| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 30,182 | C→T | 100% | intergenic (+147/‑96) | U712_00120 → / → U712_20865 | Sigma‑K factor‑processing regulatory protein BofA/16S ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 30,182 | 0 | C | T | 100.0% | 311.3 / NA | 93 | intergenic (+147/‑96) | U712_00120/U712_20865 | Sigma‑K factor‑processing regulatory protein BofA/16S ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (52/41); total (52/41) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TATTGACTTAGACAACTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGCGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTG > CP006881/30047‑30317 | tATTGACTTAGACAACTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGt < 7:49965/139‑1 (MQ=255) aTTGACTTAGACAACTGAAGGTGTTTTTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACTGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGt < 6:259528/138‑1 (MQ=255) tGACTTAGACAACTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTaaa > 7:55031/1‑139 (MQ=255) tGACTTAGACAACTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTaaa > 2:248812/1‑139 (MQ=255) tGACTTAGACAACTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTAATGATAATAAAGTCGCGTAAACGAGTGGTaaa > 6:178065/1‑139 (MQ=255) gACTTAGACAACTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACTATTGGTaaa > 6:165265/1‑138 (MQ=255) aCTTAGACAACTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAAc > 5:280102/1‑138 (MQ=255) cTTAGACAACTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACa < 5:178065/138‑1 (MQ=255) ttAGACAACTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGATGACAGTAGAGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACa > 3:101287/1‑137 (MQ=255) gACAACTGATGGTTTTATTATAATATACTTGGCTGATGAAGAACAGCTTTTTTGAAAATAAAATGCTAATAAGTTGTTGACAGTAGCTGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGt < 3:3677/138‑1 (MQ=255) gACAACTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGtt > 5:56029/1‑139 (MQ=255) gACAACTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAAAAAATTCGCTTAAACCAGTTGTAAAAAAAGt > 4:3677/1‑138 (MQ=255) aCTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCttt < 3:137866/139‑1 (MQ=255) aCTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCttt > 7:96704/1‑139 (MQ=255) aCTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCttt > 7:70116/1‑139 (MQ=255) cTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCttt > 2:29324/1‑138 (MQ=255) cTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCttt > 5:158038/1‑138 (MQ=255) cTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCttt > 7:115252/1‑138 (MQ=255) cTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTg > 3:171912/1‑139 (MQ=255) aGGTGTTCTTCTAAAAAACGTCGCAGATGCCGACCAGCGTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAACAGTTGTTGACAGGCCCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGaaaa < 4:102605/139‑1 (MQ=255) ttATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACATCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTaaa < 5:4886/139‑1 (MQ=255) ttATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTaaa > 6:109851/1‑139 (MQ=255) tATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACTGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTaaa > 7:210606/1‑138 (MQ=255) tATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTTAAAACTaaa < 6:158038/138‑1 (MQ=255) tATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTaaa < 1:175877/138‑1 (MQ=255) tATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTaaa > 6:241527/1‑138 (MQ=255) atatACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCTGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACa < 1:248812/138‑1 (MQ=255) atatACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACa > 3:238037/1‑138 (MQ=255) atatACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACa > 5:255559/1‑138 (MQ=255) cGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACg > 6:235116/1‑138 (MQ=255) cGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACg > 4:44529/1‑138 (MQ=255) cGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTATTTTATAACTAATCAAGTCAAAACg > 6:16369/1‑138 (MQ=255) gTCGCTGATTACTAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTa < 6:22621/139‑1 (MQ=255) gTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTa > 8:70888/1‑139 (MQ=255) gTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTa > 3:166276/1‑139 (MQ=255) gTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTACGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTa > 1:154304/1‑139 (MQ=255) gTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTAGTTGACAGTATCTGCGGTAAATCTAATGATAATAAACTCTCTAAAAACAGTGGTAAACAAAGTACTTTGAAAACAAAACAATAAAAAActa > 6:176391/1‑136 (MQ=255) tCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTAc < 4:272950/139‑1 (MQ=255) cGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAg > 6:176829/1‑127 (MQ=255) cGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAg < 5:176829/127‑1 (MQ=255) cGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTAcc > 4:136940/1‑139 (MQ=255) cGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTAcc > 7:158487/1‑139 (MQ=255) cTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTg > 7:193303/1‑139 (MQ=255) cTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTg > 2:156565/1‑139 (MQ=255) cTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTg < 8:70116/139‑1 (MQ=255) gAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCa < 4:213052/139‑1 (MQ=255) gAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCGTTAAAGAGTGGTAAACAAAGTTGTTTGAAAACAAAAAAAGACAAAACGTACCTGTTAAttg > 2:265908/1‑137 (MQ=38) aCAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAtt > 2:92639/1‑139 (MQ=255) gCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAtttt > 4:84142/1‑138 (MQ=255) ttGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATaaa < 4:171912/138‑1 (MQ=255) aaagaaaaTGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGca < 3:84142/139‑1 (MQ=255) aaagaaaaTGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGca < 3:44529/139‑1 (MQ=255) aaagaaaaTGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGca < 5:109851/139‑1 (MQ=255) aaagaaaaTGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGca < 7:223089/139‑1 (MQ=255) aaagaaaaTGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGca < 1:265908/139‑1 (MQ=255) aaagaaaaTGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGca < 4:170279/139‑1 (MQ=255) aaagaaaaTGCTAAAAAGTTGGTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGca < 4:170282/139‑1 (MQ=255) agaaaaTGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCTGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGcaca < 5:187733/139‑1 (MQ=255) aaaTGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATTTTATGATAATAAAGTCTCTTAAACGAGTGGTTAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCa < 5:165265/139‑1 (MQ=255) aaaTGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGc < 4:166276/138‑1 (MQ=255) aaaTGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCa < 4:115263/139‑1 (MQ=255) aaaTGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTAAGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGc < 2:154304/138‑1 (MQ=255) aaaTGCTAAAAAGTTGGTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCa < 5:16369/139‑1 (MQ=255) taaGTTGTTGACAGTAGGGGCGGTAAATGTTATGATTATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGGACAGCAATGTGCGTa < 6:149149/138‑1 (MQ=255) aGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTagt < 5:176391/139‑1 (MQ=255) gttgACAGTATCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTTGTAAACAAAGGTCTTTGAAAAATAAACAAGACAAAACGTACCGGTTAAATCAATTTTATAAATATCACATCAATGTTCGTagtcag > 3:64800/1‑138 (MQ=21) gttgACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTagtcagt > 4:263524/1‑139 (MQ=255) gttgACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTagtcagt > 3:92551/1‑139 (MQ=255) gttgACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTagtcagt > 3:135762/1‑139 (MQ=255) gACTGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGGTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTATACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTGATTTTTATAAATCGGACATCAATTTGCGTTgtgagtca < 6:56029/138‑1 (MQ=21) gTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAacta < 8:210606/139‑1 (MQ=255) cggcggTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACttt > 1:251842/1‑139 (MQ=255) gTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAACCTACTTTATCg > 8:177890/1‑138 (MQ=255) gTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATct > 5:104667/1‑137 (MQ=255) gTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCg > 5:114492/1‑138 (MQ=255) tAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGga < 3:284060/139‑1 (MQ=255) gTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACATAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGtt > 4:76682/1‑139 (MQ=255) ttATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACATAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGttt < 3:76682/139‑1 (MQ=255) ttATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGttt < 2:251842/139‑1 (MQ=255) ttATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGttt < 6:280102/139‑1 (MQ=255) tATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGttt > 4:125864/1‑138 (MQ=255) tATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGttt > 7:98937/1‑138 (MQ=255) ataataAAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGTTTGATc < 1:26473/138‑1 (MQ=255) ataaAGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGTTTTATCCTgg > 1:99200/1‑139 (MQ=255) aaaGTCGCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCt < 4:64800/139‑1 (MQ=255) gCTTTAACGAGTGGTAAACAAAGTTCATTGAAAACTAAACAACACAAAAACTACCGGTTAAATCATTTTTATAAAACGCACCGCAATCTTCGTACTCAGTCAAACTACTTTATCCGAGAGTTTTATACTGGCTCAGGAc > 2:146051/1‑139 (MQ=14) gCTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCCCACAGCAATGTTCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGAc > 4:252923/1‑139 (MQ=255) cTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGAc > 7:49812/1‑138 (MQ=255) cTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGAc > 7:280667/1‑138 (MQ=255) cTTAAACGAGTGGTAAACAAAGTTATTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGAc > 8:31553/1‑138 (MQ=255) aaaCGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGaa < 6:1732/138‑1 (MQ=255) aaaCGAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGaa < 6:255559/138‑1 (MQ=255) gAGTGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTg > 4:167236/1‑139 (MQ=255) | TATTGACTTAGACAACTGAAGGTGTTATTCTAATATACGTCGCTGATGACGAACAGCTTTTTTGAAAAGAAAATGCTAAAAAGTTGTTGACAGTAGCGGCGGTAAATGTTATGATAATAAAGTCGCTTAAACGAGCGGTAAACAAAGTTCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCATTTTTATAAATCGCACAGCAATGTGCGTAGTCAGTCAAACTACTTTATCGGAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTG > CP006881/30047‑30317 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |