Predicted mutation | ||||||
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JC | pSIJ663_pHT315_araE_xy | 2,655 | Δ3 bp | intergenic (–/‑321) | – / → eryR | –/– |
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Only 100 of 12784 total aligned reads displayed.
GAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2517‑2654 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGT > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2658‑2795 atTTGATGCTGGGGATACTATTTACCGCGGATCCATCTACTGAGGGAGTAAAGGATTTGAAAGATTTAGTTATATCATGGCAGGATGATGAGGTAGCTTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATGCCCGAAGC < 2:68625/137‑1 TATTGATGCTGGTGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGC < 4:327883/139‑1 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GGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGC > 1:204267/1‑129 GGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTGAGATCATTGAAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGACGCAAGCTTAA > 3:266729/1‑137 GGGGATACTATTTAAAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAA > 5:296858/1‑137 GGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAG < 8:245693/137‑1 GGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAG < 4:281924/137‑1 GGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAG < 3:289480/137‑1 GGATACTATTTACAGCGGCTCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAATTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGT < 2:124773/139‑1 ACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGT < 5:34930/139‑1 ACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAG > 5:165651/1‑134 ACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAG > 4:305943/1‑132 CTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGC < 8:50132/122‑1 TATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTAAAG > 8:33923/1‑130 TTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGTATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGAAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGA < 1:127709/138‑1 TTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGA < 4:10887/138‑1 TTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGA < 2:279468/138‑1 TTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGAGCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGA < 2:91316/138‑1 TTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAATTTAAGAGTGTGTTGA > 7:149603/1‑137 ACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGT > 6:317068/1‑139 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GGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAG > 1:73853/1‑138 GGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAG > 6:138005/1‑138 GGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGC < 3:316288/111‑1 GGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGC > 6:217655/1‑111 CGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAG < 4:258538/136‑1 CGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGT < 2:302975/123‑1 cttATGTCGTTAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCATGATAATGAGTTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCACGAAGCAAACTTAATAGTTTGTTGATAGCGCAGTATCTTAAAATT < 3:243449/136‑1 CTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATT < 7:85820/139‑1 ATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTG > 6:55827/1‑139 ATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTG > 8:133405/1‑139 ATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTG > 4:63529/1‑139 ATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTT < 3:168738/138‑1 ATGTAGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGA < 3:19161/116‑1 GTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGC > 1:100064/1‑95 TCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTG < 7:249512/138‑1 TCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTG > 8:220636/1‑138 TCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTG > 8:292481/1‑138 TCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTT < 2:150046/135‑1 TCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGC > 3:54252/1‑94 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TATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGC < 2:177752/67‑1 TCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAGCACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGATGTTAAATTAGATGC > 7:125494/1‑139 TCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGC > 2:254504/1‑65 GCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAA > 3:143557/1‑138 GCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATT > 7:272117/1‑117 GATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATT < 6:164217/95‑1 GATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGC < 7:173664/56‑1 TGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGACGCTAAAAATTTGTAAT > 2:329042/1‑139 TAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAG > 8:269733/1‑138 TAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAAT > 8:316741/1‑96 AGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAG > 1:254747/1‑137 GCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAG > 5:62095/1‑139 GCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGA < 6:193104/63‑1 CGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTT > 1:176263/1‑84 CACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTT > 1:280209/1‑74 ACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGT > 7:345295/1‑138 CCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCA < 1:44679/139‑1 CGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGTAGGGATTCGTCATGT > 3:216609/1‑139 AATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATA > 2:101210/1‑71 AATATGTTGATCACCGAAGCAATCTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAACTTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGTAGGGATTCGTCATGTTGGTATTC > 5:217676/1‑139 TATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCC > 5:8803/1‑138 TGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTTTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAA < 3:115544/138‑1 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CCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAA > 8:153705/1‑139 CCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAAT < 3:84808/139‑1 GAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2517‑2654 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGT > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2658‑2795 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
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