| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP006881 | 3,021,242 | T→G | 11.2% | N181T (AAC→ACC) | U712_15515 ← | putative oxidoreductase yuxG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | CP006881 | 3,021,242 | 0 | T | G | 11.2% | 248.5 / 3.7 | 125 | N181T (AAC→ACC) | U712_15515 | putative oxidoreductase yuxG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/58); new base G (9/7); total (60/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
ATGCTGATTGATACGATCGTTAATATACTGCTCGGCTTCTTGAATGATGGATATCGTTTTTTGATAACATGTTTCAGACGTCTCTCCCCAAGTGACTAAGCCGTGTTTCTCCATTAATACAAGCTCGGCGT‑GGGGGTTGTTTGCTACGCCTTCAGCGATCATTTTAGACAAAGTAAATCCAGGACGGACGTATGGCACCCATACAAACCGATTTCCGTAAATGTCTTCAGCGATTTGTTTTCCATTATCCGCACAGCATATGCTGATAATCGCAT > CP006881/3021106‑3021380 | attcTGATTGATACGATAGTTAATATACTGCTCGGCTTCTTGAATGATGGATATCGTTTTTTGATAACATGTTTCAGACGTCTCTCCCCAAGTGACTAAGCCGTGTGTCTCCATTAATACAAGCTAGGGGTCGGGGgtt > 8:119240/4‑139 (MQ=255) tGCTGATTGATACGATCGTTAATATACTGCTCGGCTTCTTGAATGATGGATATCGTTTTTTGATAACATGTTTCAGACGTCTCTCCCCAAGTGACTAAGCCGTGTTTCTCCATTAATACAAGCTCGGCGT‑GGGGgttgt < 8:152340/139‑1 (MQ=255) gCTGATTGATACGATCGTTAATATACTGCTCGGCTTCTTGAATGATGGATATCGTTTTTTGATAACATGTTTCAGACGTCTCTCCCCAAGTGACTAAGCCGTGTTTCTCCATTAATACAAGCTCGGCGT‑GGGGgttgtt > 6:157023/1‑139 (MQ=255) attgatACGATCGTTAATATACTGCTCGGCTTCTTGAATGATGGATATCGTTTTTTGATAACATGTTTCAGACGTCTCTCCCCAAGTGACTAAGCCGTGTTTCTCCATTAATACAAGCTCGGCGT‑GGGGGTTGTTTGc < 7:178135/138‑1 (MQ=255) attgatACGATCGTTAATATACTGCTCGGCTTCTTGAATGATGGATATCGTTTTTTGATAACATGTTTCAGACGTCTCTCCCCAAGTGACTAAGCCGTGTTTCTCCATTAATACAAGCTCGGCGT‑GGGGGTTGTTTGc > 1:36042/1‑138 (MQ=255) attgatACGATCGTTAATATACTGCTCGGCTTCTTGAATGATGGATATCGTTTTTTGATAACATGTTTCAGACGTCTCTCCCCAAGTGACTAAGCCGTGTTTCTCCATTAATACAAGCTCGGCGT‑GGGGGTTGTTTGc > 4:212972/1‑138 (MQ=255) attgatACGATCGTTAATATACTGCTCGGCTTCTTGAATGATGGATATCGTTTTTTGATAACATGTTTCAGACGTCTCTCCCCAAGTGACTAAGCCGTGTTTCTCCATTAATACAAGCTAGGCGT‑GGGGGTTGttttc > 3:16127/1‑136 (MQ=255) tACGATCGTTAATATACTGCTCGGCTTCTTGAATGCAGGATAGCGTTTTTTGATAACATGTTTCAGACGTCTCTCCCCAAGTGACTAAGCCGTGTTTCTCCATTAATACAAGCGCGGCGT‑GGGGGTTGTTTGCTACGcc < 6:304223/139‑1 (MQ=255) tCGTTAATATACTGCTCGGCTTCTTGAATGATGGATATCGTTTTTTGATAACATGTTTCAGACGTCTCTCCCCAAGTGACTAAGCCGTGTTTCTCCATTAATACAAGCTCGGCGT‑GGGGGTTGTTTGCTACGCCTTCAg > 2:37972/1‑139 (MQ=255) ttAATCTACGGGGCGGCTTCGTGACTCATGGCTAGCGGTTTTTGAAAACAGGTTTCAGACGTCTCTCCCCAAGTGACTAAGCCGTGTTTCTCCATTAATACAAGCTCGGCGT‑GGGGGGTGTTTGCTACGCCTGCAGCGa < 2:311081/139‑1 (MQ=255) 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aaTACAAGCGCGGCGT‑GGGGGGTGGTTGCTACGCCTTCAGCGATCATTTTAGACAAAGTAAATCCAGGACGGACGTATGGCACCCATACAAACCGATTTCCGTAAATGTCTTCAGCGATTTGTTTTCCATTATCCGca < 8:139739/138‑1 (MQ=255) aTACAAGCTCGGCGT‑GGGGGTTGTTTTCTACGCCTTCATCGTTGATTTTAGACAAAGTAAATCCAGGACGGACGTATGGCACCCATACAAACCGATTTACGTAAATGTCTTCAGCGATTTGTTTTGCATTTTCCGcccg > 5:280508/1‑136 (MQ=255) aaGCTCGGCGT‑GGGGGTTGTTTGCTACGCCTTCAGCGATCATTTTAGACAAAGTAAATCCAGGACGGACGTATGGCACCCATACAAACCGATTTCCGTAAATGTCTTCAGCGATTTGTTTTCCATTATCCGCACAGCat < 1:37972/139‑1 (MQ=255) aGCTCGGCGT‑GGGGGTTGTTTGCTACGCCTTCAGCGATCATTTTAGACAAAGTAAATCCAgga > 7:29454/1‑63 (MQ=255) aGCTCGGCGT‑GGGGGTTGTTTGCTACGCCTTCAGCGATCATTTTAGACAAAGTAAATCCAgga < 8:29454/63‑1 (MQ=255) aGCTCGGCGT‑GGGGGTTGTTTGCTACGCCTTCAGCGATCATTTTAGACAAAGTAAATCCAGGACGGACGTATGGCACCCATACAAACCGATTTCCGTaa > 6:166051/1‑99 (MQ=255) aGCTCGGCGT‑GGGGGTTGTTTGCTACGCCTTCAGCGATCATTTTAGACAAAGTAAATCCAGGACGGACGTATGGCACCCATACAAACCGATTTCCGTaa < 5:166051/99‑1 (MQ=255) gCTCGGCGT‑GGGGGTTGTTTGCTACGCCTTCAGCGATCAATTTAGACAAAGTAAATCCAGGACGGACGTATGGCACCCATACAAACCGATTTCCGTAAATGTCTTCAGCGATTTGTTTTCCATTATCCGCACAGCatat < 4:16127/139‑1 (MQ=255) cTCGGCGT‑GGGTGTTGTTTGCTACGCCTTCAGCTATCATTTTAGTCAAAGTAAATCCAGGACGGACGTATGGCAAGCATACAAACCGATTTGCGTAAATGTCTTCAGCGATTTGTTTTCCATTATCCGCACACCATATg < 7:211639/139‑1 (MQ=255) ggCGT‑GGGGGTTGTTTGCTACGCCTTCAGCGATCATTTTAGACAAAGTAAATCCAGGACGGACGTATGGAACCCATACAAACCGATTTCCGTAAATGTCTTCAGCGATTTTTTTTCCATTATCCGCACAGCATATGCt > 1:256155/1‑138 (MQ=255) ggTTGTTTGCTACGCCTTCAGCGATCATTTTAGACAAAGTAAATCCAGGACGGACGTATGGCACCCATACAAACCGATTTCCGTAAATGTCTTCAGCGATTTGTTTTCCATTATCCGCACAGCATATGCTGATAATCGc < 3:282391/139‑1 (MQ=255) ttgttTGCTACGCCTTCAGCGATCATTTTAGACAAAGTAAATCCAGGACGGACGTATGGCACCCATACAAACCGATTTCCGTAAATGTCTTCAGCGATTTGTTTTCCATTATCCGCACAGCATATGCTGATAATCGCAt < 8:109783/139‑1 (MQ=255) | ATGCTGATTGATACGATCGTTAATATACTGCTCGGCTTCTTGAATGATGGATATCGTTTTTTGATAACATGTTTCAGACGTCTCTCCCCAAGTGACTAAGCCGTGTTTCTCCATTAATACAAGCTCGGCGT‑GGGGGTTGTTTGCTACGCCTTCAGCGATCATTTTAGACAAAGTAAATCCAGGACGGACGTATGGCACCCATACAAACCGATTTCCGTAAATGTCTTCAGCGATTTGTTTTCCATTATCCGCACAGCATATGCTGATAATCGCAT > CP006881/3021106‑3021380 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |