New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | pSIJ663_pHT315_araE_xy | = 5551 | 18 (0.000) | 38394 (1.300) | 268/268 | NT | 100.0% | intergenic (+820/–) | ampR/– | –/– |
? | pSIJ663_pHT315_araE_xy | 9889 = | NA (NA) | intergenic (+5158/–) | ampR/– | –/– |
Only 100 of 43117 total aligned reads displayed.
GGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTTCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGTTATGACACAAAAAAGCGCAGCTATTTCAGCTGCGCTTTTTTCGAAACAAACGCATTTGACCAAACAAGCAGACAAAAAAGGCGATGG > pSIJ663_pHT315_araE_xy/5402‑5699 | gTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTg < 1:5571335‑M1/150‑2 (MQ=255) aTCTTTATAGTCTTGTCGGGTTTCCCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcg < 2:1150558‑M1/150‑4 (MQ=255) aTCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGGTGGCCTTTTGCTCACATGTggg > 2:1575813‑M1/1‑147 (MQ=255) aTCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcg > 2:2734315‑M1/1‑147 (MQ=255) aTCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcg > 1:4943366‑M1/1‑147 (MQ=255) tCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcgg > 1:5045414‑M1/1‑146 (MQ=255) tttATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcg > 2:4681475‑M1/1‑144 (MQ=255) tataGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggg < 2:3711523‑M1/150‑9 (MQ=255) tataGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggg > 1:2319983‑M1/1‑142 (MQ=255) ataGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcgggg > 1:4538726‑M1/1‑141 (MQ=255) ataGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcgggg < 2:2412713‑M1/150‑10 (MQ=255) ataGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcgggg < 1:1299339‑M1/150‑10 (MQ=255) taGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggc < 1:4125291‑M1/150‑11 (MQ=255) aGTCCTGTCGGGTTTCCCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggct < 1:3918210‑M1/150‑12 (MQ=255) tCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttg < 2:3821720‑M1/150‑14 (MQ=255) cTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggc < 1:2756116‑M1/150‑16 (MQ=255) cTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggc > 2:230582‑M1/1‑135 (MQ=255) gTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcgg > 1:171169‑M1/1‑133 (MQ=255) tCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGACCTTTTGATCACATGTgcggcggggcttggcggc > 1:829168‑M1/1‑132 (MQ=255) cGGGTTTCACCACCTCTGATTTGAGTGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggct < 1:1196202‑M1/150‑20 (MQ=255) tttCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttatt < 2:5429362‑M1/150‑24 (MQ=255) ttCGCCACCTTTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGTGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCTAGCAACGCGACCTTTTTACGATTCCTGGCCTTTTGCTGGGGTTTTGCTCACATGTatagcgggggttggccgtttattg > 1:525309‑M1/1‑126 (MQ=255) ttCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattg > 2:2957880‑M1/1‑126 (MQ=255) gCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcgggttaatgtat > 1:1904591‑M1/1‑123 (MQ=255) gCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtat > 2:4135848‑M1/1‑123 (MQ=255) gCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtat > 2:2515482‑M1/1‑123 (MQ=255) ccACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcgggttattgtatg > 2:1260098‑M1/1‑122 (MQ=255) ccACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatg > 1:1605424‑M1/1‑122 (MQ=255) cACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatgg < 1:2547148‑M1/150‑30 (MQ=255) cACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatgg > 2:1681321‑M1/1‑121 (MQ=255) tctGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctat < 2:2849131‑M1/150‑34 (MQ=255) gACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgac > 1:3487028‑M1/1‑114 (MQ=255) aCTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcgggttattgtatggctatgaca > 1:1809549‑M1/1‑113 (MQ=255) aCTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgaca < 2:1775412‑M1/150‑38 (MQ=255) aCTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgaca < 1:4840676‑M1/150‑38 (MQ=255) aCTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGACCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgaca < 2:4894037‑M1/150‑38 (MQ=255) tGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacgg > 1:40225‑M1/1‑110 (MQ=255) cGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagt > 1:2016230‑M1/1‑106 (MQ=255) cGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagt > 2:893177‑M1/1‑106 (MQ=255) gTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtg < 1:3272849‑M1/150‑46 (MQ=255) tCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtga > 2:4788256‑M1/1‑104 (MQ=255) cGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgat > 2:199312‑M1/1‑103 (MQ=255) cGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgat < 1:1095385‑M1/150‑48 (MQ=255) gATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggctttgcggcttattggatggctatgacacggcagtgatt > 1:4440871‑M1/1‑102 (MQ=255) gATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatt > 1:4331701‑M1/1‑102 (MQ=255) gttgcTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgcc < 1:2965333‑M1/148‑58 (MQ=255) gATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgcc < 1:3171774‑M1/150‑58 (MQ=255) tGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccat < 1:3708440‑M1/150‑60 (MQ=255) cTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCGTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTCGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacgccagtgatttctggcgccatcg > 1:722984‑M1/1‑89 (MQ=255) cGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggt < 2:5007333‑M1/150‑64 (MQ=255) gTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggtt > 2:3937590‑M1/1‑86 (MQ=255) gTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggtt > 2:3602594‑M1/1‑86 (MQ=255) gTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggtt > 2:4565812‑M1/1‑86 (MQ=255) gTCAGGGGGGCAGAGCCTATGGAAACACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggtt < 1:2863611‑M1/150‑65 (MQ=255) tCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttt < 2:435005‑M1/150‑66 (MQ=255) tCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttt < 1:938949‑M1/150‑66 (MQ=255) ggggggCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttct < 2:5649890‑M1/150‑69 (MQ=255) ggggggCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttct < 1:3816922‑M1/150‑69 (MQ=255) gggCGGAGCCTATGGAAACACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaa < 2:3065779‑M1/150‑72 (MQ=255) gggCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaa < 1:5143658‑M1/150‑72 (MQ=255) gAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatt < 2:5105614‑M1/150‑77 (MQ=255) ccTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttat < 2:3491418‑M1/150‑80 (MQ=255) tATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatac < 1:61663‑M1/150‑82 (MQ=255) aTGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttataca > 1:1401603‑M1/1‑68 (MQ=255) aTGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttataca > 2:20976‑M1/1‑68 (MQ=255) aaaaCGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagtctg > 1:4634629‑M1/1‑63 (MQ=255) aaaaCGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctg > 2:792416‑M1/1‑63 (MQ=255) aGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtt > 1:2653510‑M1/1‑55 (MQ=255) gCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgttt < 1:5683691‑M1/150‑97 (MQ=255) aaCGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttat < 2:587209‑M1/150‑99 (MQ=255) aCGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatg > 2:2621595‑M1/1‑51 (MQ=255) gcgGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtggtttctggcgccatcgggtttctgaaagatttatacagcctgagtccggttatggt > 1:360016‑M1/1‑49 (MQ=255) gcgGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatgga > 2:1361298‑M1/1‑49 (MQ=255) ggCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTATGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagagatttctggcgccatcggttttctggaaggtttatacaggctaagtccgtttatggagg > 2:1466833‑M1/1‑47 (MQ=255) gCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggaggg < 1:4232718‑M1/150‑105 (MQ=255) ttttACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagccttagtccgtttttggagggactt > 1:5781658‑M1/1‑42 (MQ=255) tACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtc > 1:3073691‑M1/1‑39 (MQ=255) aCGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtca < 2:4457852‑M1/150‑113 (MQ=255) gTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACNTGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcattt < 1:1499465‑M1/150‑116 (MQ=255) tCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTgcggcggggcttgacggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttca > 2:3387103‑M1/1‑33 (MQ=255) gccttttgctggccttttgctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcat > 1:2220746‑M1/1‑28 (MQ=255) cttttgctggccttttgctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcatta > 1:5353175‑M1/1‑26 (MQ=255) cttttgctggccttttgctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcatta > 2:5745728‑M1/1‑26 (MQ=255) tgctggccttttgctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgat < 2:5322245‑M1/150‑129 (MQ=255) gctggccttttgctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgatt < 2:5535763‑M1/150‑130 (MQ=255) ggccttttgctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgattgga > 2:4240420‑M1/1‑18 (MQ=255) gccttttgctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgattggag < 1:4735257‑M1/150‑134 (MQ=255) ccttttgctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgattggagg < 1:3378729‑M1/150‑135 (MQ=255) ccttttgctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgattggagg < 2:2203364‑M1/150‑135 (MQ=255) ccttttgctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgattggagg < 2:1885848‑M1/150‑135 (MQ=255) ttttgctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatactgcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgattggaggag > 1:1000146‑M1/1‑14 (MQ=255) ttgctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgattggaggagtt > 2:3273771‑M1/1‑12 (MQ=255) ttgctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgattggaggagtt < 2:687266‑M1/150‑139 (MQ=255) tgctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggggggacttgtcatttcaagcattatgattggtggagttg > 2:5215888‑M1/1‑11 (MQ=255) gctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgattggaggagttgt > 1:2114535‑M1/1‑10 (MQ=255) ctCACATGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgattggaggagttgtg > 2:4036660‑M1/1‑9 (MQ=255) acaTGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgattggaggagttgtgggc < 1:5459836‑M1/150‑145 (MQ=255) caTGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgattggaggagttgtgggcg < 1:2439542‑M1/150‑146 (MQ=255) caTGTgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgattggaggagttgtgggcg > 2:318083‑M1/1‑5 (MQ=255) gtgcggcggggcttggcggcttattgtatggctatgacacggcagtgatttctggcgccatcggttttctgaaagatttatacagcctgagtccgtttatggagggacttgtcatttcaagcattatgattggaggagttgtgggcgtcg < 2:1045871‑M1/150‑149 (MQ=255) | GGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTTCTTTCCTGCGTTATCCCCTGATTCTGTGGATAACCGTATTACCGCCTTTGAGTGAGCTGTTATGACACAAAAAAGCGCAGCTATTTCAGCTGCGCTTTTTTCGAAACAAACGCATTTGACCAAACAAGCAGACAAAAAAGGCGATGG > pSIJ663_pHT315_araE_xy/5402‑5699 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |