| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | pSIJ663_pHT315_araE_xy | = 5551 | 0 (0.000) | 6817 (1.150) | 288/288 | 0.0 | 100% | intergenic (+820/–) | ampR/– | –/– |
| ? | pSIJ663_pHT315_araE_xy | 9889 = | NA (NA) | intergenic (+5158/–) | ampR/– | –/– | |||||
Only 100 of 7327 total aligned reads displayed.
GCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/5398‑5551‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑catgtGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGTGGGCGTCGG > pSIJ663_pHT315_araE_xy/9889‑10037 CTGGTCTCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACAT < 2:2621140/150‑1 CTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGTGCCTATGGAAGAACGCCAGCAACGCGGCCTTGTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTTCTCACAT > 1:716061/1‑150 CTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACAT > 1:1068847/1‑150 TGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTTGCCTTTTGCTCACATG > 1:781296/1‑150 TATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCCCCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGC < 2:3799633/150‑1 TATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGGGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGC < 1:868641/150‑1 TTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCG > 1:2790483/1‑150 TATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGGGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGG > 2:777588/1‑150 TAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGC > 2:2058168/1‑150 cCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAACACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTG < 2:1693758/149‑1 cCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCCCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTG < 2:1857637/149‑1 cCCTGCCGGGTTTCGCCTCCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTG < 2:4027510/149‑1 CCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGG < 2:1088172/150‑1 gtgGGGTTCCGCCACCTCTGCCTTGAGCGCCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCGTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGG < 1:3098234/147‑1 GTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGG > 2:1619737/1‑150 GTCGGGTTTCCCCCCCTCTGACTTGAGCGCCGATTTTTGTGATGCCCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGG < 2:2943947/150‑1 TCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGg > 1:2357255/1‑149 GGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTA > 2:1767346/1‑150 GCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTAT < 2:1468615/150‑1 cccCCTCTGACTTGAGCGCCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATG < 2:505048/147‑1 CTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACTTGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTTTGGCca > 2:2277819/1‑148 CTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATG > 1:1668962/1‑150 GACTGGAGCGTCGATTTTTGTGATGCCCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGAC < 2:2679738/150‑1 ACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACA < 1:1519359/150‑1 CTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGGGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGGATGGCTATGGCAC > 2:1327689/1‑150 TTGTGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGGTTTTTGTATGGCTATGACACG > 1:1270455/1‑150 TGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTGGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGTAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGG < 1:3656746/150‑1 GAGCGTCGATGTTTGTGATGCACGGCAGGGGGGCGGAGCGTATGGAAGAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTCCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGC < 2:1548238/150‑1 AGCGCCGATTTTTGTGATGCCCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCA < 2:1997937/150‑1 TCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGCGGCGGAGCCTATGCAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTTTGGCTATGACCCCGCAGAGA > 1:563985/1‑150 CGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTTTGGCTATGGCACGGCGGGGAT > 1:1451353/1‑150 GATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAACACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATT < 2:924149/150‑1 ATTTTTGTGATGCGCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTT < 2:3681642/150‑1 TGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAACACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGC < 2:3862578/150‑1 TGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGC < 2:2203407/150‑1 GTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGGGATTTCTGGCG > 1:1361689/1‑150 GATCCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGGAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCC < 1:3826175/150‑1 ATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGAATTCTGGCGCCA > 2:1387077/1‑150 cccCGTCGGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTCCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATC < 2:2131341/147‑1 GCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGGGATTTCTGGCGCCATC > 2:3471691/1‑150 CGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAACACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGT < 2:1209087/150‑1 TCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGGCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTT < 1:3897336/150‑1 TCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTAAGACACGGCAGGGATTTCTGGCGCCGTCGGTTT > 2:3136830/1‑150 GGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGAT < 2:557919/150‑1 GAGCCTATGGACAAACGCCAGCACCGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATT < 2:2551022/150‑1 GCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTA < 1:334425/150‑1 GCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTA < 1:2105192/150‑1 GCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCCGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTA > 1:2863322/1‑150 ATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACA > 2:3406347/1‑150 AAAGACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTGCTGAAAGATTTATACAGCCT < 2:2336156/150‑1 AAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCT > 2:66592/1‑150 AAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTG > 1:2946949/1‑150 AAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGA < 1:2712189/150‑1 AACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGGGGTTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAG > 1:3495069/1‑150 AACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGGGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAG > 2:3617896/1‑150 GCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGGCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCC < 2:3542264/150‑1 GCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCC > 2:1018233/1‑150 CAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGTGTCCct > 1:374536/1‑148 CAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTA > 2:3070551/1‑150 CAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGCCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGGGTCCGTTTA > 2:3340162/1‑150 AACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTAT > 1:358834/1‑150 AACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGAGATTTCTGGCGCCATCGCTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGATTAT > 2:2408088/1‑150 GCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTCGGTCCGTCTATGGg > 2:615759/1‑149 GCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCCCCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCGGTGATTTGTGGCGCCCTCGGGCTCCTGCAAGCTTTATACAGCCTGGGGCCGTTTATGGGGGG > 2:2485028/1‑150 CTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTAAGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAGAGATTTATTCGGCCTGAGACCGCTTATGGGGGGtc > 2:3001374/1‑148 TTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACT < 2:192693/150‑1 TTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACT > 1:2035885/1‑150 TTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACT < 1:3192620/150‑1 TTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGGGGGACTT > 2:1264746/1‑150 TTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTG > 2:430440/1‑150 TTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTG < 1:2632923/150‑1 cTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCGTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGT < 1:3005761/149‑1 TTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGT < 1:1002109/150‑1 CGGTTCCTGGCGTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTGTGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCGATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCCTTTATGGAGGGACTTGTCAT > 1:2551884/1‑150 CGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGGTTTCTGAAAGATTTGTACAGCCTGGGTCCGTTTATGGGGGGACTTGTCAT > 2:844425/1‑150 GGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGGCATT > 1:2293658/1‑150 GTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTT < 2:1157911/150‑1 TTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGGAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTC > 2:3207410/1‑150 TCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACAGGTGGGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCA < 2:3272624/150‑1 CTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGGTTTCTGAAAGGTTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGGCATTTCAAG > 1:1859599/1‑150 GCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCAATTCAAGCAT > 2:3735358/1‑150 CCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATT < 1:2219117/150‑1 TTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTAT < 2:2817302/150‑1 TTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATG < 1:1591734/150‑1 CCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGG < 2:3949134/150‑1 CCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGG < 1:1767346/150‑1 CTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTTTACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGA > 1:1942906/1‑150 TTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAG < 1:3417490/150‑1 TTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGT < 1:944037/150‑1 TTTGCCCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGGGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGT < 1:1203077/150‑1 GCTCACATGTGGGGCGGGGCTTGGCGGCTTGTTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGT < 1:4059397/150‑1 GCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGT < 1:326349/150‑1 GCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGAGATTTTTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATATATACAGCCTGAGTCCGGTTATGGAGGGGCTTGTCATTTCAAACATTATGATTGGAGGAGTTGT > 1:245483/1‑150 CTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGTG > 1:1134708/1‑150 CTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGGTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGTG > 1:640336/1‑150 CACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGTGGG > 2:2882003/1‑150 CATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTTTGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGTAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGTGGGCG > 1:485772/1‑150 ATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGTGGGCGT > 2:718836/1‑150 TGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGTGGGCGTC < 1:398841/150‑1 GTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGTGGGCGTCG < 2:2746637/150‑1 GCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/5398‑5551‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑catgtGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGTGGGCGTCGG > pSIJ663_pHT315_araE_xy/9889‑10037 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |