| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 660,041 | C→A | 8.7% | intergenic (+9/‑150) | U712_03220 → / → U712_03225 | Uncharacterized protein yebC/Uncharacterized protein yebD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 660,041 | 0 | C | A | 8.7% | 1105.6 / 27.4 | 365 | intergenic (+9/‑150) | U712_03220/U712_03225 | Uncharacterized protein yebC/Uncharacterized protein yebD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (133/182); new base A (44/2); total (181/184) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.71e-13 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 372 total aligned reads displayed.
CGTGTGTACCAGGCGGCACAAGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCAAAAACCTTTATGTTTAAGGAGGATGATGGAC > CP006881/659892‑660190 | gtgtgtACCAGGCGGCACAAGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAAcc > 2:3499860/1‑150 (MQ=255) gtACCAGGCGGCACAAGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCt < 2:342022/150‑1 (MQ=255) tACCAGGCGGCACAAGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTa < 2:5576641/150‑1 (MQ=255) ccACGCGGCACAAGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTTCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTGGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAAACGGCTAAt > 1:2326866/1‑150 (MQ=255) aGGCGGCACAAGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATcc < 1:1009494/150‑1 (MQ=255) ggcggcACAAGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGGTTCCGCTTTAATGAAAAAACCAGCTAATCCt > 2:4794110/1‑150 (MQ=255) cggcACAAGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAAGCGGCTAATCCTaa > 1:5575094/1‑149 (MQ=255) cggcACAAGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAg > 2:1489199/1‑150 (MQ=255) gcACAAGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGcc > 1:2454732/1‑150 (MQ=255) acaAGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGACTAATCCTaaacgg > 1:4053869/1‑145 (MQ=255) aaGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGtt < 2:5380831/150‑1 (MQ=255) aaGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGtt > 1:3377598/1‑150 (MQ=255) aGATGCTCCAATTGATTATATCTCTTGTGTATTTGCAGTAGTTGGGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAACCCGGCTAATCCTAGCCGGttt < 2:2812456/150‑1 (MQ=255) aGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGttt < 2:3868555/150‑1 (MQ=255) aGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGttt > 2:2443432/1‑150 (MQ=255) gATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGtttt < 2:1566232/150‑1 (MQ=255) tGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGtttttt > 2:1742711/1‑150 (MQ=255) gcagcaATTGATTATATCTATTGGGTATTTGCGGTAGTTCCGATAGGACTGCTGGTTACGGCAGTGACTGGGCCGTTTATTTCTGAATAGATTACGGCGTGGTTGATTCCGCTTTAATGAAGGAAAGAGCTAATCCTGGCCGAatttttt > 1:3219832/1‑150 (MQ=255) gCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGttttttt < 2:450533/150‑1 (MQ=255) cACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTa < 1:998025/150‑1 (MQ=255) aCCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTAt > 2:5227777/1‑150 (MQ=255) aaTTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAAGCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTc > 1:4757759/1‑150 (MQ=255) aaTTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAAACGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTc > 1:4472465/1‑150 (MQ=255) aTTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTca > 1:3111925/1‑150 (MQ=255) aTTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTCTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGGTTTAATGAAAAAAACGTCTAATACTAGCCAGTTTTTTTATGTca > 1:3843269/1‑150 (MQ=255) atatCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACtttt < 2:150357/150‑1 (MQ=255) tatCTATTTTGTATTTGTAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGTCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTACGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACttttt < 1:1879134/150‑1 (MQ=255) atCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTa > 2:685698/1‑150 (MQ=255) cTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTNTTATGTCACACTTTTTACa > 2:5825143/1‑150 (MQ=255) tATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACaa < 1:1489199/150‑1 (MQ=255) tgtATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAatata > 2:2365946/1‑150 (MQ=255) gtATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAatatat < 2:4294509/150‑1 (MQ=255) aTTTGCAGTAGTTGTGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCTGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTACGCTTTAATGAAAAAACAGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCt < 1:755660/150‑1 (MQ=255) aTTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCt < 2:2523417/150‑1 (MQ=255) aTTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCt < 2:3297368/150‑1 (MQ=255) tttGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTa < 1:2753556/150‑1 (MQ=255) gCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTGGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAAACGGCTAATCATAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTaaaa > 1:2562778/1‑150 (MQ=255) cAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTaaaaa > 2:3731689/1‑150 (MQ=255) agtTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACAt > 1:5765109/1‑150 (MQ=255) agtTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACAt > 2:5564042/1‑150 (MQ=255) agtTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACAt > 2:187166/1‑150 (MQ=255) agtTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACAt > 2:3450572/1‑150 (MQ=255) agtTCCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTAACTTGGCCGTTTATTTCTAAATATATTATGGCGACGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGTTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACAt < 1:1609980/150‑1 (MQ=255) gtTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATa > 2:2070999/1‑150 (MQ=255) gtTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAAACGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACAtt > 1:3675390/1‑149 (MQ=255) tGCGATATCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCTGTTTATTTCTTAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAGCCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACATTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGt < 1:2402243/150‑1 (MQ=255) tGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGt < 2:1369917/150‑1 (MQ=255) gCGATAGCGCAGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTTGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGtt < 2:2978541/150‑1 (MQ=255) cGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTg < 2:2274337/150‑1 (MQ=255) cGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTg < 2:4468208/150‑1 (MQ=255) cGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTg > 2:2896552/1‑150 (MQ=255) gATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGGTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGa > 2:1660308/1‑150 (MQ=255) gATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAAACGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAACAAACATAGTTGa > 1:3632207/1‑150 (MQ=255) tAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGAtt > 1:3940680/1‑150 (MQ=255) aGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGTAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGAttt > 1:3416780/1‑150 (MQ=255) gcgcTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTg < 1:4706035/150‑1 (MQ=255) cgcTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGt < 2:4695417/150‑1 (MQ=255) tgTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGACTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGTAtt > 1:1747479/1‑150 (MQ=255) tttACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTaa < 2:409629/150‑1 (MQ=255) ttACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGTTTTTTTTATGTCATACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAAc < 1:2131785/150‑1 (MQ=255) aCGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAAccc < 2:5151873/150‑1 (MQ=255) ggCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCgt < 1:12093/150‑1 (MQ=255) ggCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCgt > 2:1184762/1‑150 (MQ=255) cAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCgtgt > 2:2396172/1‑150 (MQ=255) tGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTatg < 2:3211148/150‑1 (MQ=255) aCTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAAACGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTatgat > 1:1420335/1‑150 (MQ=255) tGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGTTTCCGCTTTAATGAAAAAAACGGCTAATCCTTGCCGGCTTTTTTATGTTACACTTTTTACAAATATATTTAAAAAACATAATTGATTTGTAGGATTAATCCGTGTATCATggg > 1:4290716/1‑150 (MQ=255) tGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAAACGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATAAATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATggg > 1:5393474/1‑150 (MQ=255) ggCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATgggg > 2:3562283/1‑150 (MQ=255) ggCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATgggg > 2:724100/1‑150 (MQ=255) ccGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGaa > 2:5490793/1‑150 (MQ=255) ccGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGaa > 2:3636524/1‑150 (MQ=255) ttATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATg > 2:4400721/1‑150 (MQ=255) aTTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCt > 2:5771141/1‑150 (MQ=255) aTTTCTGAATATATTACGGCGTCGATGATTGCGCTTTAATGAAAAAAACGGCTAATGCTAGCCGGGTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATGTAAAAAAAATAATTGATTTGTAGGATTAACCCGTGGATGATGTGGAAAATGCt > 1:2524723/1‑150 (MQ=255) ttGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGNNGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGaaa < 1:789280/149‑1 (MQ=255) cTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGaaa < 1:5200895/150‑1 (MQ=255) atatatTACGGCGTAATTGATTCCGCTTTAATGAAAAAAACGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATTTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAAcat > 1:583521/1‑148 (MQ=255) tatatTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTc < 2:497331/150‑1 (MQ=255) atatTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTcc < 2:5707523/150‑1 (MQ=255) atatTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAAACGGCTAATCCTAACCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTTATTTGTAGGATTAACCCGTGTATCATGGGGAAAATGCTGAAAACGtgc > 1:2200876/1‑148 (MQ=255) ttACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAgc < 1:1100834/150‑1 (MQ=255) cgtcgtTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCaaaa < 2:1424816/150‑1 (MQ=255) cgtcgtTGATTCCCCTTTAATGAAAAAACCGCCTAATCCTAGCGGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCaaaa < 1:492813/150‑1 (MQ=255) tcgtTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAGTGCTGAAAACGTCCAGCGCaaaagc > 1:2801464/1‑148 (MQ=255) cgtTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGGTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGTGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCAAAAAcc > 1:684580/1‑150 (MQ=255) tGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCAAAAACCttt > 2:382080/1‑150 (MQ=255) aTTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCAAAAACCTTTAt < 1:5636321/150‑1 (MQ=255) aTTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCAAAAACCTTTAt < 1:4349510/150‑1 (MQ=255) ttCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCAAAAACCTTTATg < 2:1045554/150‑1 (MQ=255) ttCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTATTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAATTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAANACTGAAAACGTCCAGCACAAAAACTTTTATg > 1:1385345/1‑150 (MQ=255) ccGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACACGTGTATGATGGGGAAAATGATGAAAACGTGCAGCGCAAAAACCATTATGtt > 1:3993758/1‑150 (MQ=255) cGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCAAAAACCTTTATGttt > 2:1600323/1‑150 (MQ=255) gCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCAAAAACCTTTATGTTTa > 1:2888523/1‑150 (MQ=255) tttAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCAAAAACCTTTATGTTTAag > 1:2055229/1‑150 (MQ=255) ttAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCAAAAACCTTTATGTTTAagg < 2:4061682/150‑1 (MQ=255) gAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCAAAAACCTTTATGTTTAAGGAGgat > 2:4152356/1‑150 (MQ=255) aaaCCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGAAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCAAAAACCTTTAAGTTTAAGAAGGatgatg > 2:4598751/1‑150 (MQ=255) atccGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTAGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCAAAAACCTTTATGTTTAAGGAGGATGATgg < 1:3277775/148‑1 (MQ=255) aCCGGCTAATCCTAGCCGGGTTTATTATGTCACAGTTTTTACTAATATATCTAAAAAACATAGTTGTGTTGTAGAATTAACCCGTGTATGATAGGAAAAATGCTGAAAACGTGCAGCGCAAAAACCTTTATGTTTAAGAGGGATGATggg > 2:782129/1‑149 (MQ=255) | CGTGTGTACCAGGCGGCACAAGATGCACCAATTGATTATATCTATTGTGTATTTGCAGTAGTTGCGATAGCGCTGCTGTTTACGGCAGTGACTTGGCCGTTTATTTCTGAATATATTACGGCGTCGTTGATTCCGCTTTAATGAAAAAACCGGCTAATCCTAGCCGGTTTTTTTATGTCACACTTTTTACAAATATATCTAAAAAACATAGTTGATTTGTAGGATTAACCCGTGTATGATGGGGAAAATGCTGAAAACGTCCAGCGCAAAAACCTTTATGTTTAAGGAGGATGATGGAC > CP006881/659892‑660190 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |