Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ BS168_reference_genome 166461–166703 171222–170066 3364–4762 12 [10] [11] 12 rrnH‑16S–[rrnH‑5S] rrnH‑16S,rrnH‑23S,[rrnH‑5S]

CTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAAGGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAA  >  BS168_reference_genome/166321‑166466
                                                                                                                                           |      
cTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGtttt        >  2:42521/1‑139 (MQ=11)
cTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGtttt        >  7:64238/1‑139 (MQ=11)
   caccaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAATACAAAACGTACCTCTTAATAAAGTTTTTa      >  2:70742/1‑138 (MQ=11)
   caccaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACTTAACTGTTAATTAAGTTTTTa      >  8:285856/1‑138 (MQ=11)
   caccaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa      >  2:165287/1‑138 (MQ=11)
   caccaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa      >  4:86075/1‑138 (MQ=11)
   caccaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTa      >  5:58918/1‑138 (MQ=11)
    accaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTaaa    <  6:157734/139‑1 (MQ=11)
    accaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTaaa    <  7:121740/139‑1 (MQ=11)
    accaAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTaaa    <  7:121742/139‑1 (MQ=11)
      caAAAGTTTTTAATAAATTTATTTACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTAAAAAAAGCGTACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACACGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTaaaaa  <  1:70742/139‑1 (MQ=11)
      caAAAGTTTTTAAAAAAGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTaaaaa  <  4:238164/139‑1 (MQ=11)
                                                                                                                                           |      
CTCCACCAAAAGTTTTTAAAAAAGGTTATTGACTTTGAAGAAGTGACATTGTATACTAATAAAGTTGCTTTAACAAAGCGGACAAACAAAATGATCTTTGAAAACTAAACAAGACAAAACGTACCTGTTAATTCAGTTTTTAAAAA  >  BS168_reference_genome/166321‑166466

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: