Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | BS168_reference_genome | 608,219 | (A)5→6 | intergenic (‑144/+27) | ydgF ← / ← dinB | putative amino acid permease/nuclease inhibitor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | BS168_reference_genome | 608,214 | 1 | . | A | 88.2% | 890.0 / 110.9 | 264 | intergenic (‑139/+32) | ydgF/dinB | putative amino acid permease/nuclease inhibitor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (8/23); new base A (163/68); total (173/91) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.74e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
TCGTCTGTCACTTTATGTGTTCCTCCATTGAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑G‑AA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGCTGTGATATTGCCGCGGTGGTATGTCCCGTG > BS168_reference_genome/608065‑608359 | tcgtcTGTCACTTTATGTGTTCCTCCATTGAAAATTGATTATTGTGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGGCTATTTCCC‑g > 1:2374847/1‑150 (MQ=255) cgtcTGTCACTTTATGTGTTCCTCCATTGAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑G‑a > 1:226958/1‑150 (MQ=255) tcTGTCACTTTATGTGTTCCTCCATTGAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑G‑aa‑a > 2:3320108/1‑150 (MQ=255) cTGTCACTTTATGTGTTCCTCCATTGAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑G‑aa‑a‑a < 1:3694149/150‑1 (MQ=255) tCATTTTATGTGTTCCTCCATTGAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑G‑aa‑a‑a‑aag < 2:1207802/150‑3 (MQ=255) aCTTTATGTGTTCCTCCATTGAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑G‑aa‑a‑a‑aagcg < 2:1535761/150‑5 (MQ=255) cTTTATGTGTTCCTCCATTGAGAATTGTTTACTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAATTTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑G‑aa‑a‑a‑aagcgg < 1:2428940/150‑6 (MQ=255) ttATGTGTTCCTCCATTGAAGATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCt < 1:1186693/150‑1 (MQ=255) ttATGTGTTCCTCCATTGAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCt < 1:307992/150‑1 (MQ=255) ttATGTGTTCCTCCATTGAAAATTGTTTATTGAGTCACGAGTCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAAATTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑G‑AA‑A‑A‑A‑ggcggat > 1:3254849/1‑144 (MQ=255) tATGTGTTCCTCCATTGAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTc < 2:1286521/150‑1 (MQ=255) aTGTGTTCCTCCATTGAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTcc > 1:1886570/1‑150 (MQ=255) tgtgTTCCTCCATTGAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCa < 2:3355413/150‑1 (MQ=255) gtgtTCCTCCATTGAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GTGGCTCCAt > 1:907639/1‑150 (MQ=255) gtTCCTCCATTGAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCAttt > 1:1871172/1‑150 (MQ=255) cctccATGGAAAGTTGTTTATTGAGACAGCAATCTATGTTTAATGATTATTATGACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAGAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCT‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAgg < 2:407552/150‑1 (MQ=255) ctccATTGAAAATTGTTTATTGAGCCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAggg < 2:155336/150‑1 (MQ=255) tccATTGAAAATTGTTTTTTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGa < 2:1832063/150‑1 (MQ=255) cATTGAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATCTAGGGAGc > 2:1610835/1‑150 (MQ=255) ttGCAAGTTGTTTATTGAGCCAGGAGTCTAGTGTTGAGGATTATTAAAACACAAAAATTTCTATCTTTTTTACTAATACAGGTTTGATGAAAAGAATCTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑G‑AA‑A‑A‑AGGGGGCGCCATTTAGGGAGcca < 2:3162976/150‑2 (MQ=255) tGAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGc < 2:2003979/150‑1 (MQ=255) gAAAATTGTTTATTGAGTCAGCATTCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTTTTTCCC‑G‑AA‑A‑A‑AGGCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCt < 1:2836533/150‑1 (MQ=255) gAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCt < 2:1671848/150‑1 (MQ=255) aaaTTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCatt > 1:1958073/1‑150 (MQ=255) tGTTTATGGAGTCAGCAATCTTTTTTTAATGATTTTTAAAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACAAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTGCCC‑G‑AA‑A‑A‑AGGCGGCTCCATTTAGGGAGCCTCTTTTTTa < 1:3278619/150‑1 (MQ=255) gTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCCTTTTTaa > 2:214801/1‑149 (MQ=255) tttATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATg < 2:840258/150‑1 (MQ=255) ttATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGGGCCGCTTTTTTATGc > 2:588669/1‑150 (MQ=255) tATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GGGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCt > 1:1500975/1‑150 (MQ=255) gAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GGGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCttttt > 1:1649556/1‑150 (MQ=255) gAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCGTTGTTATGCttttt > 2:3775985/1‑150 (MQ=255) aGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATTTTTTTTACAAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCCCTTTTTTATGCTTTTTc < 1:1320725/150‑1 (MQ=255) aGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTc > 2:2710200/1‑150 (MQ=255) cAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCCCTTTTTTATGCTTTTTCAGtttt < 1:3718216/150‑1 (MQ=255) aTCAATTTTTATTAATTATAATAACACTCAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTTTTTCAG‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGTTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTg < 1:1043188/150‑1 (MQ=255) tCTATTTTTAATGATAATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCACTCAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGt > 1:688711/1‑150 (MQ=255) cTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCAGCTCCATTTACGGAGCCGCCTTTTTATGCTTTTTCTGTTTTTGTc > 1:1236215/1‑150 (MQ=255) aTTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAACTGTTTTGATGATATTAATTTTAATGTGATTTGGTCTTTTTCCC‑G‑AA‑A‑A‑ACGCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCAt < 1:1760990/150‑1 (MQ=255) ttAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTCTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAAc > 2:1174527/1‑150 (MQ=255) tAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGATCCATTTAGGGTGCCGCGTTCTTATGCTTTTTCTGTTTTTGTCATAAACa > 1:1377049/1‑150 (MQ=255) tAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑ACGGCTCCATTTAGCGAGGCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTGTGTCATtaata > 1:2925755/1‑148 (MQ=255) tAATGATTATTATAAAACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCTCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACa < 1:3534565/150‑1 (MQ=255) aaTGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCACTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAg < 1:2117079/150‑1 (MQ=255) aTGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAAAGTGATTTGGACTATTTCCC‑G‑AAGA‑A‑A‑GTGGCTGCATTTAGGGAGCCGCTTGTTAATGCTCTTTCAGTTTTTGTCATAAACAgg > 2:108468/1‑150 (MQ=255) tGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGt > 2:3876212/1‑150 (MQ=255) gATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTa > 2:3664840/1‑150 (MQ=255) ttattaTAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTaga > 1:597834/1‑150 (MQ=255) ttatAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GGGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGGGcc > 1:2760509/1‑150 (MQ=255) tataACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGccc > 2:2241464/1‑150 (MQ=255) tataACACTAAAAGTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGTCGATTTCCC‑GCAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCACGGAGGGAGCCGCGCTGCTAGGCTCTATCAGTTTTTGCCATACACAGGTAGAGccc > 2:814717/1‑150 (MQ=255) ataACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GAGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTagag > 1:2833506/1‑146 (MQ=255) taACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGt > 2:2939721/1‑150 (MQ=255) cacTAAAATTTTAATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGATTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAAt < 1:3756499/150‑1 (MQ=255) cacTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGGGCCCGTAAt > 2:2622881/1‑150 (MQ=255) cacTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAAt > 2:2814872/1‑150 (MQ=255) cacTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCCTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAAt > 1:1805078/1‑150 (MQ=255) cTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCt < 2:3985102/150‑1 (MQ=255) tAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GAGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCACAAACAGGTAGAGCCCGTAGTCTg > 1:3330001/1‑150 (MQ=255) aaaaTTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTAGTCATAAACAGGAAGAGCCCGTAATCTGt > 1:2603202/1‑150 (MQ=255) aaaTTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTGTTGGTCCTGAACAGGGAGAGCCCGTGATCTGTc > 2:670234/1‑150 (MQ=255) aTTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCgg > 2:1953200/1‑150 (MQ=255) ttCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GGGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTATTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTg > 2:3340133/1‑150 (MQ=255) ttCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTg > 2:2426594/1‑150 (MQ=255) tATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCCTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGGAGAGCCCGTAATCTGGCGGTGCgg > 2:1437528/1‑150 (MQ=255) ttttttACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGc > 1:2657253/1‑150 (MQ=255) tttttACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAGTTTTAATGTGATTTGGACTATCTCCC‑G‑AA‑A‑A‑AGGCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCg < 1:1209457/150‑1 (MQ=255) tttACTAATAAAGGATTGATGACAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTa < 2:2865469/150‑1 (MQ=255) taaCTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAg < 2:3056985/148‑1 (MQ=255) aCTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCGTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGGAgcc > 1:843044/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGATTGAAGAAATGTATTTAATTGTCATTTGGACTATTTCCC‑G‑AA‑A‑A‑ACGCGGCTCCATTTAGGGATCCCCTTTTTTACGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAgcctgcc < 1:4017597/150‑1 (MQ=255) aGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCtgcctgcc < 2:355121/150‑1 (MQ=255) aTTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTGTTTCCC‑G‑AA‑ACA‑T‑GCGGCTCCATTTAGGGATCCCCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCgca < 2:3748349/150‑1 (MQ=255) gatgaAAAGAATTTTCATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCgcagca < 2:3419760/150‑1 (MQ=255) gatgaAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCgcacca > 2:1808542/1‑150 (MQ=255) gatgaAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GAGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCgcagca > 1:3026214/1‑150 (MQ=255) atgaAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GAGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTGGAGCCCGTAATCTGTCGGAGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCAt > 1:4051777/1‑150 (MQ=255) tgaAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GGGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGCAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCAtt > 1:341722/1‑150 (MQ=255) tgaAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCAtt < 2:2929061/150‑1 (MQ=255) aaaaGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCCAA‑AA‑A‑A‑A‑CCGGCTCCATTTAGGGAGCCTCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGc < 1:2541636/150‑1 (MQ=255) aaaaGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGc > 2:1592757/1‑150 (MQ=255) aaGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCGTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGGCGGTGCGGGTGGGGAGCCTGCCTGCCGCTGCCTTGCtg > 1:2329224/1‑150 (MQ=255) aGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGCtgt > 1:3850204/1‑150 (MQ=255) aGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCATTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTACTCTGGCGGTGCGGAGGCGGAGCCAGCCTCCCGCAGCATTGCtgt > 2:3489741/1‑150 (MQ=255) gAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑G‑AA‑A‑A‑AGGCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGCtgtg < 2:2338669/150‑1 (MQ=255) tttttAATGTGATGTGGACTATTTCAC‑G‑AA‑A‑ACA‑GCGGCTCCTTTTTGGGCGCCGTTTTTTTATGCTTTTCCAGTCTTTGTCATGAACAGGTAGAGCCCGTACTCTGTCGGTGCGGGTGCGTAGCCCGCCTGCCGCAGCATTGCTGTGat < 2:2853135/149‑1 (MQ=255) aaTGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GGGGCTCCATTTAGGGAGCCGCCTTTTTATGCTTTTTCTGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGCTGTGATATTGc > 1:3150557/1‑150 (MQ=255) aaTGTGATTTGGACTATTTCCC‑G‑AA‑A‑A‑AGGCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGCTGTGATATTGc < 2:3466624/150‑1 (MQ=255) aTGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGCTGTGATATTGcc < 2:2841333/150‑1 (MQ=255) aTGTGATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCCCAGCATTGCTGTGATATTGcc > 2:1103920/1‑150 (MQ=255) gtgATTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCCTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGCTGTGATATTGCcgc > 1:3883411/1‑150 (MQ=255) aTTTGGACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTACTCTGTCGGTGCGGGTGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGCTGTGTTATTGCCGCggg > 2:2267314/1‑149 (MQ=255) tttGAACTATTTCCT‑G‑AA‑A‑AGT‑GCGGCTGCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTATTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCTCAGCATTGCTGTGATATTGCCGCggtg < 1:814717/150‑1 (MQ=255) ggACTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGAAGCGTAGCCTGCCTGCCCCAGCATTGCTGGGGTATGGCCGCGGTGGTa > 2:1888266/1‑150 (MQ=255) aCTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGCTGTGATATTGCCGCGGTGGTATg < 2:1420421/150‑1 (MQ=255) aCTAATTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GAGGCTCCATTTAGGGGGCCGCCTTGTTATGTTTTTTGTGATTTGCTCATAAGCAGGTAGGGCCCGTAATCTGTCGGGGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCCGCATTGCTGGCGTATTGCCGCCGTGGTATg > 1:1004649/1‑150 (MQ=255) cTATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGCTGTGATATTGCCGCGGTGGTATGt < 2:2197130/150‑1 (MQ=255) tATTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAAAAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGGTGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGGATTGGTGTGGTATTGGCGCGGTGGGATGTc > 2:1469893/1‑150 (MQ=255) aTTTCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGCTGTGATATTGCCGCGGTGGTATGTcc < 2:1762820/150‑1 (MQ=255) tttCCC‑GAAA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGCTGTGATATTGCCGCGGTGGGATGTccc > 1:510399/1‑150 (MQ=255) tttCCC‑G‑AA‑A‑A‑AGGCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGCTGTGATATTGCCGCGGTGGTATGTccc < 2:3850979/150‑1 (MQ=255) | TCGTCTGTCACTTTATGTGTTCCTCCATTGAAAATTGTTTATTGAGTCAGCAATCTATTTTTAATGATTATTATAACACTAAAATTTCTATCTTTTTTACTAAAAAAGGATTGATGAAAAGAATTTTAATGTGATTTGGACTATTTCCC‑G‑AA‑A‑A‑A‑GCGGCTCCATTTAGGGAGCCGCTTTTTTATGCTTTTTCAGTTTTTGTCATAAACAGGTAGAGCCCGTAATCTGTCGGTGCGGATGCGTAGCCTGCCTGCCGCAGCATTGCTGTGATATTGCCGCGGTGGTATGTCCCGTG > BS168_reference_genome/608065‑608359 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |