| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BS168_reference_genome | 951580 = | 270 (0.980) | 119 (0.600) +AATATAAAGCTTCATAAACAAACATGGTAGAATTAATAAATC |
81/214 | 1.7 | 41.1% | intergenic (+8/‑2) | rrnD‑5S/asnTA | ribosomal RNA‑5S/tRNA‑Asn |
| ? | BS168_reference_genome | 3173819 = | 207 (0.750) | noncoding (117/118 nt) | rrnB‑5S | ribosomal RNA‑5S | |||||
Only 100 of 390 total aligned reads displayed.
TATAATGTTAAATGTCACTGAAATTGTCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCATTATTGGAGAGCTGTCCGAGTGGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGTCAACTCCGTCTCAAGG > BS168_reference_genome/951431‑951729 | tataATGTTAAATGTCACTGAAATTGTCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCa > 1:238062/1‑150 (MQ=255) ataATGTTAAATGTCACTGAAATTGTCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCAt < 2:1989411/150‑1 (MQ=255) aaTGTTAAATGTCACTGAAATTGTCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTc > 2:3604434/1‑150 (MQ=255) aTGTTAAATGTCACTGAAATTGTCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTcc < 2:1405416/150‑1 (MQ=255) aTGTTAAATGTCACTGAAATTGTCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTcc < 2:238062/150‑1 (MQ=255) aTGTTAAATGTCACTGAAATTGTCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTcc > 1:2603277/1‑150 (MQ=255) cgaagaggtcacacccgttcccataccgaacacggaagttaagctcttcagcgccgatggtagtcgggggtttccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagatttattaattctaccatgtttgtttatgaagctttatattATTcc < 2:1790261‑M1/5‑1 (MQ=255) aaTGTCACTGAAATTGTCTGGTGATGATGCCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTa > 1:3215097/1‑150 (MQ=255) aaTGTCACTGAAATTGTCTGGTAATGACGTCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGTAAGTTATGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGAGAGAGTAGGACATCGCCACGCAGACTTCATTCCGCAGTa > 2:3530522/1‑150 (MQ=18) ggtcacacccgttcccataccgaacacggaagttaagctcttcagcgccgatggtagtcgggggtttccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagatttattaattctaccatgtttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGTa < 1:3517911‑M1/11‑1 (MQ=255) tGTCACTGAAATTGTCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGc < 2:1033715/150‑1 (MQ=255) gTCACTGAAATTGTCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAggt > 1:2343917/1‑148 (MQ=255) aCTGAAATTGTCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAg < 2:4021671/150‑1 (MQ=255) cgttcccataccgaacacggaagttaagctcttcagcgccgatggtagtcgggggtttccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagatttattaattcttccatgtttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGTAGCTCAGTgg < 1:78277‑M1/20‑1 (MQ=255) aaTTGTCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGCCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTa < 2:2529105/150‑1 (MQ=255) ttcccataccgaacacggaagttaagctcttcagcgccgatggtagtcgggcgtttccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagatttattaattctaccatgtttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGGAGCTCAGTGGTa < 1:1118807‑M1/22‑1 (MQ=255) ttGTCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACCCCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTaga < 2:2777204/150‑1 (MQ=255) ttGTCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTaga > 2:691906/1‑150 (MQ=255) tCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCt < 1:2695946/150‑1 (MQ=255) cTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTa < 2:2992351/150‑1 (MQ=255) taccgaacacggaagttaagctcttcagcgccgatggtagtcgggggtttccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagatttattaattctaccatgtttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTa > 1:379614‑M1/123‑150 (MQ=255) tgatgatgaCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCgg > 2:3765820/1‑150 (MQ=255) tgatgaTGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTTGCTCAGTGGTAGAGCTATCgg > 1:886310/1‑150 (MQ=255) tgatgaTGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCgg > 1:3620592/1‑150 (MQ=255) acacggaagttaagctcttcagcgccgatggtagtcgggggtttccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagatttattaattctaccatgcttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGCAGCTCAGTGGTAGGGCTTACGGCt < 2:617556‑M1/34‑1 (MQ=255) atgGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGtt < 1:2764841/150‑1 (MQ=255) cggaagataagctcttcagcgccgatggtagtcgggggtttccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagagttattaattctaccatgtttgattatcaagctttatattATTCCGCAGTAGCTCAGTAGGACAGCTATCCGGTGtt < 2:2678500‑M1/37‑1 (MQ=255) ggaagttaagcccttcagcgccgatggtagtcgggggtttccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagatttattaattctaccatgtttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTa > 2:3397415‑M1/113‑150 (MQ=255) tctaagccttccaccgcggatggtagtcgggggttcccccctgtgagagcagtaccccgccaagcagattttttaattctaccatgtttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGTAACTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAaccc > 1:1892062‑M1/109‑149 (MQ=255) gttctgccctccagcgccgatggtagccgggggtttccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagatttattaattctaccatgtttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCg > 2:886450‑M1/109‑150 (MQ=255) aaGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGa > 2:784241/1‑150 (MQ=255) ttaagctcttcagcgccgatggtagtcgggggtttccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagatttattaattctaccatgtttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGa < 1:1025559‑M1/43‑1 (MQ=255) agagGCCACTCCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTCCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGAt < 2:1876829/150‑1 (MQ=255) aagctcttcagcgccgatggtaggcgggggtttccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagatttattaattctaccatgtttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATc > 2:4043804‑M1/106‑150 (MQ=255) gTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGt < 2:964050/150‑1 (MQ=255) gTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGt > 2:3186738/1‑150 (MQ=255) ctcttcagcgccgatggtagtcgggggtttccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagatttattaattctaccatgtttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGt > 1:4044913‑M1/103‑150 (MQ=255) cacaCCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCg > 2:3338088/1‑150 (MQ=255) cttcagcgccgatggtagtcgggggtttccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagatttattaattctaccatgtttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCg < 2:123391‑M1/50‑1 (MQ=255) acccccGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGt < 1:2052048/147‑1 (MQ=255) cacCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAATAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGGTGTTAACCGATCGGTCGTa > 2:1321116/1‑150 (MQ=255) agcgccgatggaggtcgggggttcccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagttttattaattctaccatgtttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTACCCGATCGGTCGTAgg > 1:3463114‑M1/97‑150 (MQ=255) gTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGGCGTAGGGTc > 1:2881539/1‑150 (MQ=255) 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ggggtttccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagatttattaattctaccatgtttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGACGTAGGTTCGAATCCTACCTGCg < 1:1406697‑M1/71‑1 (MQ=255) gggtttccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagatttattaattctaccatgtttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCgg > 1:3026220‑M1/79‑150 (MQ=255) aGTTAAGCCCTGCAGCGCCGATGGTAGTGGGGGGTTG‑CCCCCTGTGAGAGGAGGACATCGCCAGGCAGACTGCGTTCCGCAGTAGGGCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGGCGTAGGTCCGAATCCTACCTGCGGAGCCa < 2:2196873/150‑1 (MQ=21) tccccctgtgagagtaggacgccgccaagcagatttattaattctaccatgtttgtttatgaagctttatattATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCa > 2:2745498‑M1/74‑150 (MQ=255) ttAAGCCCTTCAGCGCCGATGGTAGCCGGGGGTTC‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCAGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCatt < 1:497152/150‑1 (MQ=255) 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aGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCATTATTGGAGAGCTGTCCGAGTGGTTGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTa > 1:1337992/1‑150 (MQ=255) ggACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCATTATTGGAGAGCTGTCCGAGTGGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAg > 1:157932/1‑150 (MQ=255) aCATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCATTATTGGAGAGCTGTCCGAGGGGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGGAGGc > 2:3983602/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCATTATTGGAGAGCTGTCCGAGTGGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGt > 1:2801163/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCAGCCTTCATTCCGCAGTAGCCCAGTGGTAGAGCAATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCAGCGGAGCCATTATTGGAGAGCTGTCCGAGTGGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGACa < 1:3139233/150‑1 (MQ=25) gCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCATTATTGGAGAGCTGTCCGAGTGGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGTCa > 1:1716889/1‑150 (MQ=255) cAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCAGCGGAGCCATTATTGGAGAGCTGTCCGAGTGGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGTCAACTCCg < 1:759020/150‑1 (MQ=255) aCTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCATTATTGGAGAGCTGTCCGAGTGGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGTCAACTCCGtct < 2:2858768/150‑1 (MQ=255) cTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCATTATTGGAGAGCTGTCCGAGTGGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGTCAACTCCGtctc > 1:3816065/1‑150 (MQ=255) ttCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCATTATTGGAGAGCTGTCCGAGTGGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGTCAACTCCGTCTCa > 1:29378/1‑150 (MQ=255) ttCATTCCCCAGTTGCTCAGTGGTGGGGCTATCGGCTGTTACCCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCATTATTGGAGAGCTGTCCGAGTGGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGTCAACTCCGTCTCa < 2:3480306/150‑1 (MQ=37) cATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCATTATTGGAGAGCTGTCCGAGTGGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGTCAACTCCGTCTCAAg < 2:459269/150‑1 (MQ=255) | TATAATGTTAAATGTCACTGAAATTGTCTGGTGATGATGGCGAAGAGGTCACACCCGTTCCCATGCCGAACACGGAAGTTAAGCTCTTCAGCGCCGATGGTAGTCGGGGGTTT‑CCCCCTGTGAGAGTAGGACATCGCCAGGCAGACTTCATTCCGCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCTATCGGCTGTTAACCGATCGGTCGTAGGTTCGAATCCTACCTGCGGAGCCATTATTGGAGAGCTGTCCGAGTGGTCGAAGGAGCACGATTGGAAATCGTGTAGGCGGTCAACTCCGTCTCAAGG > BS168_reference_genome/951431‑951729 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |