| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | BS168_reference_genome | 2,581,732 | (T)6→7 | intergenic (‑115/+39) | pstS ← / ← pbpA | phosphate ABC transporter (phosphate binding lipoprotein)/transpeptidase (penicillin‑binding protein 2A) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | BS168_reference_genome | 2,581,726 | 1 | . | T | 91.5% | 494.7 / 37.5 | 142 | intergenic (‑109/+45) | pstS/pbpA | phosphate ABC transporter (phosphate binding lipoprotein)/transpeptidase (penicillin‑binding protein 2A) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (5/7); new base T (47/83); total (52/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.41e-01 | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
GCAGCCATCAGAAGCATAAGCACCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑G‑T‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTCCTGCTTCGATTTCAGCTCAAA > BS168_reference_genome/2581577‑2581869 | gcagcCATCAGAAGCATAAGCACCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑g < 1:405146/150‑1 (MQ=255)gcagcCATCAGAAGCATAAGCACCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGAATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑g < 1:3917092/150‑1 (MQ=255) cagcCATCAGAAGCATAAGCACCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑G‑t < 1:1090375/150‑1 (MQ=255) agcCATCAGAAGCATAAGCACCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑G‑t‑t > 1:173994/1‑150 (MQ=255) tCAGAAGCATAAGCACCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑G‑t‑t‑tt‑ttt < 1:3002529/150‑2 (MQ=255) cAGAAGCATAAGCACCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACAGGTATAGAGTAAAGGTTCCATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑G‑t‑t‑tt‑tttg < 1:827264/150‑3 (MQ=255) gAAGCATAAGCACCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑G‑t‑t‑tt‑tttgta < 2:633116/150‑5 (MQ=255) aaGCATAAGCACCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑G‑t‑t‑tt‑tttgtat < 2:710776/150‑6 (MQ=255) gCATAAGCACCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATaa < 2:169635/150‑1 (MQ=255) aTAAGCCCCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCACCTGCCTATAATGTGTAATTTGTCCTGCACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATaaac < 1:647206/150‑2 (MQ=255) aTAAGCACCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATaaaa > 1:1746702/1‑150 (MQ=255) aaGCACCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATaaaaaa < 1:2189962/150‑1 (MQ=255) aGCACCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAACGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATaaaaaaa < 1:2626294/150‑1 (MQ=255) gCACCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCTCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATaaaaaaga < 1:1260810/150‑3 (MQ=255) ccAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATATTGTGGAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGc > 1:3596543/1‑150 (MQ=255) ccAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGc > 1:1785133/1‑150 (MQ=255) attttGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTTTAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGccc < 2:1867896/148‑1 (MQ=255) aaTTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGccc > 1:202127/1‑150 (MQ=255) aTTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCca > 1:1031896/1‑150 (MQ=255) aTTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCca < 1:2034650/150‑1 (MQ=255) aTTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGATTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAGAAAAACGCCca > 1:348995/1‑150 (MQ=255) tttGTTTTTTTTCATTTCCTGAGTTCCCCCTGCCTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAACGGGTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGGGCGG‑T‑T‑TT‑TT‑GGATAAAAAAAACGCCcac > 2:2076404/1‑150 (MQ=255) tttttttcCTTTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTCCAATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCAcatca < 2:567555/150‑1 (MQ=255) tttttgttCATTTCCTGATTTGCCCCTGCGTATAATGTGTACTTTGCCCTACGCGTATAGACTAAAGTTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAAAGAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAATACGCCCAcatca < 2:621643/150‑1 (MQ=255) ttttttcCCTTCCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAACACGCCCAcatcat < 2:2883453/150‑1 (MQ=255) tttCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTCCACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAACCGCCCACATCATGTGa < 1:2510360/150‑1 (MQ=255) ttccATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAGACGCCCACATCATGTGa < 1:140857/147‑1 (MQ=255) ttCATTTCCTGATTTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCAACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAACACGCCCACATCATGTGAg < 2:4034388/150‑1 (MQ=255) tCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGc > 2:2821271/1‑150 (MQ=255) cATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCg < 2:2762019/150‑1 (MQ=255) cATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGCAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑G‑T‑T‑TT‑TTCGTTTATTGTAAACGCCCACATCATGTGGGCg > 1:2937514/1‑150 (MQ=255) ttttCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTGGTCCTACACGTATAGAGTAGAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAACACGCCCACATCATGTGAGCGt < 1:3350142/149‑1 (MQ=255) ttttCTGAATTCCCATTGTTTATAATGTGTATTTTGTCCTACAGGTATAGAGTAATGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCAAATTTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAACACTCCCACATCATGTGAGCGtt < 1:1333677/150‑1 (MQ=255) tGAATTCCCCCTTGGTATAATGTGTAATTTGTCCTCCACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGATTGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGttttttt < 1:3936453/150‑1 (MQ=255) gAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCAACACGTATAGAGTAAAGGTTCAATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAACACGCCCACATCATGTGAGCGtttttttt < 1:3621559/150‑1 (MQ=255) cccccTGCGTATAGTGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGtt < 1:967808/150‑1 (MQ=255) cccccTGCGTATAATGTGTAATTTGCCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAACACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGtt < 1:2274866/150‑1 (MQ=255) ccTGCGTATAAGGTGTATTTTGCCCTCCACGTATAGAGTAAGGGTCCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATc < 2:2711582/150‑1 (MQ=255) tGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTGTCag > 2:3129405/1‑150 (MQ=255) gTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAACACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCagaag < 2:3872047/150‑1 (MQ=255) gTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACACCCACATCATGTGAGCGTGTTTTTTTAGTTATCcgaag > 1:3040196/1‑150 (MQ=255) gTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGGTTGAACCGAATGTCAAGGTTTTGTAAATCAAGGC‑G‑TCT‑AT‑TT‑GTAAACAAAAAACGCCCCAATCAGGTGAGCATTTATTTTTAGTTATCagaaa > 2:1156746/1‑149 (MQ=255) gTATAATGTGTAATTAGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAACCGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCagaag < 1:2814755/150‑1 (MQ=255) gtgtAATTTGTCCTACTCGTTTAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAACTCCGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTtgt < 1:1039859/150‑1 (MQ=255) tgtAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAACACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTtgtg < 2:3201439/150‑1 (MQ=255) gtAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTgtgt < 1:3756379/150‑1 (MQ=255) aaTTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGGGAGCGTTTTTCTTTAGCTTTCAGAAGACGGtgtgagt > 2:3716361/1‑147 (MQ=255) tcccggTATAGGGTAGTGGTTCTAGTTGAGAAGGGTGTGACCGGGATGTTAAGGTTTTGTAAATGAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAGACCCCCACATCATGTGAGGGTTGTTTCTTGGTAACCAGAAGTCGTTGTGTTTTCTGCAttt < 2:3044523/145‑1 (MQ=255) acGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTttct < 2:2685867/150‑1 (MQ=255) cGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGGTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTttctt > 2:2038496/1‑150 (MQ=255) cGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAACCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACGTCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTttctt < 2:1051542/150‑1 (MQ=255) tttaGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAGGGGTTTGAACCGAATGTTAGGGTTTTGTAATTCAGTGG‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAACACACCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCa < 1:3824439/148‑1 (MQ=255) taGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑G‑T‑TGTT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGGTTTTTTTTAGTTTTCAGGAGAGGTGGGGTTTTCTGCCGTTTCTTCAAt > 2:3598578/1‑150 (MQ=255) agagTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTCTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAAtt > 1:1193499/1‑150 (MQ=255) gagTAAAGGTCCTATGTAAAAAGGGTTTGACCCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGG‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAACTCGCCCCCATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGATATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAAttt < 2:879266/150‑1 (MQ=255) gTAGAGGTTCTATGTAAGAAGGGTTTGAACCGAGTGTTAAGGTTTTGTAAATTAGTGG‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAGCGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTg < 2:1972580/150‑1 (MQ=255) gTAAAGGTCCATTGAAAAAAGGGTTTGAACGGATTGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACCCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTg < 1:611051/150‑1 (MQ=255) tgagggTTCTATGTAAAAAGGGTTTGACCGGAATGTTAGGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAACCGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGt < 2:1805548/146‑1 (MQ=255) aaaGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTc > 2:1986331/1‑150 (MQ=255) aaGGTTCTTTGTAAAGAGGGTTTGAACGGAATGTTAAGGTTTTTTAACTCGTTGT‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAATACCCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCt < 1:2435664/150‑1 (MQ=255) ttCTATGTAAAAAGGGTTTGACCCGAATGTTAAGGTTTTGTAAACCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GAATAAAACAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTAt < 2:315227/150‑1 (MQ=255) ttCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCTTTTTCTTCAATTTTGTCTTTAt > 1:100402/1‑150 (MQ=255) tCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCGGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAACACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTAtt < 2:1180270/150‑1 (MQ=255) tCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTGTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCATTTTTGTCTTTAtt > 1:3400785/1‑150 (MQ=255) tCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGACTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTAtt > 1:1501938/1‑150 (MQ=255) tATGTAAAAAGGGTTTGAACTGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAACCGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCt < 1:2033152/150‑1 (MQ=255) aTGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTGTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGGGGTTTCTGGATTTTCTTCAATTTTGGCTTTTTTCtt > 2:2590224/1‑150 (MQ=255) tAAAAAGTGTTTGAACCGAATGCTAAGGTCTTGTAAATCAGTGC‑G‑T‑TCTT‑TT‑GAATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTATTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTg > 1:1812197/1‑150 (MQ=255) tAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCGGAAGACGTTGTGGTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTTGCTTTATTCTTTTg > 2:1600297/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGGTTTGACCCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAGACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGc < 2:40784/150‑1 (MQ=255) aaaaaGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTGAAAAAAAACCGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGc < 1:2901629/150‑1 (MQ=255) aaaaGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCt > 2:611930/1‑150 (MQ=255) aaaGGGTTTGAACCGATTGTTAATGTTTTGTAATTCACTGCTT‑T‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAATACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTCAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCCTTTGCTg < 2:2724784/150‑1 (MQ=255) aaaGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCGGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAATACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTg < 2:3798864/150‑1 (MQ=255) aaGGGTTTGAACCGATTGTTAGGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAATACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGa < 2:3068510/150‑1 (MQ=255) gggTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTGTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGt > 1:2903219/1‑150 (MQ=255) gTTTGAACCGAATGTTGAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAATACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTAc < 1:2716723/150‑1 (MQ=255) tGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTGTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGGGTACctt > 2:3330192/1‑150 (MQ=255) tGAACCGAATGTAAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑G‑T‑T‑TTCTT‑GTATAAAAATCACTCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACctt < 1:4024912/150‑1 (MQ=255) acccGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAATACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACcttct < 1:3066636/148‑1 (MQ=255) ccGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAATAACCCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCttt < 1:2280845/150‑1 (MQ=255) ccGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGATTTTTTTTAGTTATCAGAGGACGGGGTGGTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGGGGACCTTCttt > 2:69264/1‑150 (MQ=255) ccGAAGGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAATACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCttt < 1:3101264/150‑1 (MQ=255) cGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAATCCCCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTg < 2:1106822/150‑1 (MQ=255) cGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCCTGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGACTTTATTCTTTTGGTGAGTACCTTCTTTg > 2:3748048/1‑150 (MQ=255) aaggTTAGGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTc < 2:3200508/147‑1 (MQ=255) aaTGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTATTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTc > 1:2879842/1‑150 (MQ=255) aTGTTAGGGGTTGGTATAACAGTGCGG‑G‑T‑TT‑TG‑GTATAGAAAAAACACCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTGTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTcc < 2:348995/150‑1 (MQ=255) aTGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTTCTGAGTACCTTCTTTGTcc > 1:1417325/1‑150 (MQ=255) tGTTAAGGTTTAGTAAATCAGTGCTT‑T‑T‑TT‑TT‑GAATAAAAAGCACACCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTCCt < 1:1600297/150‑1 (MQ=255) aaGGTTTTGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTCCTGCtt < 1:2185633/150‑1 (MQ=255) gggTTTTGAAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAATATACTCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTCCTGCTTc < 1:1344326/149‑1 (MQ=255) tttGTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTCCTGCTTCGAtt > 1:925542/1‑150 (MQ=255) gTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTCCTGCTTCGGTTTCa > 2:2460763/1‑150 (MQ=255) gTAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTCCTGCTTCGATTTCa > 2:3844917/1‑150 (MQ=255) tAAATCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTCCTGCTTCGATTTCAg < 2:2128515/150‑1 (MQ=255) aaTCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTCCTGCTTCGATTTCAGCt < 2:1746702/150‑1 (MQ=255) aTCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTCCTGCTTCGATTTCAGCTc > 2:1844767/1‑150 (MQ=255) tCAGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCACACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTCCTGCTTCGATTTCAGCTCa < 1:3403762/150‑1 (MQ=255) aGTGC‑GTT‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTCCTGCTTCGATTTCAGCTCaaa > 2:3802376/1‑150 (MQ=255) | GCAGCCATCAGAAGCATAAGCACCAATTTGTTTTTTTTCATTTCCTGAATTCCCCCTGCGTATAATGTGTAATTTGTCCTACACGTATAGAGTAAAGGTTCTATGTAAAAAGGGTTTGAACCGAATGTTAAGGTTTTGTAAATCAGTGC‑G‑T‑T‑TT‑TT‑GTATAAAAAAAACGCCCACATCATGTGAGCGTTTTTTTTTAGTTATCAGAAGACGTTGTGTTTTCTGCATTTTCTTCAATTTTGTCTTTATTCTTTTGCTGAGTACCTTCTTTGTCCTGCTTCGATTTCAGCTCAAA > BS168_reference_genome/2581577‑2581869 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |