| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | pSIJ663_pHT315_araE_xy | = 5551 | 15 (0.000) | 13891 (1.530) | 288/288 | 0.0 | 99.9% | intergenic (+820/–) | ampR/– | –/– |
| ? | pSIJ663_pHT315_araE_xy | 9889 = | NA (NA) | intergenic (+5158/–) | ampR/– | –/– | |||||
Only 100 of 14862 total aligned reads displayed.
GCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/5398‑5551‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑catgtGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGTGGGCGTCGG > pSIJ663_pHT315_araE_xy/9889‑10037 cCCTGGTTTCTTTGTAGTCCTGTCGGGTCTCGCCACCTCTCACTTGAGCGTCCATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCAGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCAC < 1:473223/149‑1GCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCCCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTGAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCAC < 2:3445444/150‑1 CTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACAT > 2:628008/1‑150 cCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCCCCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGG < 2:578673/149‑1 CTTTATAGTCCTGTCGGGTTCCGCCCCCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGC < 1:1302661/150‑1 ATAGTCCTGCCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGG < 2:3305238/150‑1 GTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTT > 2:2420925/1‑150 cCCTGTCGGGTTCCGCCACCCCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCCTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTG < 2:691325/149‑1 CTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGGGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGC < 2:2905939/150‑1 CTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGGCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCGGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGGGCGGCGGGGCTTGGC > 1:1000187/1‑150 TGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAAAGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGGGGGGGGGCTTGGCG > 1:3666210/1‑150 CGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAATCGCCAGAAGTGAGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGGGCGGCGGGGCGTGGCGGCT > 1:3171447/1‑150 GGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGGTT > 2:323185/1‑150 GGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGTGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTCTTGCTCACATGTGCGGCGGCGCTGTGCGGCTTA > 2:2167779/1‑150 GGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTA > 2:2286431/1‑150 CGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACCTGTGCGGCGGGGGTTGGCGGGTTAGTGTA > 1:2537101/1‑150 GCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTAT < 2:1172009/150‑1 CTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCCGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTAGGGCca > 2:2347727/1‑148 TGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGGGCCTATGGTAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGA > 2:1234024/1‑150 GACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGAC < 1:2101788/150‑1 CTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGGTTATTGTATGGCTATGACAC > 2:2626670/1‑150 CTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACAC < 2:393012/150‑1 TTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGGCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACG < 2:3796844/150‑1 tggGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGG < 1:766260/147‑1 TGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGGAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTCTTGCTCACATGTGGGGCGGGGCTTGGCGGCTTAATGTTAGGCTATGACACcg > 1:3902686/1‑148 TGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGGATGGCTATGACACGG > 2:1491547/1‑150 TGAGCGACGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAATACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGG < 1:550636/150‑1 GCGTCGATTTTTGTGATCCCCGCCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAATACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAG < 2:761139/150‑1 CGTCGTTTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGT < 1:3591054/150‑1 GTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGGATGGCTATGACCCGGCGGTG > 1:2694101/1‑150 TCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTGTTTGTGTGGCTATGACACGGCAGGGA > 1:3741375/1‑150 TCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTGTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGGTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGggg > 1:1689307/1‑147 CGATTTTTGTGGTGCTCGCCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGAT < 2:1355361/150‑1 CGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCCGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGGATGGCTATGACACGGCAGTGgt > 1:351966/1‑148 GATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGGGATa > 2:1292754/1‑149 TTTTGGTGAGGCTCGTCGGGGGGCCGGAGCCTTTGGAAAAACGCCAGCACCGCGGCCTTCTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTCTGACACGGCAGTGATTTC < 1:2928836/150‑1 TTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCT > 2:2831046/1‑150 GTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGCAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCG > 2:1967839/1‑150 GTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGGATGGCTATGACACGGCAGGGGTTTCTGGgg > 1:3347563/1‑148 TGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGGCCCGGCAGTGGTTTCTGGCGC > 1:621668/1‑150 TGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGC < 2:337492/150‑1 TGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGAGATTTCTGGCGC > 2:827150/1‑150 gtTGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAACACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCC < 2:1835674/148‑1 TGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACCGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGGGATTTCTGGCGCCAT > 1:845933/1‑150 gcccgcCAGGGGGGCGGAGCCATTGGAAAGACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATC < 2:47507/144‑1 CTCGGCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCG < 2:411915/150‑1 gGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGT < 1:1598749/149‑1 TCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCACCGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTT < 2:2557494/150‑1 AGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTCTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGGCACGGCAGTGATGTCTGACGGCATGGGTTTTC > 2:3860680/1‑150 GGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGGCACGGCAGGGGTTTCTGGCGCCATCGGGTTTCTGg > 2:2490013/1‑149 GGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTCCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAA < 2:3581680/150‑1 GGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAA < 2:3041055/150‑1 GCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGGATGGCTATGGCACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGGTTTCTGAAAG > 1:3822189/1‑150 CGGAGCCAATGGAAAAACGCCAGCCACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTCTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGA < 1:1077250/150‑1 GGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGgt > 2:29718/1‑148 GAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATT > 1:1444001/1‑150 AGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGGTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGGTTTCTGAAAGAGTT > 1:3090206/1‑150 TATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGGTTGATAC > 1:3432950/1‑150 TATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATAC < 2:1560482/150‑1 ATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACA < 1:2270926/150‑1 TGGAAAGACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAG < 1:138090/150‑1 TGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTACGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGGTTTCTGAAAGATTTATACAG > 2:2027002/1‑150 GGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGC < 2:1427398/150‑1 GGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTATGATCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGGTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGC > 1:2192455/1‑150 AAAGACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCT < 2:1896787/150‑1 AACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAG < 2:522498/150‑1 ACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGT > 2:1760513/1‑150 CGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTC < 2:1628838/150‑1 CCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTACACAGCCTGAGTCCG > 2:2695656/1‑150 CCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGGTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCG > 1:3014038/1‑150 CAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGT < 1:1933475/150‑1 CAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTA < 1:1154298/150‑1 GCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACGTGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGA < 1:2765103/150‑1 CGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGGTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGgg > 1:1528768/1‑148 GCCTTTTTCCGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGG < 1:694597/150‑1 CCTTTTTCCGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGA < 2:3648611/150‑1 CCTTTTTACGGTTCCTGGCCCTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATTCAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGA < 1:2442570/150‑1 CTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGAC < 1:1223642/150‑1 CTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTGTATGGAGGGAC > 2:3099229/1‑150 TTTACGGTTCCTGGCCCTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATCGCATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGACTTCTGTAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTG > 2:3725655/1‑150 TACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTC < 1:2612623/150‑1 CGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGGGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCAT > 1:284140/1‑150 CGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCAT < 2:1114542/150‑1 CGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCAT < 1:1773277/150‑1 GGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATT < 2:3511716/150‑1 TTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTC > 2:3163328/1‑150 CTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGGTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAG > 1:40362/1‑150 TGCTGGTCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGAT < 2:2229778/150‑1 GCTGGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATT < 2:938083/150‑1 GGCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGGGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTAAGATTGGg > 2:1692753/1‑149 GCCTTTTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGGCTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAG > 1:980269/1‑150 TTTGCTCACATGGGCGGGGGGGTTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGT < 1:904933/150‑1 TTGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTAGGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTT < 2:1052011/150‑1 TGCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGGTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTG > 2:2098425/1‑150 GCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGT > 1:2021269/1‑150 GCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGT < 2:2760633/150‑1 GCTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTAAGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGTGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGT > 1:2354244/1‑150 CTCACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGGTTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGGCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGTG > 1:3259008/1‑150 ACATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGTGGGC < 2:878403/150‑1 CATGTGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGGTTTCTGAAAGATGTATACAGCCTGAGTCCGGTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGGTTGGGGGAGTTGTGGGCG > 1:1858695/1‑150 GCCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCGGGTTTCGCCACCTCTGACTTGAGCGTCGATTTTTGTGATGCTCGTCAGGGGGGCGGAGCCTATGGAAAAACGCCAGCAACGCGGCCTTTTTACGGTTCCTGGCCTTTTGCTGGCCTTTTGCTCACATGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > pSIJ663_pHT315_araE_xy/5398‑5551‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑catgtGCGGCGGGGCTTGGCGGCTTATTGTATGGCTATGACACGGCAGTGATTTCTGGCGCCATCGGTTTTCTGAAAGATTTATACAGCCTGAGTCCGTTTATGGAGGGACTTGTCATTTCAAGCATTATGATTGGAGGAGTTGTGGGCGTCGG > pSIJ663_pHT315_araE_xy/9889‑10037 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |