Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | pSIJ663_pHT315_araE_xy | 2,655 | Δ3 bp | intergenic (–/‑321) | – / → eryR | –/– |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | pSIJ663_pHT315_araE_xy | = 2654 | 73 (0.000) | 18407 (1.120) | 298/298 | 0.0 | 99.6% | intergenic (–/‑324) | –/eryR | –/– |
? | pSIJ663_pHT315_araE_xy | 2658 = | 74 (0.000) | intergenic (–/‑320) | –/eryR | –/– |
Only 100 of 18407 total aligned reads displayed.
ATAATCAGGGGGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2506‑2654 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAACAT > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2658‑2806 TAATCAGGGGGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGA < 2:1578191/150‑1 ATCAGGGGGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAG > 1:349186/1‑150 CAGGGGGAACTATTGATGCTGGGGATTCTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCA > 1:1318046/1‑150 GGGGGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAGAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATAGCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAA > 1:2751475/1‑150 GGGGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAAC > 1:3403263/1‑150 GGGACCTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACT < 2:1843592/150‑1 GGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTT > 2:3540958/1‑150 AACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGACCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAA > 2:4534148/1‑150 ATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGT > 1:2040313/1‑150 TTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTG < 1:4473410/150‑1 TTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTG < 1:2597994/150‑1 TGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGTTGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTT > 1:4649271/1‑150 GGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGT < 1:71702/150‑1 GGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGT > 1:791414/1‑150 GGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTATTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGT > 1:1726765/1‑150 GATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTG < 2:2626427/150‑1 CTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGT < 2:422891/150‑1 CTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGT < 2:4426581/150‑1 TATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTA < 1:2196131/150‑1 ATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTAT < 2:3919237/150‑1 TTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATC < 2:1109363/150‑1 TTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGCTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCT < 2:822220/150‑1 ACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGGGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGTTAGTGCAGTATCTTA > 1:86618/1‑150 AGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGGTGATAGTGCAGTATCTTAAA > 2:3238904/1‑150 GCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAA > 1:1873615/1‑150 GCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTT < 1:2675060/150‑1 GCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTT < 2:2104804/150‑1 GCGCCATCTACTGATGGCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTT < 1:4300494/150‑1 CGCCATCTACTGTTGGCGTAAAGGATTTGCAAGATTAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTT < 1:1084170/150‑1 GCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTG < 2:4329517/150‑1 ATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGT > 2:382686/1‑150 TCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTA > 2:3725776/1‑150 CTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTAT > 2:119963/1‑150 TGATGTCGAAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCAAGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCCAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAAATTAGTGAATAATA > 2:3630714/1‑150 GATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGGAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAG > 1:1566629/1‑150 TGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGA < 1:1960222/150‑1 TGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGA < 2:1291802/150‑1 GTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAA > 1:1000080/1‑150 TCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAAT < 2:3155214/150‑1 CGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATT < 2:4724603/150‑1 CGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATT < 2:1486111/150‑1 GTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTG < 1:581708/150‑1 AAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGGATTGAAG > 2:2377803/1‑150 AGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGT < 2:1756856/150‑1 GATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTACGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTA > 2:591045/1‑150 GATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTA > 2:4134226/1‑150 GATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGGTA > 1:2907430/1‑150 GATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCCTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTA > 1:1800821/1‑150 TGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATT > 1:235049/1‑150 AGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGAT < 2:739953/150‑1 ATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGC < 2:3066902/150‑1 TAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTCTTTGAACACCACGAGATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGGGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCT > 1:4031411/1‑150 AAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTA < 1:2272000/150‑1 AGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAA > 1:2514798/1‑150 AGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAA < 1:358097/150‑1 TTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAA > 1:147975/1‑150 TTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAA > 1:3066476/1‑150 TATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGTAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAAT < 1:3310892/150‑1 TATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAAT < 1:3852059/150‑1 TATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAAT > 2:462924/1‑150 TATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAAT > 1:944272/1‑150 TATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTT < 2:1934089/150‑1 TCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGT < 2:271858/150‑1 TGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATT < 2:2467449/150‑1 AGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAG > 2:2895557/1‑150 GGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGA < 2:255342/150‑1 GGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGA < 1:3752009/150‑1 CATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGA < 1:1163676/150‑1 ATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAG < 1:4201160/150‑1 TGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGG < 2:3336416/150‑1 GAGGTAGCGTTTTTGAACCCCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGG < 2:663812/150‑1 GAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGG > 2:1663673/1‑150 AGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGTTCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGA > 1:4740785/1‑150 GGTAGCGTTTTTGACCACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAGTAGGAAATGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGAT < 1:3671451/150‑1 GGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGAT < 2:1388591/150‑1 GTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATT < 1:2436443/150‑1 GTAGCGTTCTTGAACACCCCGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATT < 1:323087/150‑1 AGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATAAAGAAGGAGGGATTCG > 1:4118026/1‑150 TTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCAT < 2:2194057/150‑1 TTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTT > 1:282556/1‑150 AACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGT < 2:102814/150‑1 ACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGACATGTTGGTATT < 1:1645324/150‑1 CACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCC < 2:503362/150‑1 GATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAA < 1:2983171/150‑1 TATCTATTTTGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATG < 1:511332/150‑1 ATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGC > 2:4028027/1‑150 CTAATATGTTGTTCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGT > 1:649798/1‑150 AATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAA < 2:2016762/150‑1 AATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAA > 1:4392135/1‑150 ATATGTTGACCCCCGAAGCAATCTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAAT < 2:2981920/150‑1 TATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATG > 2:3437202/1‑150 TGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTA < 1:4560677/150‑1 GTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAG > 2:2811986/1‑150 GTTGAACCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAG < 1:3934054/150‑1 CCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAA > 1:1242812/1‑150 CCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAA > 2:2287081/1‑150 CCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAAC > 2:913267/1‑150 CCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAACA < 1:3144133/150‑1 CGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAACAT < 1:1402439/150‑1 CGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGGTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAACAT < 1:2117671/150‑1 ATAATCAGGGGGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2506‑2654 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAACAT > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2658‑2806 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |