| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP006881 | 52,751 | G→T | 20.1% | intergenic (+199/‑12) | U712_00220 → / → U712_00225 | Sporulation‑specific protease yabG/Protein veg |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | CP006881 | 52,751 | 0 | G | T | 20.1% | 1361.8 / inf | 498 | intergenic (+199/‑12) | U712_00220/U712_00225 | Sporulation‑specific protease yabG/Protein veg |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (225/172); new base T (53/47); total (279/219) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.39e-01 | |||||||||||
Only 100 of 506 total aligned reads displayed.
ATGATACATAATTTACCGAAACTTGCGGAACATAATTGAGGAATCATAGAATTTTGTCAAAATAATTTTATTGACAACGTCTTATTAACGTTGATATAATTTAAATTTTATTTGACAAAAATGGGCTCGTGTTGTACAATAAATGTAGTGAGGTGGATGCAATGGCGAAGACGTTGTCCGATATTAAAAGATCGCTTGATGGGAATTTAGGTAAAAGGCTGACGTTAAAAGCAAACGGTGGCCGCCGAAAAACGATTGAGCGTTCGGGCATTTTAGCTGAGACGTACCCTTCTGTTTTT > CP006881/52602‑52900 | aTGATACATAATTTACCGAAACTTGCGGAACATAATTGAGGAATCATAGAATTTTGTCAAAATAATTTTATTGACAACGTCTTATTAACGTTGATATAATTTAAATTTTATTTGACAAAAATGGGCTCGTGTTGTACAATAAATGTAGTg < 1:4984454/150‑1 (MQ=255) aTACATAATTTACCGAAACTTGCGGAACATAATTGAGGAATCATAGAATTTTGTCAAAATAATTTTATTGACAACGTCTTATTAACGTTGATATAATTTAAATTTTATTTGACAAAAATGGGCTCGTGTTGTACAATAAATGTAGTGAgg > 1:4374518/1‑150 (MQ=255) aTACATAATTTACCGAAACTTGCGGAACATAATTGAGGAATCATAGAATTTTGTCAAAATAATTTTATTGACAACGTCTTATTAACGTTGATATAATTTAAATTTTATTTGACAAAAATGGGCTCGTGTTGTACAATAAATGTAGTGAgg < 1:2162797/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |