| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | BS168_reference_genome | 557,870 | (T)5→6 | intergenic (+421/‑3) | yddT → / → ydzN | putative exported phage protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BS168_reference_genome | 557,865 | 1 | . | T | 97.1% | 366.9 / 2.7 | 104 | intergenic (+416/‑8) | yddT/ydzN | putative exported phage protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/1); new base T (56/45); total (58/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.21e-01 | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
TGTGAAAGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAG‑TT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAATTGTG > BS168_reference_genome/557727‑557995 | tgtgAAAGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAg > 6:313311/1‑139 (MQ=255)tgtgAAAGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAg > 6:335085/1‑139 (MQ=255) gtgAAAGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAG‑t > 1:289358/1‑139 (MQ=255) tgAAAGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAG‑tt > 7:395682/1‑139 (MQ=255) tgAAAGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAG‑tt > 1:256970/1‑139 (MQ=255) tgAAAGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAG‑tt > 1:338396/1‑139 (MQ=255) aaaGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAG‑tt‑tt > 1:249952/1‑139 (MQ=255) tAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAG‑tt‑ttttaa < 7:96504/139‑4 (MQ=255) tAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAG‑tt‑ttttaa < 7:309615/139‑4 (MQ=255) aTGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAG‑tt‑ttttaatt > 6:273159/1‑134 (MQ=255) aTGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAG‑tt‑ttttaatt > 3:302750/1‑134 (MQ=255) aTGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAG‑TTGTTTAAtt > 5:477717/1‑139 (MQ=255) tGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTg > 1:147794/1‑139 (MQ=255) aTCAGTTAAGATAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTTGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTTATTTTTTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTaa < 5:343977/139‑1 (MQ=255) aTCAGTTAAGAAATGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTAATATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTaa < 5:315011/139‑1 (MQ=255) tCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTaaa < 4:257113/139‑1 (MQ=255) gAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCaa > 8:397443/1‑139 (MQ=255) ggTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGtt > 3:68567/1‑139 (MQ=255) ggTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGtt > 7:501350/1‑139 (MQ=255) tttAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGtttt > 2:8143/1‑139 (MQ=255) tttAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGtttt > 7:456514/1‑139 (MQ=255) tttAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGtttt < 4:68567/139‑1 (MQ=255) gttAAGATTATATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATTAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGtttt < 8:519235/138‑1 (MQ=255) ttAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGtttt < 3:156085/138‑1 (MQ=255) aaGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTg > 2:454075/1‑139 (MQ=255) aGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTAtag < 2:289358/138‑1 (MQ=255) aGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATAAAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTAtag < 6:5311/138‑1 (MQ=255) gATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGta < 5:282629/134‑1 (MQ=255) gATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGta > 6:282629/1‑134 (MQ=255) gATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTAtagta < 3:303796/139‑1 (MQ=255) gATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTAtagt < 2:338396/138‑1 (MQ=255) tatTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGc < 5:313311/139‑1 (MQ=255) tGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCAtt > 3:34982/1‑139 (MQ=255) tGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCAtt > 2:15931/1‑139 (MQ=255) gAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCAtt < 1:15931/138‑1 (MQ=255) gAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCAtt < 7:202023/138‑1 (MQ=255) gAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCAtt < 5:335085/138‑1 (MQ=255) aaTTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGAt < 1:435182/139‑1 (MQ=255) aaTTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGAt < 4:62201/139‑1 (MQ=255) tatatTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAatata < 6:514540/139‑1 (MQ=255) tatatTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAatata < 1:454075/139‑1 (MQ=255) cAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTtat < 8:482610/138‑1 (MQ=255) cAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTtat < 6:288994/138‑1 (MQ=255) aTAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATaaa < 8:331277/139‑1 (MQ=255) gTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTaa > 6:104030/1‑139 (MQ=255) cTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAAcc > 1:126097/1‑138 (MQ=255) ataataAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGAt < 6:165607/106‑1 (MQ=255) taataaCTGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCaa < 6:60075/137‑1 (MQ=255) taataaATGTATACAGATTGTAAGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAG‑TTATTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATGGGGATCAATATATGGTTATAATTTATTTACTAACCaag > 6:456446/1‑138 (MQ=255) taaATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGt < 4:403377/139‑1 (MQ=255) taaATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAACTATTTACTAACCAAGAAGt < 1:323696/139‑1 (MQ=255) aaTGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGt > 6:234120/1‑137 (MQ=255) ataCAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCaaga < 1:448550/129‑1 (MQ=255) ataCAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCaaga > 2:448550/1‑129 (MQ=255) taCAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTg > 8:452309/1‑77 (MQ=255) taCAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTg < 7:452309/77‑1 (MQ=255) taCAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTAc < 7:526855/119‑1 (MQ=255) taCAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTAc > 8:526855/1‑119 (MQ=255) taCAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTACCCAAGAAGTCAGtacta > 3:346589/1‑139 (MQ=255) aggATTGTATGGAGATGTAATTTTTTTAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGGTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGTATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCATAATGTCAGTactact < 1:477655/137‑1 (MQ=255) aTTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGAt > 8:153266/1‑89 (MQ=255) aTTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGt < 8:220227/139‑1 (MQ=255) aTTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGt > 7:272527/1‑139 (MQ=255) aTTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGt > 6:97909/1‑139 (MQ=255) aTTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGt > 4:141424/1‑139 (MQ=255) ttGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATTTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATAGATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGtt > 4:182830/1‑139 (MQ=255) ttGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGtt > 5:432457/1‑139 (MQ=255) ttGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGtt < 8:398763/139‑1 (MQ=255) tGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAatata > 1:200165/1‑94 (MQ=255) tGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAatata < 2:200165/94‑1 (MQ=255) tGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGtt > 6:141135/1‑138 (MQ=255) gTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGttt > 3:423519/1‑138 (MQ=255) tATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGACAGTACTACTCGTTtaa > 2:469061/1‑139 (MQ=255) aTGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCaa > 2:368248/1‑116 (MQ=255) aTGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCaa < 1:368248/116‑1 (MQ=255) tGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTtaat > 1:86581/1‑138 (MQ=255) agaTGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTactact > 7:251261/1‑127 (MQ=255) agaTGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTactact < 8:251261/127‑1 (MQ=255) gaTGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTtaataa > 2:204172/1‑136 (MQ=255) gaTGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAg > 2:109221/1‑139 (MQ=255) gaTGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTAAAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAg > 5:133615/1‑139 (MQ=255) gaTGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGATCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGATATAAATTATTTACTAACCAAAAAGTCAGTACTACTCGTTTaataatct > 2:477655/1‑137 (MQ=255) gaTGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGATTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTtat > 3:57621/1‑93 (MQ=255) gaTGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGATTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTtat < 4:57621/93‑1 (MQ=255) aTGTAATTAATTAAAAAGGAG‑TTATTTAATTGCGATGGAGTAAATGGATCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGc < 8:272527/139‑1 (MQ=255) tGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCaa < 6:382094/109‑1 (MQ=255) tGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCaa > 5:382094/1‑109 (MQ=255) tGTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCt > 2:16119/1‑139 (MQ=255) gTAATTAATTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCtt > 3:134514/1‑139 (MQ=255) taattaatTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAatata < 5:327069/82‑1 (MQ=255) taattaatTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAatata > 6:327069/1‑82 (MQ=255) taattaatTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGt > 8:27955/1‑112 (MQ=255) taattaatTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGt < 7:27955/112‑1 (MQ=255) taattaatTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCtt < 7:18633/138‑1 (MQ=255) taattaatTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTc > 5:117796/1‑139 (MQ=255) taattaatTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTc > 6:160835/1‑139 (MQ=255) taattaatTAAAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTc > 8:492243/1‑139 (MQ=255) ttaaAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAAtt > 8:511415/1‑139 (MQ=255) ttaaAAAGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAAtt > 4:135847/1‑139 (MQ=255) aaaaGGAGTTT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAAttgtg < 6:432457/139‑1 (MQ=255) | TGTGAAAGTAATGATTTGTAGGATCAGTTAAGAAAGGTTTAAGATTAGATATTGAAAAATTTTATATATTTTCAATAAAATACTGGTACTATAATAAATGTATACAGATTGTATGGAGATGTAATTAATTAAAAAGGAG‑TT‑TTTAATTGCGTTGGAGTAAATGGTTCAATGTTTTTTGTATAGTAGCATTGGGATCAATATATGGTTATAAATTATTTACTAACCAAGAAGTCAGTACTACTCGTTTAATAATAGCTTCTGTAATTGTG > BS168_reference_genome/557727‑557995 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |