Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 1,670,899 | C→T | Q50* (CAG→TAG) | U712_08610 → | Flagellar biosynthesis protein flhA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 1,670,899 | 0 | C | T | 98.6% | 230.4 / ‑4.0 | 70 | Q50* (CAG→TAG) | U712_08610 | Flagellar biosynthesis protein flhA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (40/28); total (42/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.66e-01 |
CGTTTTAATAAGTGTTGTCCTCATTGTGGCGATGCTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGCAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTCACACGGTGAGGGAGGTAAAGTCGTCGAGACTTTCG > CP006881/1670772‑1671031 | cGTTTTAATAAGTGTTGTCCTCATTGTGGCGATGCTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACAACAATGAATATGTAGGAAGCGCt > 7:93695/1‑138 (MQ=255) tttAATAAGTGTTGTCCTCATTGTGGCGATGCTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAg > 6:57062/1‑139 (MQ=255) tgttgtCCTCATTGTGGCGATGCTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGGTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGAtt > 4:232328/1‑139 (MQ=255) tgttgtCCTCATTGTGGCGATGCTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGAtt > 5:363228/1‑139 (MQ=255) tgttgtCCTCATTGTGGCGATGCTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGAtt > 8:261936/1‑139 (MQ=255) gttgtCCTCATTGTGGCGATGCTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGAttt > 2:315962/1‑139 (MQ=255) gtCCTCATTGTGGCGATGCTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTc > 8:123697/1‑139 (MQ=255) tCCTCATTGTGGCGATGCTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTcc > 5:16389/1‑139 (MQ=255) cTCATTGTGGCGATGCTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGt > 4:143381/1‑139 (MQ=255) aTTGTGGCGATGCTGGTGATTCCATTTCCTCCAAGCCGGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAAAGAAAATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTATTCCGTCAc > 4:226149/1‑139 (MQ=255) ggCGATGCTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTtg > 2:29046/1‑139 (MQ=255) tGCTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTtgct < 6:429583/136‑1 (MQ=255) tGCTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTtgct > 5:429583/1‑136 (MQ=255) tGCTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATCTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTgctgct > 4:206558/1‑139 (MQ=255) tGCTGGTCATTCCAATTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTAGATCGTGCTACTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGATTTCGATTTTTCCGTCACTGTtgctgca > 8:352504/1‑138 (MQ=255) cTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCttt < 7:21550/139‑1 (MQ=255) gTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTg < 8:93695/138‑1 (MQ=255) gTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGa > 8:355679/1‑139 (MQ=255) tCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTa > 4:106196/1‑139 (MQ=255) tCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTa > 6:392833/1‑139 (MQ=255) tCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTa > 1:174244/1‑139 (MQ=255) gTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTg > 7:334855/1‑115 (MQ=255) gTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTg < 8:334855/115‑1 (MQ=255) ttAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTc < 3:30996/98‑1 (MQ=255) ttAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTc > 4:30996/1‑98 (MQ=255) ttAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACg > 6:226284/1‑139 (MQ=255) ttAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACg > 8:412212/1‑139 (MQ=255) ttAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACg > 8:400377/1‑139 (MQ=255) aaGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGt < 3:80640/138‑1 (MQ=255) ttttGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCCCTGTTGGTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCaa > 6:308545/1‑138 (MQ=255) ttttGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGATTGATCGTCTCAAc > 6:256493/1‑139 (MQ=255) tGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTAc > 2:43899/1‑139 (MQ=255) tGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCGGCGTTTGACCCTAGTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTAc > 1:414878/1‑139 (MQ=255) gATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTAc < 5:57062/138‑1 (MQ=255) gATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCGTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTAc < 4:318217/138‑1 (MQ=255) tCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCg < 7:355679/139‑1 (MQ=255) tCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCg < 5:392833/139‑1 (MQ=255) ttaATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCaa < 1:43899/138‑1 (MQ=255) tctcTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACTATGAATTTGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTGTCAACTACCCGTTCAATTCTTTca < 7:352504/138‑1 (MQ=255) tctcTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTcac > 7:61525/1‑139 (MQ=255) tctcTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTcac > 5:287933/1‑139 (MQ=255) tctcTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTca < 7:123697/138‑1 (MQ=255) tctcTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTca > 7:67893/1‑138 (MQ=255) tctcTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTca < 1:29046/138‑1 (MQ=255) tctcTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTca < 6:16389/138‑1 (MQ=255) tctcTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTca > 3:119212/1‑138 (MQ=255) tctcTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTca < 3:106196/138‑1 (MQ=255) tctcTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTca > 2:98351/1‑138 (MQ=255) tctcTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGCAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTca > 6:75981/1‑138 (MQ=255) tctcTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGAAGCAAGCGCTTCAGTTTACGATTTTTCCGACACTGTTGCTTCTTTTGACGCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATACTTTca > 4:319569/1‑138 (MQ=255) ctctTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTcac < 1:83009/138‑1 (MQ=255) ctTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAAc > 3:89681/1‑108 (MQ=255) ctTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAAc < 4:89681/108‑1 (MQ=255) ttGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTTCCCGTTCAATTCTTTcaca < 3:259936/136‑1 (MQ=255) ttGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTcaca < 2:174244/136‑1 (MQ=255) ttGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTcaca < 4:24152/136‑1 (MQ=255) cGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTCACACGGTga < 7:400377/139‑1 (MQ=255) gTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTCACACGGTgag < 8:67893/139‑1 (MQ=255) gTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTCACACGGTgag < 5:283455/139‑1 (MQ=255) gTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTCACACGGTgag < 3:143381/139‑1 (MQ=255) gTGCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTCACACGGTGAGGGAGGTa < 6:363228/139‑1 (MQ=255) gCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTCACACGGTGAGGGAGGTaaa > 3:37146/1‑139 (MQ=255) gCTTCTCACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTCACACGGTGAGGGAGGTa > 3:74387/1‑137 (MQ=255) tctcACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGt > 3:19828/1‑93 (MQ=255) tctcACCACAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGt < 4:19828/93‑1 (MQ=255) tccccacAATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTCACACGGTGAGGGAGGTAAcgtcgt > 3:148326/4‑139 (MQ=255) cacaATGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTCACACGGTGAGGGAGGTAAAGTCGTCgag > 3:286756/1‑139 (MQ=255) tGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGtt < 7:433790/96‑1 (MQ=255) tGAATATGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGtt > 8:433790/1‑96 (MQ=255) atatGTAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTCACACGGTGAGGGAGGTAAAGTCGTCGAGACTTTCg > 3:451144/1‑138 (MQ=255) | CGTTTTAATAAGTGTTGTCCTCATTGTGGCGATGCTGGTGATTCCATTTCCTCCATGGCTGTTAAGTATTTTGATCATTATTAATATTTCTCTTGCGTTGATCGTGCTTCTCACCACAATGAATATGCAGGAAGCGCTTCAGTTTTCGATTTTTCCGTCACTGTTGCTGCTTTTGACCCTATTTCGTTTGGGCTTGAACGTCTCAACTACCCGTTCAATTCTTTCACACGGTGAGGGAGGTAAAGTCGTCGAGACTTTCG > CP006881/1670772‑1671031 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |