| Predicted mutation | ||||||
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| RA | BS168_reference_genome | 165,826 | +C | intergenic (+1/‑4) | trnI‑Asn → / → trnI‑Thr | tRNA‑Asn/tRNA‑Thr |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | BS168_reference_genome | 165,825 | 1 | . | C | 99.2% | 432.9 / ‑3.4 | 125 | noncoding (72/72 nt) | trnI‑Asn | tRNA‑Asn |
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Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
TGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATATCTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑G‑CATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCTTAAATGTATTATTACCAAGGTTTCTCATAAGGAGAAAGCTTTTTTTATTGCGATAT > BS168_reference_genome/165685‑165958 | tgAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑g > 5:203010/1‑139 (MQ=255)tgAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACATGCGGA‑g > 5:291499/1‑139 (MQ=255) gTAGGACGCCGCCAAGCAGCTTTATTAATTCTCCCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑G‑ccatt < 5:47971/139‑5 (MQ=18) gTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑G‑ccatt < 5:233631/139‑5 (MQ=21) ggACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCt > 7:373058/1‑139 (MQ=21) gACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCtt > 8:401344/1‑139 (MQ=21) aCGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTc > 1:376167/1‑139 (MQ=21) gccgccATGCAGATTTCTTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCa < 5:12512/139‑1 (MQ=18) gccgccAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCa < 1:167838/139‑1 (MQ=21) gccgccAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCa < 5:233708/139‑1 (MQ=21) gccgccAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCa < 3:451993/139‑1 (MQ=21) cgccAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCa > 1:146976/1‑137 (MQ=21) ccAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGc < 1:494653/139‑1 (MQ=21) ccAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGc < 6:223889/139‑1 (MQ=21) cAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTcagc < 7:257077/139‑1 (MQ=21) cAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATAT‑T‑ATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTcagc < 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aTCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATgg < 7:316837/72‑1 (MQ=255) aTCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATgg > 8:316837/1‑72 (MQ=255) aTCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCTTAAATGTATTATTACCAAGGTTTCTCAt > 4:462017/1‑138 (MQ=255) gTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCTTAAATGTATTATTACCAAGGTTTCTCATAAGgaga < 6:203010/138‑1 (MQ=255) tAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATgg < 5:5252/64‑1 (MQ=255) cGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCTTAAATGTATTATTACCAAGGTTTCTCATAAGGAGAAAGCtttt > 6:390672/1‑139 (MQ=255) cGAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCTTAAATGTATTATTACCAAGGTTTCTCATAAGGAGAAAGCttt < 2:132581/138‑1 (MQ=255) gAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCTTAAATGTATTATTACCAAGGTTTGTCATAAGGAGAACGCttttt > 1:518492/1‑139 (MQ=255) gAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCTTAAATGTATTATTACCAAGGTTTCTCATAAGGAGAAAGCttttt > 5:132890/1‑139 (MQ=255) gAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCTTAAATGTATTATTACCAAGGTTTCTCATAAGGAGAAAGCttttt > 4:143237/1‑139 (MQ=255) gAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCTTAAATGTATTATTACCAAGGTTTCTCATAAGGAGAAAGCttttt > 5:168115/1‑139 (MQ=255) gAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCTTAAATGTATTATTACCAAGGTTTCTCATAAGGAGAAAGCttttt > 4:275033/1‑139 (MQ=255) gAATCCTACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCTTAAATGTATTATTACCAAGGTTTCTCATAAGGAGAAAGCttttt > 8:174184/1‑139 (MQ=255) tACCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCTTAAATGTATAATTACCAAGGTTTCTCATAAGGAGAAAGCTTTTTTTATTg > 4:382839/1‑139 (MQ=255) aCCTGCGGA‑GCCATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCTTAAATGTATTATTACCAAGGTTTCTCATAAGGAGAAAGCTTTTTTTATTGc > 7:68804/1‑139 (MQ=255) | TGAGAGTAGGACGCCGCCAAGCAGATTTATTAATTCTACCATGTTTGTTTATGAAGCTTTATATCTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGA‑G‑CATTGCTTCCATAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCAGCGGTTCGAGCCCGCTTGGAAGCTTAAATGTATTATTACCAAGGTTTCTCATAAGGAGAAAGCTTTTTTTATTGCGATAT > BS168_reference_genome/165685‑165958 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |