Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC | pSIJ663_pHT315_araE_xy | 2,655 | Δ3 bp | 100% | intergenic (–/‑321) | – / → eryR | –/– |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | pSIJ663_pHT315_araE_xy | = 2654 | 101 (0.000) | 39523 (1.290) | 278/278 | NT | 99.7% | intergenic (–/‑324) | –/eryR | –/– |
? | pSIJ663_pHT315_araE_xy | 2658 = | 101 (0.000) | intergenic (–/‑320) | –/eryR | –/– |
Only 100 of 42080 total aligned reads displayed.
ATAATCAGGGGGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2506‑2654 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAACAT > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2658‑2806 ATAATCAGGGGGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCG > 2:5400546/1‑150 TAATCAGGGGGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGA < 2:2803220/150‑1 ATCAGGGGGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAG < 1:3672695/150‑1 TCAGGGGGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGC < 1:3460411/150‑1 AGGGGGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAA > 1:3355520/1‑150 GGGGGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAA < 2:4239565/150‑1 GGGGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAAC < 2:3003835/150‑1 GAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTA > 1:989274/1‑150 CTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGA < 1:3783593/150‑1 CTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGA > 1:2420431/1‑150 TGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGT > 2:5621012/1‑150 GATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTG > 2:1808598/1‑150 GCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTG > 1:4633819/1‑150 GCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTG < 1:2833162/150‑1 TGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGAT > 1:3040931/1‑150 GGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATA < 2:2702210/150‑1 GATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTG < 2:1411758/150‑1 GATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTG > 1:3881799/1‑150 TACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCA < 2:200537/150‑1 ACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAG > 2:5735722/1‑150 ACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAG < 2:4769802/150‑1 CTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGT < 1:484718/150‑1 ACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTA < 2:792215/150‑1 AGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAAAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAA > 1:2722578/1‑150 GCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAA < 1:1655032/150‑1 GGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATT > 2:1906433/1‑150 GCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTG > 1:3248769/1‑150 CCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGT < 2:5848668/150‑1 CATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTG < 2:2203382/150‑1 ATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGT < 2:4139429/150‑1 TCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTCATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTA > 1:1000088/1‑150 TACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATA > 2:3402391/1‑150 TACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATA > 2:3203204/1‑150 ACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAA < 1:3566833/150‑1 TGTCGTAAAGGATCTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGA < 2:1511882/150‑1 TCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAAT < 2:4660507/150‑1 CGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATT < 2:2106674/150‑1 GTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTG > 1:548836/1‑150 AAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAA > 2:5509791/1‑150 AAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAG > 2:4869368/1‑150 AAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAG < 1:656642/150‑1 AGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGT > 1:1216448/1‑150 GATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTA < 2:3712216/150‑1 TTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAA > 1:4424112/1‑150 TTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAA < 1:764656/150‑1 TTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAAT > 1:314802/1‑150 TGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATT < 1:5374957/150‑1 GCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTA < 2:1607301/150‑1 AGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGAT < 1:5814162/150‑1 GATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATG > 2:4449955/1‑150 ATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGC > 2:3924854/1‑150 ATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGC < 2:4968240/150‑1 TAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCT > 1:570765/1‑150 TAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCT > 2:2512230/1‑150 AAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTA > 1:1321012/1‑150 AAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTA < 1:1434972/150‑1 AAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAA > 1:4524823/1‑150 GTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAA > 2:230507/1‑150 TTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAA > 2:119666/1‑150 TATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAAT < 2:3608117/150‑1 TATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAAT > 1:4943386/1‑150 TATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAAT > 2:1086868/1‑150 ATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGTACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATT > 2:3306837/1‑150 CATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTA > 2:5082690/1‑150 TTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAAT > 1:2083095/1‑150 CAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAA > 1:1540786/1‑150 AGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAG > 2:4550459/1‑150 GATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAA > 1:2205596/1‑150 ATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAG < 2:1305123/150‑1 ATGTGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAG > 2:2901817/1‑150 GAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGG > 1:876014/1‑150 GGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGAT > 2:2404899/1‑150 GTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATT < 2:3498442/150‑1 AGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCG > 1:3987243/1‑150 GCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGT > 1:2938756/1‑150 TTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATG > 1:1867286/1‑150 TGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTG > 1:2524342/1‑150 ACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTA < 1:1106935/150‑1 ACCACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATT < 2:4349504/150‑1 CACGATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCC < 2:2612610/150‑1 ATATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAAT < 1:2312097/150‑1 TATCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATG > 2:5180381/1‑150 TCTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCG < 1:4096764/150‑1 CTAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAGGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGT > 1:1763935/1‑150 TAATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTA > 1:5259084/1‑150 AATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAA > 2:4030789/1‑150 ATATGTTGATCCGCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAAT < 1:1972425/150‑1 ATATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAAT > 1:262989/1‑150 TATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATG < 2:3106793/150‑1 ATGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGT > 2:89226/1‑150 TGTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTA > 1:5051120/1‑150 GTTGATCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAG > 2:683168/1‑150 TCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAA < 1:4316715/150‑1 TCCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAA > 2:1704612/1‑150 CCCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAA > 1:4206955/1‑150 CCCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAAC < 1:5597736/150‑1 CCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGTGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAACA > 2:3822610/1‑150 CCGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAACA > 1:5157933/1‑150 CGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAACAT < 2:5296886/150‑1 CGAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAACAT > 1:4749803/1‑150 ATAATCAGGGGGAACTATTGATGCTGGGGATACTATTTACAGCGGCGCCATCTACTGATGTCGTAAAGGATTTGCAAGATAAAGTTATATCATTGCAGGATCATGAGGTAGCGTTTTTGAACACCACGATATCTAATATGTTGATCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2506‑2654 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAGCAAACTTAAGAGTGTGTTGATAGTGCAGTATCTTAAAATTTTGTGTATAATAGGAATTGAAGTTAAATTAGATGCTAAAAATTTGTAATTAAGAAGGAGGGATTCGTCATGTTGGTATTCCAAATGCGTAATGTAGATAAAACAT > pSIJ663_pHT315_araE_xy/2658‑2806 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |