| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | pSIJ663_pHT315_araE_xy | 2,655 | Δ3 bp | intergenic (–/‑321) | – / → eryR | –/– |
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Only 100 of 4137 total aligned reads displayed.
GAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2517‑2654‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGT > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2658‑2795 ACTATTGATGCTGTGGATACTATTTACAGAGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGAGTTGCAAGATAAAGATATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCAGAA < 2:365732/139‑1 TATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGC < 5:306994/139‑1 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TCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTA < 2:166312/139‑1 TCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTACATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTA < 8:154949/139‑1 CCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAAT < 7:203884/139‑1 GAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2517‑2654‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGT > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2658‑2795 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |