| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP006881 | = 2228918 | 140 (1.270) | 80 (0.050) | 26/252 | 1.9 | 36.4% | intergenic (‑170/‑36) | U712_11195/U712_11200 | Uncharacterized protein ypzE/D‑3‑phosphoglycerate dehydrogenase |
| ? | pSIJ663_pHT315_araE_xy | 9781 = | NA (NA) | intergenic (+5050/–) | ampR/– | –/– | |||||
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
GTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCGTTCAAAAAAACGTAGCAGATGCAG > CP006881/2228781‑2229056 | ttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCagt > 1:143339‑M1/86‑138 (MQ=255)ttcgtttgaaatcatcgctgacgtttggaaaaacagataacagctataaaaaaagcaatgtagcggggagacccatacattgcttTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCagt < 7:246601‑M1/54‑2 (MQ=255) tGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGata > 3:439128/1‑139 (MQ=255) taGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCATTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAtttt > 2:222982/1‑139 (MQ=255) aaTTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCaa > 5:82137/1‑139 (MQ=255) aaTTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCaa > 4:208301/1‑139 (MQ=255) aaTTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCaa > 7:376956/1‑139 (MQ=255) ttGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGTGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAAtt > 5:161422/1‑139 (MQ=255) ttGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAAtt < 3:208301/139‑1 (MQ=255) ttGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAAtt < 5:119627/139‑1 (MQ=255) tGCTTTAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAAtt > 1:245363/1‑138 (MQ=255) tGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGt < 2:308509/133‑1 (MQ=255) tGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAAtt > 6:338111/1‑138 (MQ=255) tGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAAtt > 4:59011/1‑138 (MQ=255) tGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAAtt > 3:224552/1‑138 (MQ=255) cTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTag > 1:49015/1‑139 (MQ=255) cAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTagga < 8:202525/138‑1 (MQ=255) tatTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACg < 7:63670/139‑1 (MQ=255) ttACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGAt > 6:260207/1‑139 (MQ=255) ttACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGAt < 3:300998/139‑1 (MQ=255) cAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGa < 8:435471/139‑1 (MQ=255) cTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTAt < 5:467803/139‑1 (MQ=255) cTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATAAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTAt < 8:370742/139‑1 (MQ=255) tCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTgg > 2:274885/1‑139 (MQ=255) gATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGtct < 1:355252/139‑1 (MQ=255) tattaGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGATAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAAt > 4:336066/1‑138 (MQ=255) ttaGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTc < 4:38614/114‑1 (MQ=255) gCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAac > 1:338195/1‑139 (MQ=255) gCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAac > 7:356846/1‑139 (MQ=255) cTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTGTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAacg > 6:225016/1‑139 (MQ=255) ttACTTTTATCCTTTACTGAGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAacga < 5:475315/138‑1 (MQ=255) tACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTc < 5:386777/106‑1 (MQ=255) tgctttttactgcGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattc > 3:191827‑M1/6‑58 (MQ=255) tATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGATAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTa < 6:276361/138‑1 (MQ=255) aTCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAacga > 6:29063/1‑130 (MQ=255) tCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACa < 8:418631/138‑1 (MQ=255) ctttttactGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaat > 5:258845‑M1/4‑56 (MQ=255) ctttttactGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaat > 5:272406‑M1/4‑56 (MQ=255) ctttttactGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctg > 5:441193‑M1/4‑56 (MQ=255) ctttttactGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctg < 6:441193‑M1/117‑65 (MQ=255) ccTTTACTGCGTCAATCCACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTGGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGc < 5:9440/139‑1 (MQ=255) cTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGACATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGc < 6:164144/138‑1 (MQ=255) TTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCAc < 7:490181‑M1/139‑1 (MQ=255) tACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatact > 1:327993‑M1/1‑51 (MQ=255) tACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatact < 2:327993‑M1/87‑37 (MQ=255) TACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAg < 1:91403‑M1/108‑1 (MQ=255) TACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAg > 2:91403‑M1/1‑108 (MQ=255) TACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTAcagcccct < 6:375161‑M1/139‑4 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGtct < 1:303361/100‑1 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCTGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTAtt > 2:453562/1‑138 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTAtt > 5:199288/1‑138 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTAtt > 1:372687/1‑138 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTCTGAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTAtt > 7:425396/1‑138 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgt > 2:182468‑M1/1‑46 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgt > 1:6556‑M1/1‑46 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgt > 1:288235‑M1/1‑46 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgt > 1:170719‑M1/1‑46 (MQ=255) cGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattaga < 4:200834‑M1/96‑51 (MQ=255) gTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtca > 2:108294‑M1/1‑45 (MQ=255) aaTACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATc < 8:168698/139‑1 (MQ=255) aaTACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATc < 2:406341/139‑1 (MQ=255) aaTACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATc < 5:322444/139‑1 (MQ=255) aaTACACGTTGACACTCTTTACAGAATATGATAAATTATCATATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGCCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATc < 4:150152/139‑1 (MQ=255) aTACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCa < 8:490181/139‑1 (MQ=255) tACACGTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttg < 6:200412‑M1/139‑100 (MQ=255) ctcgtTGAAATTCTTTTGATTGTTTTTTAAATTTTCAGtgatatgatagtaagtttttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgat < 4:70891‑M1/137‑102 (MQ=255) cacGTTGAAACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTTTCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGAc < 2:468676/139‑1 (MQ=255) cacGTGTACAATCTTTTGTGAATATTTTAAATTATCAGATATTTTGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATGTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAACGAGCAACGACGGTTTACTGCCACTTATTGAATCAGa < 6:81958/138‑1 (MQ=255) gTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCa > 7:158953/1‑121 (MQ=255) gTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACtt > 8:277561/1‑138 (MQ=255) gTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACtt > 7:186188/1‑138 (MQ=255) gTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTCAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACtt > 4:235860/1‑138 (MQ=255) gTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatct > 5:507232‑M1/1‑35 (MQ=255) gTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatct > 8:401645‑M1/1‑35 (MQ=255) gTTGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatct > 5:28985‑M1/1‑35 (MQ=255) ttGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTa > 5:237310/1‑139 (MQ=255) ttGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaac > 4:419419‑M1/1‑34 (MQ=255) ttGACACTCTTTTGAAAGTGTGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaac < 3:419419‑M1/75‑42 (MQ=255) ctctTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGaaa < 3:59011/139‑1 (MQ=255) ttttGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTCCAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCg > 2:236709/1‑139 (MQ=255) atatGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCGTTCaaaa > 5:20366/1‑138 (MQ=255) tGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcggcggggcttggcgg < 4:191827‑M1/139‑126 (MQ=255) tGTTAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcggcggggcttggcg < 2:210478‑M1/138‑125 (MQ=255) gTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGc > 6:284442/1‑97 (MQ=255) ttAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcggcggggcttggcggct < 6:97699‑M1/139‑128 (MQ=255) ttAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcggcggggcttggcggc < 1:18560‑M1/138‑127 (MQ=255) ttAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcggcggggcttggcggc < 2:76488‑M1/138‑127 (MQ=255) tAAATTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcggcggggcttggcggct < 6:507232‑M1/138‑128 (MQ=255) aaTTATCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcggcggggcttggcggctta < 8:142806‑M1/138‑130 (MQ=255) ttATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCGTTCAAAAAAACGTAGCAg < 3:379176/139‑1 (MQ=255) aTCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcggcggggcttggcggcttattgt < 7:370273‑M1/138‑134 (MQ=255) aTCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcggcggggcttggcggcttattgt < 8:350794‑M1/138‑134 (MQ=255) aTCAGtgacaagacaggaagtattttaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcggcggggcgtggcggcttattgt < 5:63214‑M1/138‑134 (MQ=255) tCAGtgacatgaaaggaattatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcggcggggcttggcggcttattgta < 7:423554‑M1/138‑135 (MQ=255) tCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcggcgggtcttggcggcttattgtat > 6:14753‑M1/1‑4 (MQ=255) tCAGtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcggcggggcttggcggcttattgtat > 3:316137‑M1/1‑4 (MQ=255) tCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCGTTCAAAAAAACGTAGCAGATg > 3:254874/1‑139 (MQ=255) cAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCGTTCAAAAAAACGTAGCAGATg > 3:470925/1‑138 (MQ=255) aGATATTTATTTTTTCAATTTAGGAGGAAATCTAACTATGTTGCGAGTATTGGGCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCGTTCAAAAAAACGTAGCAGATGCa < 5:338111/139‑1 (MQ=255) gtgacatgaaaggaagtatttgaaaatgaagaatactccaactcaattagaaccaaatgttcctgtaacaagaagccattcaatgggatttgtcattttgatctcatgtgcggcggggcttggcggcttattgtatggc < 6:129159‑M1/139‑139 (MQ=255) | GTTGGCTGTATAGAGAATTGCTTCAAATTAAATATATTACCTGCAAGCTGTCAGATCATTGATTTATTAGGCTTTACTTTTATCCTTTACTGCGTCAATACACGTTGACACTCTTTTGAGAATATGTTAAATTATCAGATATTTAGTTTGTCAATTTAGGAGGAAATCTAACGATGTTTCGAGTATTGGTCTCAGACAAAATGAGCAACGACGGTTTACAGCCACTTATTGAATCAGACTTTATTGAAATCGTTCAAAAAAACGTAGCAGATGCAG > CP006881/2228781‑2229056 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |