCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCATATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCa < 3:104961/139‑1 (MQ=255) aTCCGGTTCCCAATGCGGACTTTAATACCGCATATTAAAACCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCCGTCACGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCa < 1:103561/139‑1 (MQ=255) tCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGGGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCAc > 1:308240/1‑139 (MQ=255) tCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCAc > 6:155236/1‑139 (MQ=255) cgggTTTCCAAGGCGCCATTTCATACCCCATATTAAACCCGGCGGATCTTCATTACTCATTCGCAGTCCCGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACt < 1:388935/137‑1 (MQ=255) ccGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACt < 5:155236/139‑1 (MQ=255) ccGGTTTCCAATGCGGACTATAAACCCGCCTATTAAATCCGTCTGCAATTCATTTCTGATTATCAGTCAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACt < 5:280988/139‑1 (MQ=255) ccGGTTTCAAAGGCGGAATTAAAAACCGCATATTAAACCCGTCTGCAATAAATTTCTTATTCTCCGTCACGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACt < 1:176797/139‑1 (MQ=255) ccGGATTCCATTGCGCACTTTAAAACCGCATATTAAATCGGTCTTCAATTAATTTCTGATTCTCAGTCAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACt < 1:317827/139‑1 (MQ=255) gggTTTCAAATGCGAACTTTAATACCGCCTATAAAATCCGTCTGCACTTAATTTCTTATTCTAAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACt < 7:265007/137‑1 (MQ=255) cgttttCCTATGCGGAGTTAAATACCGCATATTAAAACCGTCTTCACTTCATTTCTGATTCACCGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACt < 1:323375/135‑1 (MQ=255) cGGTTTCCATTGCGGACTTTAATACCGCATATTAAATCCGTCTGCACTTAATTTCTGATTCTCAGTTAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACt < 6:786/138‑1 (MQ=255) cGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACt < 8:308750/138‑1 (MQ=255) cGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACt < 6:138500/138‑1 (MQ=255) cGGTTTCCAAGGCGGACTTTAAAACCCCCTATTAAATCCGCCTGCACTTAATTTCTGATTCTCCGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACt < 4:373695/138‑1 (MQ=255) cGGTTACCATTGGGGAATTTATAACCGCCTATAAAATCCGTCTGCCCTTAATTTGTTTTGATCTGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACt < 5:71509/138‑1 (MQ=255) cAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACTGAAtata < 3:189057/138‑1 (MQ=255) tGCGTACTATAATCCCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTAATTTCTTATTCTCAGGGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACTGAATATACGAt < 8:254232/139‑1 (MQ=255) | GTGCTAATCTCTTCAGCTTTGATGCTCACTTAGGTTTCACCCCTTCTATCGATTTTCCCCGGCTAATTGACGTTCAATGCGCTGAAGCTTCCCGCTTACGCTGCCGTCATAAATCCGGTTTCCAATGCGGACTTTAATACCGCCTATTAAATCCGTCTGCACTTCATTTCTGATTCTCAGTGAAGCGACTCCGGCTTTTTTTGCAAACACTTGTGATAATGGTAACATTTCTGCATCCGTCAGCGGTTTCACTGAATATACGAT > CP006881/3603213‑3603476 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |