Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP006881 | 3,723,095 | T→A | intergenic (‑209/‑92) | U712_19190 ← / → U712_19195 | PTS system sucrose‑specific EIIBC component/putative transporter ywcJ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP006881 | 3,723,095 | 0 | T | A | 99.2% | 861.7 / ‑5.8 | 236 | intergenic (‑209/‑92) | U712_19190/U712_19195 | PTS system sucrose‑specific EIIBC component/putative transporter ywcJ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base A (118/116); total (119/117) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
TCCTTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTGAGAATACGCTTTCATCATAAATTATGATAGCGTTTTCGTCAACT‑G‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATAAAACTTTTAGACAAAAATTCGTAAAAACTATTTGTGAAAAACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAACCATCAAAGAAAGCAGGAAAAAACAATGGAAACTCAAGCATTGCAAAAAGTTGAACAGTACGCTTTGAACAAACTA > CP006881/3722954‑3723237 | tCCTTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACT‑A‑TCTTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGAc > 1:1166899/1‑150 (MQ=255) cTTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACATTCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACaa < 2:2841681/150‑1 (MQ=255) cTTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACaa < 2:3229390/150‑1 (MQ=255) cTTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACaa < 1:1364524/150‑1 (MQ=255) tttttCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACaaa > 2:1878883/1‑150 (MQ=255) ttttCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACaaaa > 1:1040787/1‑150 (MQ=255) ttttCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACaaaa > 1:3096817/1‑150 (MQ=255) tttCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACaaaaa > 2:2262846/1‑150 (MQ=255) tttCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACACTTTCATCATAAATCATGCTAGCGTTTTCGTCAACT‑A‑TATTTTTAGTTACATAGTATGATATAACAAGTAGACaaaat > 1:2412212/1‑149 (MQ=255) tttCATTTACGCAAATTTTAGGTCTCGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACaaaaa > 1:1637285/1‑150 (MQ=255) cATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTc > 1:262973/1‑150 (MQ=255) cATTAACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTc < 1:3195297/150‑1 (MQ=255) aTTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCg > 2:3723335/1‑150 (MQ=255) ttACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACACTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTa > 2:718581/1‑150 (MQ=255) aaTTTTAGGTCTGGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACTTGTAGACAAAAATTCGTAAGAATTa > 2:1568254/1‑150 (MQ=255) ttttAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTaat < 2:613411/150‑3 (MQ=255) ttttAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGACAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTaat < 2:2159430/150‑3 (MQ=255) tttggTCTTGCGTGCTTTTCCAGACACAATCGCGCTTATTCAGATTAAGAAAACGCTTTCATCATTAATCATGATAGCGTTTTCGACAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATtg < 1:3641736/147‑1 (MQ=255) aGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGAGTAAGAATACGCTTTCAACATAAATCATGATAGCGTTTACGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATtgtg < 1:211888/150‑1 (MQ=255) ggTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGa > 2:1716541/1‑150 (MQ=255) cTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGaaat < 1:1581625/150‑2 (MQ=255) tGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAGTCATGATAGGGTTTTCGTGAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAGAATTAATTGTGAAATAc > 1:186455/1‑150 (MQ=255) tGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATAc < 1:3270625/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACt < 1:1966189/150‑1 (MQ=255) cTGCTTTCCCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTc < 1:2735772/150‑1 (MQ=255) gCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTcac < 2:1790345/150‑1 (MQ=255) gCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTcac > 1:611711/1‑150 (MQ=255) gCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTACGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAGCATTCGTAACAATTAATTGTGAAATACTTcac > 2:5546/1‑150 (MQ=255) tttACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACaa < 2:3112735/150‑1 (MQ=255) ttACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACaac > 1:2870987/1‑149 (MQ=255) ttACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAat < 2:3812899/150‑1 (MQ=255) aCCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAatat > 1:2136440/1‑150 (MQ=255) aCCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAatat > 2:773073/1‑150 (MQ=255) tCACAATCCCGCTTATTCAGATTTAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAAGTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGc < 1:223456/150‑1 (MQ=255) tCACAATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGc < 1:2494862/150‑1 (MQ=255) cacaATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCt > 2:2635265/1‑150 (MQ=255) acaATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCta > 1:3538811/1‑150 (MQ=255) acaATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCta < 2:1927124/150‑1 (MQ=255) caATCCCGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCtat < 2:1600412/150‑1 (MQ=255) cccGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTa > 1:2329418/1‑150 (MQ=255) ccGCTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTATGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTaa > 1:2293615/1‑149 (MQ=255) cTTATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCt < 1:1100809/150‑1 (MQ=255) ttATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTc < 2:2462026/150‑1 (MQ=255) ttATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTc > 2:2882551/1‑150 (MQ=255) tATTCAGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCa < 2:2797004/150‑1 (MQ=255) aGATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCAt > 1:113493/1‑150 (MQ=255) gATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCAtg > 2:2281962/1‑149 (MQ=255) gATTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCAtg > 2:1107224/1‑149 (MQ=255) aTTAAGAATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCAtga > 2:808246/1‑148 (MQ=255) gaATACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATTATGaaagaa < 2:905332/150‑1 (MQ=255) aTACGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGaaagaaag < 2:2018985/150‑1 (MQ=255) aCGCTTTCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCa > 2:3746554/1‑150 (MQ=255) aCGCTTACTTCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCATCTAT‑T‑TTTTTAGTTGAATTGTTTGATATAACATGTTGACTATAATTCGTAAAAATTAATTGTGTAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCa < 2:1137380/150‑1 (MQ=255) tttCATCATAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGGAAGAAAGCAGGaa > 2:3276800/1‑150 (MQ=255) gtcatcaTAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGaaa > 2:1370430/2‑150 (MQ=255) tcatcaTAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGaaaa > 2:1047003/1‑150 (MQ=255) catAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGGAAAGACa > 2:3973234/1‑150 (MQ=255) atAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACaa > 2:1685767/1‑150 (MQ=255) tacatcaTGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACCATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAAt < 2:1321380/144‑1 (MQ=255) tAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAAt > 1:1005478/1‑150 (MQ=255) tAAATCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAAt > 1:1223817/1‑150 (MQ=255) aaaTCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATg < 1:3665251/150‑1 (MQ=255) aaaTCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATg > 1:501098/1‑150 (MQ=255) aaTCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATgg < 2:2329418/150‑1 (MQ=255) aaTCATGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATgg < 1:3401359/150‑1 (MQ=255) caTGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAAGTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAAAGGaaa > 2:3046092/2‑150 (MQ=255) aTGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAAc < 2:2625919/150‑1 (MQ=255) tGATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACt > 2:3865688/1‑150 (MQ=255) gATAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAAGGGAAACTc > 2:3381852/1‑150 (MQ=255) tAGCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCaa > 1:1445169/1‑150 (MQ=255) gtgTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGc < 2:1485496/148‑1 (MQ=255) gCGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGGAACTCAAGc > 1:1330267/1‑150 (MQ=255) cGTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTCTGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCa > 2:3906030/1‑150 (MQ=255) gTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAGACTCAAGCAt > 1:20688/1‑150 (MQ=255) gTTTTCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCAt < 1:61748/150‑1 (MQ=255) ttttCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGGCAATGGAAACTCAAGCAtt > 2:523989/1‑150 (MQ=255) ttttCGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCAtt < 2:2748535/150‑1 (MQ=255) cGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACaa < 1:3390016/150‑1 (MQ=255) cGTCAACTAT‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACaa < 1:3944090/150‑1 (MQ=255) gTCAACT‑ATT‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATACCTTGTAGACAAAATTTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTTACAATATCGTGCTATACTATGCACAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACaaa < 1:192089/150‑1 (MQ=255) gTCAACT‑ATT‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAGTTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGCAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACaaa > 2:3679015/1‑150 (MQ=255) ctatt‑tttttAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGtt > 2:46367/5‑150 (MQ=255) tatt‑tttttAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTg < 1:2621560/147‑1 (MQ=255) tattgttttAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTCCAAAAGGTTg < 2:357234/145‑1 (MQ=255) att‑tttttAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGa < 2:2136437/148‑1 (MQ=255) tt‑tttttAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGaa < 1:1547864/149‑1 (MQ=255) atttgtttGGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGa < 1:1872146/145‑1 (MQ=255) t‑tttttAGTTAAATAGTTTGATTTGACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAAc < 1:717874/150‑1 (MQ=255) t‑tttttAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAAc > 2:3514433/1‑150 (MQ=255) tttttAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAGTTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACa < 1:3466157/150‑1 (MQ=255) tttttAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAGAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACa > 2:3579021/1‑150 (MQ=255) ttttAGTTAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAg > 1:333587/1‑150 (MQ=255) aGTTAAATAGTTTGATATACCATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTCATTGAGAAATCCTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACACAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTatg < 2:2412212/150‑3 (MQ=255) ttAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCt < 1:3723335/150‑1 (MQ=255) ttAAATAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCt > 1:2121823/1‑150 (MQ=255) aTAGTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAACTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCTTTGa < 1:427668/150‑1 (MQ=255) gTTTGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCTTTGaaaa > 1:2931707/1‑148 (MQ=255) tttGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCTTTGAaaaa < 2:1223817/150‑1 (MQ=255) tGATATAACATGTAGACAAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCTTTGAAAAAAc < 1:1957874/150‑1 (MQ=255) atatAACATGTAGACCAAAATTCGTAAAAATTAATTGTGAAATACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCCCAATCATGAAAGAAAGCAGGAAAAGACAATGGAAACTCAAGCATTACAAAAGGTTGAACAGTATGCTTTGAAAAAAcaa < 2:84892/150‑3 (MQ=255) | TCCTTTTTCATTTACGCAAATTTTAGGTCTTGCCTGCTTTACCAGTCACAATCCCGCTTATTCAGATTGAGAATACGCTTTCATCATAAATTATGATAGCGTTTTCGTCAACT‑G‑T‑TTTTTAGTTAAATAGTTTGATAAAACTTTTAGACAAAAATTCGTAAAAACTATTTGTGAAAAACTTCACAATATCGTGCTATACTATGCTCAACCATCAAAGAAAGCAGGAAAAAACAATGGAAACTCAAGCATTGCAAAAAGTTGAACAGTACGCTTTGAACAAACTA > CP006881/3722954‑3723237 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |